Protein–RNA interactions for Protein: Q12297

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF3Q12297 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.97□□□□□ -0.49
TAF3Q12297 Q0182Q0182 405 nt11.95□□□□□ -0.5
TAF3Q12297 GFD2YCL036W 1701 nt11.91□□□□□ -0.5
TAF3Q12297 RTS2YOR077W 699 nt11.9□□□□□ -0.5
TAF3Q12297 PIB2YGL023C 1908 nt11.9□□□□□ -0.51
TAF3Q12297 ART5YGR068C 1761 nt11.9□□□□□ -0.51
TAF3Q12297 LSM3YLR438C-A 270 nt11.89□□□□□ -0.51
TAF3Q12297 RTF1YGL244W 1677 nt11.87□□□□□ -0.51
TAF3Q12297 WWM1YFL010C 636 nt11.86□□□□□ -0.51
TAF3Q12297 YHL050CYHL050C 2094 nt11.86□□□□□ -0.51
TAF3Q12297 RRT12YCR045C 1476 nt11.8□□□□□ -0.52
TAF3Q12297 PET9YBL030C 957 nt11.78□□□□□ -0.52
TAF3Q12297 BOP3YNL042W 1191 nt11.77□□□□□ -0.53
TAF3Q12297 YNL195CYNL195C 786 nt11.77□□□□□ -0.53
TAF3Q12297 CUE1YMR264W 612 nt11.75□□□□□ -0.53
TAF3Q12297 YCH1YGR203W 447 nt11.68□□□□□ -0.54
TAF3Q12297 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.67□□□□□ -0.54
TAF3Q12297 YIL100WYIL100W 354 nt11.67□□□□□ -0.54
TAF3Q12297 PTK1YKL198C 1989 nt11.65□□□□□ -0.54
TAF3Q12297 TIR4YOR009W 1464 nt11.61□□□□□ -0.55
TAF3Q12297 YGR021WYGR021W 873 nt11.59□□□□□ -0.55
TAF3Q12297 YMR057CYMR057C 372 nt11.59□□□□□ -0.55
TAF3Q12297 PST2YDR032C 597 nt11.58□□□□□ -0.56
TAF3Q12297 YLR236CYLR236C 324 nt11.52□□□□□ -0.57
TAF3Q12297 HOM6YJR139C 1080 nt11.48□□□□□ -0.57
TAF3Q12297 YFL054CYFL054C 1941 nt11.48□□□□□ -0.57
TAF3Q12297 BOR1YNL275W 1731 nt11.46□□□□□ -0.57
TAF3Q12297 NCP1YHR042W 2076 nt11.45□□□□□ -0.58
TAF3Q12297 MOT3YMR070W 1473 nt11.39□□□□□ -0.59
TAF3Q12297 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.37□□□□□ -0.59
TAF3Q12297 SPT8YLR055C 1809 nt11.37□□□□□ -0.59
TAF3Q12297 UME6YDR207C 2511 nt11.37□□□□□ -0.59
TAF3Q12297 MNP1YGL068W 585 nt11.36□□□□□ -0.59
TAF3Q12297 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.33□□□□□ -0.6
TAF3Q12297 RKM5YLR137W 1104 nt11.32□□□□□ -0.6
TAF3Q12297 YJL152WYJL152W 360 nt11.31□□□□□ -0.6
TAF3Q12297 SHU1YHL006C 453 nt11.29□□□□□ -0.6
TAF3Q12297 LCB1YMR296C 1677 nt11.27□□□□□ -0.6
TAF3Q12297 NPL3YDR432W 1245 nt11.25□□□□□ -0.61
TAF3Q12297 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.19□□□□□ -0.62
TAF3Q12297 SWE1YJL187C 2460 nt11.15□□□□□ -0.62
TAF3Q12297 HSP60YLR259C 1719 nt11.13□□□□□ -0.63
TAF3Q12297 YJL225CYJL225C 5277 nt11.09□□□□□ -0.63
TAF3Q12297 SIM1YIL123W 1431 nt11.08□□□□□ -0.64
TAF3Q12297 LYS4YDR234W 2082 nt11□□□□□ -0.65
TAF3Q12297 GLK1YCL040W 1503 nt11□□□□□ -0.65
TAF3Q12297 ALG12YNR030W 1656 nt10.98□□□□□ -0.65
TAF3Q12297 PCM1YEL058W 1674 nt10.98□□□□□ -0.65
TAF3Q12297 FMP52YER004W 696 nt10.97□□□□□ -0.65
TAF3Q12297 RRD1YIL153W 1182 nt10.97□□□□□ -0.65
TAF3Q12297 MCH5YOR306C 1566 nt10.97□□□□□ -0.65
TAF3Q12297 BIO4YNR057C 714 nt10.89□□□□□ -0.67
TAF3Q12297 FUR4YBR021W 1902 nt10.88□□□□□ -0.67
TAF3Q12297 YOL037CYOL037C 354 nt10.88□□□□□ -0.67
TAF3Q12297 RPM1RPM1 483 nt10.87□□□□□ -0.67
TAF3Q12297 IDH1YNL037C 1083 nt10.86□□□□□ -0.67
TAF3Q12297 GBP2YCL011C 1284 nt10.86□□□□□ -0.67
TAF3Q12297 SNF6YHL025W 999 nt10.85□□□□□ -0.67
TAF3Q12297 TCD2YKL027W 1344 nt10.84□□□□□ -0.67
TAF3Q12297 DED1YOR204W 1815 nt10.82□□□□□ -0.68
TAF3Q12297 CWP1YKL096W 720 nt10.81□□□□□ -0.68
TAF3Q12297 ERF2YLR246W 1080 nt10.81□□□□□ -0.68
TAF3Q12297 ADH2YMR303C 1047 nt10.81□□□□□ -0.68
TAF3Q12297 YKL097CYKL097C 411 nt10.8□□□□□ -0.68
TAF3Q12297 FMT1YBL013W 1206 nt10.79□□□□□ -0.68
TAF3Q12297 DSK2YMR276W 1122 nt10.79□□□□□ -0.68
TAF3Q12297 PRP4YPR178W 1398 nt10.78□□□□□ -0.68
TAF3Q12297 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.77□□□□□ -0.69
TAF3Q12297 CRR1YLR213C 1269 nt10.76□□□□□ -0.69
TAF3Q12297 WHI5YOR083W 888 nt10.76□□□□□ -0.69
TAF3Q12297 AAC1YMR056C 930 nt10.75□□□□□ -0.69
TAF3Q12297 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.74□□□□□ -0.69
TAF3Q12297 YEL076CYEL076C 651 nt10.74□□□□□ -0.69
TAF3Q12297 YLR464WYLR464W 651 nt10.74□□□□□ -0.69
TAF3Q12297 CCA1YER168C 1641 nt10.73□□□□□ -0.69
TAF3Q12297 NAR1YNL240C 1476 nt10.72□□□□□ -0.69
TAF3Q12297 DPS1YLL018C 1674 nt10.71□□□□□ -0.69
TAF3Q12297 RAX1YOR301W 1308 nt10.71□□□□□ -0.69
TAF3Q12297 HEM12YDR047W 1089 nt10.7□□□□□ -0.7
TAF3Q12297 BMT6YLR063W 1098 nt10.68□□□□□ -0.7
TAF3Q12297 MIC10YCL057C-A 294 nt10.67□□□□□ -0.7
TAF3Q12297 YLR281CYLR281C 468 nt10.65□□□□□ -0.7
TAF3Q12297 YLL053CYLL053C 459 nt10.64□□□□□ -0.71
TAF3Q12297 YIH1YCR059C 777 nt10.63□□□□□ -0.71
TAF3Q12297 YCL042WYCL042W 360 nt10.62□□□□□ -0.71
TAF3Q12297 ATF2YGR177C 1608 nt10.61□□□□□ -0.71
TAF3Q12297 SNG1YGR197C 1644 nt10.6□□□□□ -0.71
TAF3Q12297 SOR2YDL246C 1074 nt10.6□□□□□ -0.71
TAF3Q12297 SOR1YJR159W 1074 nt10.6□□□□□ -0.71
TAF3Q12297 YKR005CYKR005C 1578 nt10.59□□□□□ -0.71
TAF3Q12297 YDR433WYDR433W 441 nt10.58□□□□□ -0.72
TAF3Q12297 YFL067WYFL067W 528 nt10.58□□□□□ -0.72
TAF3Q12297 RNQ1YCL028W 1218 nt10.57□□□□□ -0.72
TAF3Q12297 BIO5YNR056C 1686 nt10.57□□□□□ -0.72
TAF3Q12297 MXR2YCL033C 507 nt10.55□□□□□ -0.72
TAF3Q12297 IMP2'YIL154C 1041 nt10.53□□□□□ -0.72
TAF3Q12297 SNF1YDR477W 1902 nt10.52□□□□□ -0.73
TAF3Q12297 FTR1YER145C 1215 nt10.51□□□□□ -0.73
TAF3Q12297 DUS1YML080W 1272 nt10.51□□□□□ -0.73
TAF3Q12297 DDR2YOL052C-A 186 nt10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13 ms