Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 ART5YGR068C 1761 nt12.18□□□□□ -0.46
UBX3Q12229 GFD2YCL036W 1701 nt12.15□□□□□ -0.46
UBX3Q12229 YMR090WYMR090W 684 nt12.15□□□□□ -0.46
UBX3Q12229 TIR4YOR009W 1464 nt12.13□□□□□ -0.47
UBX3Q12229 YBR220CYBR220C 1683 nt12.13□□□□□ -0.47
UBX3Q12229 IRC15YPL017C 1500 nt12.11□□□□□ -0.47
UBX3Q12229 BDF1YLR399C 2061 nt12.1□□□□□ -0.47
UBX3Q12229 Q0182Q0182 405 nt12.1□□□□□ -0.47
UBX3Q12229 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.09□□□□□ -0.47
UBX3Q12229 PET9YBL030C 957 nt12.09□□□□□ -0.47
UBX3Q12229 SDH1YKL148C 1923 nt12.07□□□□□ -0.48
UBX3Q12229 YLR281CYLR281C 468 nt12.05□□□□□ -0.48
UBX3Q12229 YCH1YGR203W 447 nt12.04□□□□□ -0.48
UBX3Q12229 WHI5YOR083W 888 nt12.03□□□□□ -0.48
UBX3Q12229 GIS3YLR094C 1509 nt12.01□□□□□ -0.49
UBX3Q12229 RTS2YOR077W 699 nt12□□□□□ -0.49
UBX3Q12229 YMR057CYMR057C 372 nt11.99□□□□□ -0.49
UBX3Q12229 YJL152WYJL152W 360 nt11.98□□□□□ -0.49
UBX3Q12229 SCC4YER147C 1875 nt11.97□□□□□ -0.49
UBX3Q12229 TAT1YBR069C 1860 nt11.93□□□□□ -0.5
UBX3Q12229 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.91□□□□□ -0.5
UBX3Q12229 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.91□□□□□ -0.5
UBX3Q12229 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.91□□□□□ -0.5
UBX3Q12229 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.91□□□□□ -0.5
UBX3Q12229 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.91□□□□□ -0.5
UBX3Q12229 CUE1YMR264W 612 nt11.89□□□□□ -0.51
UBX3Q12229 FPS1YLL043W 2010 nt11.89□□□□□ -0.51
UBX3Q12229 PUS2YGL063W 1113 nt11.86□□□□□ -0.51
UBX3Q12229 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.79□□□□□ -0.52
UBX3Q12229 YPR011CYPR011C 981 nt11.76□□□□□ -0.53
UBX3Q12229 YLR236CYLR236C 324 nt11.75□□□□□ -0.53
UBX3Q12229 DSK2YMR276W 1122 nt11.75□□□□□ -0.53
UBX3Q12229 IMP2'YIL154C 1041 nt11.74□□□□□ -0.53
UBX3Q12229 IDH1YNL037C 1083 nt11.72□□□□□ -0.53
UBX3Q12229 YSC84YHR016C 1407 nt11.7□□□□□ -0.54
UBX3Q12229 YIL100WYIL100W 354 nt11.7□□□□□ -0.54
UBX3Q12229 YHL050CYHL050C 2094 nt11.67□□□□□ -0.54
UBX3Q12229 GBP2YCL011C 1284 nt11.67□□□□□ -0.54
UBX3Q12229 RRT12YCR045C 1476 nt11.66□□□□□ -0.54
UBX3Q12229 SEC11YIR022W 504 nt11.66□□□□□ -0.54
UBX3Q12229 PCH2YBR186W 1695 nt11.63□□□□□ -0.55
UBX3Q12229 RRD1YIL153W 1182 nt11.63□□□□□ -0.55
UBX3Q12229 DED1YOR204W 1815 nt11.6□□□□□ -0.55
UBX3Q12229 FMP45YDL222C 930 nt11.59□□□□□ -0.55
UBX3Q12229 GUT2YIL155C 1950 nt11.59□□□□□ -0.55
UBX3Q12229 YNL195CYNL195C 786 nt11.58□□□□□ -0.56
UBX3Q12229 ERV46YAL042W 1248 nt11.56□□□□□ -0.56
UBX3Q12229 TCD2YKL027W 1344 nt11.56□□□□□ -0.56
UBX3Q12229 YDR433WYDR433W 441 nt11.55□□□□□ -0.56
UBX3Q12229 LPX1YOR084W 1164 nt11.55□□□□□ -0.56
UBX3Q12229 MXR2YCL033C 507 nt11.54□□□□□ -0.56
UBX3Q12229 FMT1YBL013W 1206 nt11.51□□□□□ -0.57
UBX3Q12229 PIB2YGL023C 1908 nt11.47□□□□□ -0.57
UBX3Q12229 YKR040CYKR040C 504 nt11.47□□□□□ -0.57
UBX3Q12229 FMP52YER004W 696 nt11.46□□□□□ -0.57
UBX3Q12229 SOR2YDL246C 1074 nt11.38□□□□□ -0.59
UBX3Q12229 SOR1YJR159W 1074 nt11.38□□□□□ -0.59
UBX3Q12229 MOT3YMR070W 1473 nt11.38□□□□□ -0.59
UBX3Q12229 PCM1YEL058W 1674 nt11.37□□□□□ -0.59
UBX3Q12229 RTF1YGL244W 1677 nt11.37□□□□□ -0.59
UBX3Q12229 FRD1YEL047C 1413 nt11.37□□□□□ -0.59
UBX3Q12229 NCP1YHR042W 2076 nt11.37□□□□□ -0.59
UBX3Q12229 ADH2YMR303C 1047 nt11.36□□□□□ -0.59
UBX3Q12229 CWP1YKL096W 720 nt11.34□□□□□ -0.59
UBX3Q12229 LCB1YMR296C 1677 nt11.33□□□□□ -0.6
UBX3Q12229 BOP3YNL042W 1191 nt11.32□□□□□ -0.6
UBX3Q12229 YCL042WYCL042W 360 nt11.31□□□□□ -0.6
UBX3Q12229 SPP1YPL138C 1062 nt11.29□□□□□ -0.6
UBX3Q12229 SNF6YHL025W 999 nt11.26□□□□□ -0.61
UBX3Q12229 PTK1YKL198C 1989 nt11.25□□□□□ -0.61
UBX3Q12229 SIM1YIL123W 1431 nt11.22□□□□□ -0.61
UBX3Q12229 BIO4YNR057C 714 nt11.2□□□□□ -0.62
UBX3Q12229 YIH1YCR059C 777 nt11.18□□□□□ -0.62
UBX3Q12229 RNQ1YCL028W 1218 nt11.14□□□□□ -0.63
UBX3Q12229 LYS4YDR234W 2082 nt11.11□□□□□ -0.63
UBX3Q12229 PTH1YHR189W 573 nt11.1□□□□□ -0.63
UBX3Q12229 YLL053CYLL053C 459 nt11.09□□□□□ -0.63
UBX3Q12229 DIC1YLR348C 897 nt11.09□□□□□ -0.63
UBX3Q12229 YLR235CYLR235C 399 nt11.04□□□□□ -0.64
UBX3Q12229 RTG1YOL067C 534 nt11.02□□□□□ -0.65
UBX3Q12229 FTR1YER145C 1215 nt11.01□□□□□ -0.65
UBX3Q12229 ERF2YLR246W 1080 nt11.01□□□□□ -0.65
UBX3Q12229 CRR1YLR213C 1269 nt11□□□□□ -0.65
UBX3Q12229 YFL054CYFL054C 1941 nt10.99□□□□□ -0.65
UBX3Q12229 ATF2YGR177C 1608 nt10.98□□□□□ -0.65
UBX3Q12229 TIM23YNR017W 669 nt10.97□□□□□ -0.65
UBX3Q12229 GAL1YBR020W 1587 nt10.97□□□□□ -0.65
UBX3Q12229 YKL030WYKL030W 606 nt10.95□□□□□ -0.66
UBX3Q12229 TRM5YHR070W 1500 nt10.94□□□□□ -0.66
UBX3Q12229 PAC11YDR488C 1602 nt10.94□□□□□ -0.66
UBX3Q12229 SPT8YLR055C 1809 nt10.91□□□□□ -0.66
UBX3Q12229 YLR179CYLR179C 606 nt10.91□□□□□ -0.66
UBX3Q12229 YFL067WYFL067W 528 nt10.9□□□□□ -0.66
UBX3Q12229 MIC10YCL057C-A 294 nt10.9□□□□□ -0.66
UBX3Q12229 AQY1YPR192W 918 nt10.88□□□□□ -0.67
UBX3Q12229 SNG1YGR197C 1644 nt10.87□□□□□ -0.67
UBX3Q12229 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.87□□□□□ -0.67
UBX3Q12229 YEL076CYEL076C 651 nt10.87□□□□□ -0.67
UBX3Q12229 YLR464WYLR464W 651 nt10.87□□□□□ -0.67
UBX3Q12229 WSC2YNL283C 1512 nt10.87□□□□□ -0.67
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