Protein–RNA interactions for Protein: Q12445

POM34, Nucleoporin POM34, yeastyeast

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POM34Q12445 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.08□□□□□ -0.8
POM34Q12445 YJL225CYJL225C 5277 nt10.06□□□□□ -0.8
POM34Q12445 SHU1YHL006C 453 nt10.06□□□□□ -0.8
POM34Q12445 SCC4YER147C 1875 nt10.05□□□□□ -0.8
POM34Q12445 YGR021WYGR021W 873 nt10.05□□□□□ -0.8
POM34Q12445 HOM6YJR139C 1080 nt10.02□□□□□ -0.81
POM34Q12445 GIS3YLR094C 1509 nt10.01□□□□□ -0.81
POM34Q12445 ART5YGR068C 1761 nt10.01□□□□□ -0.81
POM34Q12445 GFD2YCL036W 1701 nt10□□□□□ -0.81
POM34Q12445 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10□□□□□ -0.81
POM34Q12445 PCH2YBR186W 1695 nt9.94□□□□□ -0.82
POM34Q12445 SEC11YIR022W 504 nt9.92□□□□□ -0.82
POM34Q12445 PET9YBL030C 957 nt9.92□□□□□ -0.82
POM34Q12445 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.92□□□□□ -0.82
POM34Q12445 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.92□□□□□ -0.82
POM34Q12445 MNP1YGL068W 585 nt9.91□□□□□ -0.82
POM34Q12445 GUT2YIL155C 1950 nt9.91□□□□□ -0.82
POM34Q12445 RTS2YOR077W 699 nt9.9□□□□□ -0.82
POM34Q12445 NME1NME1 340 nt9.89□□□□□ -0.83
POM34Q12445 RKM5YLR137W 1104 nt9.87□□□□□ -0.83
POM34Q12445 TIR4YOR009W 1464 nt9.86□□□□□ -0.83
POM34Q12445 YSC84YHR016C 1407 nt9.85□□□□□ -0.83
POM34Q12445 YCH1YGR203W 447 nt9.85□□□□□ -0.83
POM34Q12445 CUE1YMR264W 612 nt9.84□□□□□ -0.83
POM34Q12445 YHL050CYHL050C 2094 nt9.81□□□□□ -0.84
POM34Q12445 PIB2YGL023C 1908 nt9.78□□□□□ -0.84
POM34Q12445 YMR057CYMR057C 372 nt9.78□□□□□ -0.84
POM34Q12445 YKL097CYKL097C 411 nt9.76□□□□□ -0.85
POM34Q12445 RRT12YCR045C 1476 nt9.76□□□□□ -0.85
POM34Q12445 NPL3YDR432W 1245 nt9.74□□□□□ -0.85
POM34Q12445 RTF1YGL244W 1677 nt9.68□□□□□ -0.86
POM34Q12445 YIL100WYIL100W 354 nt9.68□□□□□ -0.86
POM34Q12445 YNL195CYNL195C 786 nt9.67□□□□□ -0.86
POM34Q12445 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt9.64□□□□□ -0.87
POM34Q12445 YLR236CYLR236C 324 nt9.64□□□□□ -0.87
POM34Q12445 YJL152WYJL152W 360 nt9.62□□□□□ -0.87
POM34Q12445 BOP3YNL042W 1191 nt9.6□□□□□ -0.87
POM34Q12445 YOL037CYOL037C 354 nt9.6□□□□□ -0.87
POM34Q12445 PTK1YKL198C 1989 nt9.57□□□□□ -0.88
POM34Q12445 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.55□□□□□ -0.88
POM34Q12445 NCP1YHR042W 2076 nt9.54□□□□□ -0.88
POM34Q12445 YOR139CYOR139C 393 nt9.48□□□□□ -0.89
POM34Q12445 WHI5YOR083W 888 nt9.45□□□□□ -0.9
POM34Q12445 YLR281CYLR281C 468 nt9.42□□□□□ -0.9
POM34Q12445 LCB1YMR296C 1677 nt9.41□□□□□ -0.9
POM34Q12445 RRD1YIL153W 1182 nt9.4□□□□□ -0.9
POM34Q12445 IDH1YNL037C 1083 nt9.34□□□□□ -0.91
POM34Q12445 GBP2YCL011C 1284 nt9.34□□□□□ -0.91
POM34Q12445 YFL054CYFL054C 1941 nt9.34□□□□□ -0.91
POM34Q12445 DED1YOR204W 1815 nt9.33□□□□□ -0.92
POM34Q12445 FMP52YER004W 696 nt9.32□□□□□ -0.92
POM34Q12445 UME6YDR207C 2511 nt9.31□□□□□ -0.92
POM34Q12445 PCM1YEL058W 1674 nt9.29□□□□□ -0.92
POM34Q12445 SPT8YLR055C 1809 nt9.28□□□□□ -0.92
POM34Q12445 FMT1YBL013W 1206 nt9.28□□□□□ -0.92
POM34Q12445 TCD2YKL027W 1344 nt9.28□□□□□ -0.92
POM34Q12445 SIM1YIL123W 1431 nt9.24□□□□□ -0.93
POM34Q12445 LYS4YDR234W 2082 nt9.24□□□□□ -0.93
POM34Q12445 IMP2'YIL154C 1041 nt9.22□□□□□ -0.93
POM34Q12445 ADH2YMR303C 1047 nt9.21□□□□□ -0.94
POM34Q12445 PUS2YGL063W 1113 nt9.2□□□□□ -0.94
POM34Q12445 RPM1RPM1 483 nt9.2□□□□□ -0.94
POM34Q12445 DSK2YMR276W 1122 nt9.2□□□□□ -0.94
POM34Q12445 CWP1YKL096W 720 nt9.19□□□□□ -0.94
POM34Q12445 BIO4YNR057C 714 nt9.18□□□□□ -0.94
POM34Q12445 SNF6YHL025W 999 nt9.17□□□□□ -0.94
POM34Q12445 YPR011CYPR011C 981 nt9.17□□□□□ -0.94
POM34Q12445 MXR2YCL033C 507 nt9.16□□□□□ -0.94
POM34Q12445 FMP45YDL222C 930 nt9.15□□□□□ -0.94
POM34Q12445 YDR433WYDR433W 441 nt9.15□□□□□ -0.94
POM34Q12445 SOR2YDL246C 1074 nt9.14□□□□□ -0.95
POM34Q12445 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.14□□□□□ -0.95
POM34Q12445 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.14□□□□□ -0.95
POM34Q12445 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.14□□□□□ -0.95
POM34Q12445 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.14□□□□□ -0.95
POM34Q12445 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.14□□□□□ -0.95
POM34Q12445 YGR139WYGR139W 339 nt9.14□□□□□ -0.95
POM34Q12445 SOR1YJR159W 1074 nt9.14□□□□□ -0.95
POM34Q12445 SWE1YJL187C 2460 nt9.13□□□□□ -0.95
POM34Q12445 ERV46YAL042W 1248 nt9.09□□□□□ -0.95
POM34Q12445 YIH1YCR059C 777 nt9.08□□□□□ -0.96
POM34Q12445 BOR1YNL275W 1731 nt9.08□□□□□ -0.96
POM34Q12445 YCL042WYCL042W 360 nt9.07□□□□□ -0.96
POM34Q12445 ERF2YLR246W 1080 nt9.06□□□□□ -0.96
POM34Q12445 CRR1YLR213C 1269 nt9.05□□□□□ -0.96
POM34Q12445 LPX1YOR084W 1164 nt9.05□□□□□ -0.96
POM34Q12445 FRD1YEL047C 1413 nt9.05□□□□□ -0.96
POM34Q12445 YKR040CYKR040C 504 nt9.04□□□□□ -0.96
POM34Q12445 YLL053CYLL053C 459 nt9.03□□□□□ -0.96
POM34Q12445 RNQ1YCL028W 1218 nt9.02□□□□□ -0.97
POM34Q12445 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt8.98□□□□□ -0.97
POM34Q12445 ATF2YGR177C 1608 nt8.98□□□□□ -0.97
POM34Q12445 FRE6YLL051C 2139 nt8.97□□□□□ -0.97
POM34Q12445 MIC10YCL057C-A 294 nt8.97□□□□□ -0.97
POM34Q12445 HSP60YLR259C 1719 nt8.97□□□□□ -0.97
POM34Q12445 HEM12YDR047W 1089 nt8.96□□□□□ -0.98
POM34Q12445 FTR1YER145C 1215 nt8.93□□□□□ -0.98
POM34Q12445 SNG1YGR197C 1644 nt8.93□□□□□ -0.98
POM34Q12445 YFL067WYFL067W 528 nt8.92□□□□□ -0.98
POM34Q12445 MET8YBR213W 825 nt8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.3 ms