Protein–RNA interactions for Protein: Q12400

TRM10, tRNA (guanine(9)-N1)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM10Q12400 PST2YDR032C 597 nt11.46□□□□□ -0.57
TRM10Q12400 ART5YGR068C 1761 nt11.44□□□□□ -0.58
TRM10Q12400 GFD2YCL036W 1701 nt11.43□□□□□ -0.58
TRM10Q12400 RTS2YOR077W 699 nt11.41□□□□□ -0.58
TRM10Q12400 YSC84YHR016C 1407 nt11.41□□□□□ -0.58
TRM10Q12400 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.35□□□□□ -0.59
TRM10Q12400 PET9YBL030C 957 nt11.33□□□□□ -0.6
TRM10Q12400 YHL050CYHL050C 2094 nt11.31□□□□□ -0.6
TRM10Q12400 YGR021WYGR021W 873 nt11.3□□□□□ -0.6
TRM10Q12400 PIB2YGL023C 1908 nt11.29□□□□□ -0.6
TRM10Q12400 CUE1YMR264W 612 nt11.27□□□□□ -0.61
TRM10Q12400 RRT12YCR045C 1476 nt11.25□□□□□ -0.61
TRM10Q12400 RTF1YGL244W 1677 nt11.24□□□□□ -0.61
TRM10Q12400 YCH1YGR203W 447 nt11.23□□□□□ -0.61
TRM10Q12400 HOM6YJR139C 1080 nt11.22□□□□□ -0.61
TRM10Q12400 YNL195CYNL195C 786 nt11.21□□□□□ -0.61
TRM10Q12400 TIR4YOR009W 1464 nt11.2□□□□□ -0.62
TRM10Q12400 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.17□□□□□ -0.62
TRM10Q12400 YIL100WYIL100W 354 nt11.16□□□□□ -0.62
TRM10Q12400 YMR057CYMR057C 372 nt11.16□□□□□ -0.62
TRM10Q12400 BOP3YNL042W 1191 nt11.16□□□□□ -0.62
TRM10Q12400 SHU1YHL006C 453 nt11.14□□□□□ -0.63
TRM10Q12400 NVJ2YPR091C 2313 nt11.13□□□□□ -0.63
TRM10Q12400 MNP1YGL068W 585 nt11.1□□□□□ -0.63
TRM10Q12400 FPS1YLL043W 2010 nt11.07□□□□□ -0.64
TRM10Q12400 RKM5YLR137W 1104 nt11.06□□□□□ -0.64
TRM10Q12400 YLR236CYLR236C 324 nt11.06□□□□□ -0.64
TRM10Q12400 PTK1YKL198C 1989 nt11.06□□□□□ -0.64
TRM10Q12400 YJL152WYJL152W 360 nt10.96□□□□□ -0.65
TRM10Q12400 NPL3YDR432W 1245 nt10.95□□□□□ -0.66
TRM10Q12400 NCP1YHR042W 2076 nt10.93□□□□□ -0.66
TRM10Q12400 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.92□□□□□ -0.66
TRM10Q12400 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.88□□□□□ -0.67
TRM10Q12400 YFL054CYFL054C 1941 nt10.88□□□□□ -0.67
TRM10Q12400 LCB1YMR296C 1677 nt10.79□□□□□ -0.68
TRM10Q12400 SPT8YLR055C 1809 nt10.78□□□□□ -0.68
TRM10Q12400 YKL097CYKL097C 411 nt10.74□□□□□ -0.69
TRM10Q12400 BOR1YNL275W 1731 nt10.74□□□□□ -0.69
TRM10Q12400 YJL225CYJL225C 5277 nt10.7□□□□□ -0.7
TRM10Q12400 YOL037CYOL037C 354 nt10.69□□□□□ -0.7
TRM10Q12400 RRD1YIL153W 1182 nt10.63□□□□□ -0.71
TRM10Q12400 SIM1YIL123W 1431 nt10.63□□□□□ -0.71
TRM10Q12400 FMP52YER004W 696 nt10.59□□□□□ -0.71
TRM10Q12400 SWE1YJL187C 2460 nt10.58□□□□□ -0.72
TRM10Q12400 PCM1YEL058W 1674 nt10.57□□□□□ -0.72
TRM10Q12400 IDH1YNL037C 1083 nt10.56□□□□□ -0.72
TRM10Q12400 GBP2YCL011C 1284 nt10.56□□□□□ -0.72
TRM10Q12400 LYS4YDR234W 2082 nt10.55□□□□□ -0.72
TRM10Q12400 WHI5YOR083W 888 nt10.55□□□□□ -0.72
TRM10Q12400 TCD2YKL027W 1344 nt10.52□□□□□ -0.73
TRM10Q12400 DED1YOR204W 1815 nt10.51□□□□□ -0.73
TRM10Q12400 HSP60YLR259C 1719 nt10.49□□□□□ -0.73
TRM10Q12400 YLR281CYLR281C 468 nt10.48□□□□□ -0.73
TRM10Q12400 BIO4YNR057C 714 nt10.48□□□□□ -0.73
TRM10Q12400 FMT1YBL013W 1206 nt10.47□□□□□ -0.73
TRM10Q12400 CWP1YKL096W 720 nt10.46□□□□□ -0.73
TRM10Q12400 ADH2YMR303C 1047 nt10.46□□□□□ -0.73
TRM10Q12400 SNF6YHL025W 999 nt10.45□□□□□ -0.74
TRM10Q12400 YOR139CYOR139C 393 nt10.39□□□□□ -0.75
TRM10Q12400 GLK1YCL040W 1503 nt10.38□□□□□ -0.75
TRM10Q12400 UME6YDR207C 2511 nt10.38□□□□□ -0.75
TRM10Q12400 ERF2YLR246W 1080 nt10.37□□□□□ -0.75
TRM10Q12400 CRR1YLR213C 1269 nt10.34□□□□□ -0.75
TRM10Q12400 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.34□□□□□ -0.75
TRM10Q12400 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.34□□□□□ -0.75
TRM10Q12400 YDR433WYDR433W 441 nt10.32□□□□□ -0.76
TRM10Q12400 FUR4YBR021W 1902 nt10.31□□□□□ -0.76
TRM10Q12400 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.31□□□□□ -0.76
TRM10Q12400 IMP2'YIL154C 1041 nt10.3□□□□□ -0.76
TRM10Q12400 MXR2YCL033C 507 nt10.3□□□□□ -0.76
TRM10Q12400 ALG12YNR030W 1656 nt10.3□□□□□ -0.76
TRM10Q12400 SOR2YDL246C 1074 nt10.29□□□□□ -0.76
TRM10Q12400 SOR1YJR159W 1074 nt10.29□□□□□ -0.76
TRM10Q12400 YCL042WYCL042W 360 nt10.29□□□□□ -0.76
TRM10Q12400 YIH1YCR059C 777 nt10.28□□□□□ -0.76
TRM10Q12400 HEM12YDR047W 1089 nt10.27□□□□□ -0.77
TRM10Q12400 YLL053CYLL053C 459 nt10.27□□□□□ -0.77
TRM10Q12400 DSK2YMR276W 1122 nt10.26□□□□□ -0.77
TRM10Q12400 MIC10YCL057C-A 294 nt10.25□□□□□ -0.77
TRM10Q12400 MCH5YOR306C 1566 nt10.24□□□□□ -0.77
TRM10Q12400 CCA1YER168C 1641 nt10.24□□□□□ -0.77
TRM10Q12400 FMP45YDL222C 930 nt10.23□□□□□ -0.77
TRM10Q12400 RAX1YOR301W 1308 nt10.23□□□□□ -0.77
TRM10Q12400 ATF2YGR177C 1608 nt10.22□□□□□ -0.77
TRM10Q12400 PUS2YGL063W 1113 nt10.22□□□□□ -0.77
TRM10Q12400 RNQ1YCL028W 1218 nt10.22□□□□□ -0.77
TRM10Q12400 SNG1YGR197C 1644 nt10.19□□□□□ -0.78
TRM10Q12400 PRP4YPR178W 1398 nt10.19□□□□□ -0.78
TRM10Q12400 YFL067WYFL067W 528 nt10.18□□□□□ -0.78
TRM10Q12400 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.16□□□□□ -0.78
TRM10Q12400 YEL076CYEL076C 651 nt10.16□□□□□ -0.78
TRM10Q12400 YLR464WYLR464W 651 nt10.16□□□□□ -0.78
TRM10Q12400 FTR1YER145C 1215 nt10.15□□□□□ -0.78
TRM10Q12400 YPR011CYPR011C 981 nt10.15□□□□□ -0.78
TRM10Q12400 AAC1YMR056C 930 nt10.14□□□□□ -0.79
TRM10Q12400 FRD1YEL047C 1413 nt10.14□□□□□ -0.79
TRM10Q12400 DDR2YOL052C-A 186 nt10.13□□□□□ -0.79
TRM10Q12400 TRM5YHR070W 1500 nt10.12□□□□□ -0.79
TRM10Q12400 DPS1YLL018C 1674 nt10.12□□□□□ -0.79
TRM10Q12400 ERV46YAL042W 1248 nt10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms