Protein–RNA interactions for Protein: Q12505

SKS1, Serine/threonine-protein kinase SKS1, yeastyeast

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKS1Q12505 EMI2YDR516C 1503 nt11.52□□□□□ -0.57
SKS1Q12505 YDL221WYDL221W 552 nt11.44□□□□□ -0.58
SKS1Q12505 YLR281CYLR281C 468 nt11.44□□□□□ -0.58
SKS1Q12505 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.43□□□□□ -0.58
SKS1Q12505 ART5YGR068C 1761 nt11.43□□□□□ -0.58
SKS1Q12505 TIR4YOR009W 1464 nt11.42□□□□□ -0.58
SKS1Q12505 GFD2YCL036W 1701 nt11.41□□□□□ -0.58
SKS1Q12505 YMR090WYMR090W 684 nt11.41□□□□□ -0.58
SKS1Q12505 PET9YBL030C 957 nt11.4□□□□□ -0.58
SKS1Q12505 WHI5YOR083W 888 nt11.4□□□□□ -0.58
SKS1Q12505 YCH1YGR203W 447 nt11.38□□□□□ -0.59
SKS1Q12505 IRC15YPL017C 1500 nt11.36□□□□□ -0.59
SKS1Q12505 YBR220CYBR220C 1683 nt11.34□□□□□ -0.59
SKS1Q12505 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.33□□□□□ -0.6
SKS1Q12505 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.33□□□□□ -0.6
SKS1Q12505 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.33□□□□□ -0.6
SKS1Q12505 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.33□□□□□ -0.6
SKS1Q12505 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.33□□□□□ -0.6
SKS1Q12505 SDH1YKL148C 1923 nt11.31□□□□□ -0.6
SKS1Q12505 BDF1YLR399C 2061 nt11.28□□□□□ -0.6
SKS1Q12505 YJL152WYJL152W 360 nt11.28□□□□□ -0.6
SKS1Q12505 GIS3YLR094C 1509 nt11.26□□□□□ -0.61
SKS1Q12505 YMR057CYMR057C 372 nt11.26□□□□□ -0.61
SKS1Q12505 PUS2YGL063W 1113 nt11.25□□□□□ -0.61
SKS1Q12505 RTS2YOR077W 699 nt11.24□□□□□ -0.61
SKS1Q12505 SCC4YER147C 1875 nt11.22□□□□□ -0.61
SKS1Q12505 CUE1YMR264W 612 nt11.2□□□□□ -0.62
SKS1Q12505 FPS1YLL043W 2010 nt11.18□□□□□ -0.62
SKS1Q12505 IMP2'YIL154C 1041 nt11.17□□□□□ -0.62
SKS1Q12505 DSK2YMR276W 1122 nt11.15□□□□□ -0.62
SKS1Q12505 PAC11YDR488C 1602 nt11.14□□□□□ -0.63
SKS1Q12505 YPR011CYPR011C 981 nt11.13□□□□□ -0.63
SKS1Q12505 TAT1YBR069C 1860 nt11.12□□□□□ -0.63
SKS1Q12505 YLR236CYLR236C 324 nt11.12□□□□□ -0.63
SKS1Q12505 IDH1YNL037C 1083 nt11.1□□□□□ -0.63
SKS1Q12505 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.1□□□□□ -0.63
SKS1Q12505 GBP2YCL011C 1284 nt11.02□□□□□ -0.65
SKS1Q12505 YIL100WYIL100W 354 nt11.01□□□□□ -0.65
SKS1Q12505 FMP45YDL222C 930 nt10.97□□□□□ -0.65
SKS1Q12505 RRD1YIL153W 1182 nt10.97□□□□□ -0.65
SKS1Q12505 ERV46YAL042W 1248 nt10.97□□□□□ -0.65
SKS1Q12505 YSC84YHR016C 1407 nt10.94□□□□□ -0.66
SKS1Q12505 SEC11YIR022W 504 nt10.94□□□□□ -0.66
SKS1Q12505 DED1YOR204W 1815 nt10.93□□□□□ -0.66
SKS1Q12505 TCD2YKL027W 1344 nt10.92□□□□□ -0.66
SKS1Q12505 LPX1YOR084W 1164 nt10.92□□□□□ -0.66
SKS1Q12505 YHL050CYHL050C 2094 nt10.91□□□□□ -0.66
SKS1Q12505 YDR433WYDR433W 441 nt10.91□□□□□ -0.66
SKS1Q12505 RRT12YCR045C 1476 nt10.9□□□□□ -0.66
SKS1Q12505 MXR2YCL033C 507 nt10.88□□□□□ -0.67
SKS1Q12505 PCH2YBR186W 1695 nt10.88□□□□□ -0.67
SKS1Q12505 YKR040CYKR040C 504 nt10.87□□□□□ -0.67
SKS1Q12505 YNL195CYNL195C 786 nt10.87□□□□□ -0.67
SKS1Q12505 FMT1YBL013W 1206 nt10.85□□□□□ -0.67
SKS1Q12505 FMP52YER004W 696 nt10.84□□□□□ -0.67
SKS1Q12505 GUT2YIL155C 1950 nt10.83□□□□□ -0.68
SKS1Q12505 NVJ2YPR091C 2313 nt10.79□□□□□ -0.68
SKS1Q12505 SOR2YDL246C 1074 nt10.78□□□□□ -0.68
SKS1Q12505 SOR1YJR159W 1074 nt10.78□□□□□ -0.68
SKS1Q12505 FRD1YEL047C 1413 nt10.75□□□□□ -0.69
SKS1Q12505 PCM1YEL058W 1674 nt10.7□□□□□ -0.7
SKS1Q12505 PIB2YGL023C 1908 nt10.7□□□□□ -0.7
SKS1Q12505 ADH2YMR303C 1047 nt10.69□□□□□ -0.7
SKS1Q12505 CWP1YKL096W 720 nt10.68□□□□□ -0.7
SKS1Q12505 SPP1YPL138C 1062 nt10.68□□□□□ -0.7
SKS1Q12505 YCL042WYCL042W 360 nt10.68□□□□□ -0.7
SKS1Q12505 RTF1YGL244W 1677 nt10.63□□□□□ -0.71
SKS1Q12505 NCP1YHR042W 2076 nt10.63□□□□□ -0.71
SKS1Q12505 YJL225CYJL225C 5277 nt10.63□□□□□ -0.71
SKS1Q12505 LCB1YMR296C 1677 nt10.61□□□□□ -0.71
SKS1Q12505 SNF6YHL025W 999 nt10.61□□□□□ -0.71
SKS1Q12505 BOP3YNL042W 1191 nt10.61□□□□□ -0.71
SKS1Q12505 YIH1YCR059C 777 nt10.56□□□□□ -0.72
SKS1Q12505 SIM1YIL123W 1431 nt10.54□□□□□ -0.72
SKS1Q12505 BIO4YNR057C 714 nt10.54□□□□□ -0.72
SKS1Q12505 RNQ1YCL028W 1218 nt10.53□□□□□ -0.72
SKS1Q12505 PTK1YKL198C 1989 nt10.49□□□□□ -0.73
SKS1Q12505 RTG1YOL067C 534 nt10.49□□□□□ -0.73
SKS1Q12505 PTH1YHR189W 573 nt10.47□□□□□ -0.73
SKS1Q12505 YLR235CYLR235C 399 nt10.47□□□□□ -0.73
SKS1Q12505 DIC1YLR348C 897 nt10.47□□□□□ -0.73
SKS1Q12505 YLL053CYLL053C 459 nt10.45□□□□□ -0.74
SKS1Q12505 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.43□□□□□ -0.74
SKS1Q12505 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.43□□□□□ -0.74
SKS1Q12505 MRPL8YJL063C 717 nt10.42□□□□□ -0.74
SKS1Q12505 RPM1RPM1 483 nt10.41□□□□□ -0.74
SKS1Q12505 LYS4YDR234W 2082 nt10.4□□□□□ -0.74
SKS1Q12505 YKL030WYKL030W 606 nt10.39□□□□□ -0.75
SKS1Q12505 ERF2YLR246W 1080 nt10.39□□□□□ -0.75
SKS1Q12505 FTR1YER145C 1215 nt10.38□□□□□ -0.75
SKS1Q12505 CRR1YLR213C 1269 nt10.37□□□□□ -0.75
SKS1Q12505 TIM23YNR017W 669 nt10.37□□□□□ -0.75
SKS1Q12505 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.36□□□□□ -0.75
SKS1Q12505 YEL076CYEL076C 651 nt10.36□□□□□ -0.75
SKS1Q12505 YLR464WYLR464W 651 nt10.36□□□□□ -0.75
SKS1Q12505 GAL1YBR020W 1587 nt10.34□□□□□ -0.75
SKS1Q12505 ATF2YGR177C 1608 nt10.33□□□□□ -0.76
SKS1Q12505 ADO1YJR105W 1023 nt10.33□□□□□ -0.76
SKS1Q12505 AQY1YPR192W 918 nt10.31□□□□□ -0.76
SKS1Q12505 TRM5YHR070W 1500 nt10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms