Protein–RNA interactions for Protein: Q12196

RIO1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIO1Q12196 SCC4YER147C 1875 nt12.91□□□□□ -0.34
RIO1Q12196 MNP1YGL068W 585 nt12.9□□□□□ -0.34
RIO1Q12196 ART5YGR068C 1761 nt12.89□□□□□ -0.35
RIO1Q12196 GFD2YCL036W 1701 nt12.88□□□□□ -0.35
RIO1Q12196 GIS3YLR094C 1509 nt12.85□□□□□ -0.35
RIO1Q12196 RTS2YOR077W 699 nt12.83□□□□□ -0.36
RIO1Q12196 RKM5YLR137W 1104 nt12.82□□□□□ -0.36
RIO1Q12196 YKL097CYKL097C 411 nt12.8□□□□□ -0.36
RIO1Q12196 PET9YBL030C 957 nt12.8□□□□□ -0.36
RIO1Q12196 YCH1YGR203W 447 nt12.74□□□□□ -0.37
RIO1Q12196 SEC11YIR022W 504 nt12.74□□□□□ -0.37
RIO1Q12196 TIR4YOR009W 1464 nt12.72□□□□□ -0.37
RIO1Q12196 PCH2YBR186W 1695 nt12.7□□□□□ -0.38
RIO1Q12196 CUE1YMR264W 612 nt12.67□□□□□ -0.38
RIO1Q12196 YSC84YHR016C 1407 nt12.65□□□□□ -0.38
RIO1Q12196 YMR057CYMR057C 372 nt12.64□□□□□ -0.39
RIO1Q12196 GUT2YIL155C 1950 nt12.63□□□□□ -0.39
RIO1Q12196 YIL100WYIL100W 354 nt12.58□□□□□ -0.4
RIO1Q12196 YJL152WYJL152W 360 nt12.57□□□□□ -0.4
RIO1Q12196 PAC11YDR488C 1602 nt12.57□□□□□ -0.4
RIO1Q12196 YNL195CYNL195C 786 nt12.56□□□□□ -0.4
RIO1Q12196 NPL3YDR432W 1245 nt12.55□□□□□ -0.4
RIO1Q12196 NVJ2YPR091C 2313 nt12.54□□□□□ -0.4
RIO1Q12196 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.53□□□□□ -0.4
RIO1Q12196 YOL037CYOL037C 354 nt12.53□□□□□ -0.4
RIO1Q12196 YHL050CYHL050C 2094 nt12.53□□□□□ -0.4
RIO1Q12196 RRT12YCR045C 1476 nt12.52□□□□□ -0.41
RIO1Q12196 FPS1YLL043W 2010 nt12.5□□□□□ -0.41
RIO1Q12196 YLR236CYLR236C 324 nt12.49□□□□□ -0.41
RIO1Q12196 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.47□□□□□ -0.41
RIO1Q12196 RTF1YGL244W 1677 nt12.39□□□□□ -0.43
RIO1Q12196 PIB2YGL023C 1908 nt12.37□□□□□ -0.43
RIO1Q12196 BOP3YNL042W 1191 nt12.34□□□□□ -0.43
RIO1Q12196 YOR139CYOR139C 393 nt12.31□□□□□ -0.44
RIO1Q12196 WHI5YOR083W 888 nt12.28□□□□□ -0.44
RIO1Q12196 YLR281CYLR281C 468 nt12.23□□□□□ -0.45
RIO1Q12196 IDH1YNL037C 1083 nt12.2□□□□□ -0.46
RIO1Q12196 PTK1YKL198C 1989 nt12.16□□□□□ -0.46
RIO1Q12196 GBP2YCL011C 1284 nt12.15□□□□□ -0.46
RIO1Q12196 NCP1YHR042W 2076 nt12.11□□□□□ -0.47
RIO1Q12196 RRD1YIL153W 1182 nt12.11□□□□□ -0.47
RIO1Q12196 TCD2YKL027W 1344 nt12.08□□□□□ -0.48
RIO1Q12196 LCB1YMR296C 1677 nt12.06□□□□□ -0.48
RIO1Q12196 FMP52YER004W 696 nt12.05□□□□□ -0.48
RIO1Q12196 IMP2'YIL154C 1041 nt12.03□□□□□ -0.48
RIO1Q12196 PUS2YGL063W 1113 nt12.01□□□□□ -0.49
RIO1Q12196 YFL054CYFL054C 1941 nt12□□□□□ -0.49
RIO1Q12196 DED1YOR204W 1815 nt12□□□□□ -0.49
RIO1Q12196 DSK2YMR276W 1122 nt11.99□□□□□ -0.49
RIO1Q12196 PCM1YEL058W 1674 nt11.98□□□□□ -0.49
RIO1Q12196 SIM1YIL123W 1431 nt11.97□□□□□ -0.49
RIO1Q12196 YDR433WYDR433W 441 nt11.96□□□□□ -0.49
RIO1Q12196 CWP1YKL096W 720 nt11.92□□□□□ -0.5
RIO1Q12196 FMT1YBL013W 1206 nt11.92□□□□□ -0.5
RIO1Q12196 SNF6YHL025W 999 nt11.9□□□□□ -0.5
RIO1Q12196 ADH2YMR303C 1047 nt11.89□□□□□ -0.51
RIO1Q12196 MXR2YCL033C 507 nt11.88□□□□□ -0.51
RIO1Q12196 SPT8YLR055C 1809 nt11.87□□□□□ -0.51
RIO1Q12196 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.86□□□□□ -0.51
RIO1Q12196 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.86□□□□□ -0.51
RIO1Q12196 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.86□□□□□ -0.51
RIO1Q12196 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.86□□□□□ -0.51
RIO1Q12196 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.86□□□□□ -0.51
RIO1Q12196 FMP45YDL222C 930 nt11.85□□□□□ -0.51
RIO1Q12196 BIO4YNR057C 714 nt11.84□□□□□ -0.51
RIO1Q12196 YCL042WYCL042W 360 nt11.84□□□□□ -0.51
RIO1Q12196 YPR011CYPR011C 981 nt11.82□□□□□ -0.52
RIO1Q12196 SOR2YDL246C 1074 nt11.8□□□□□ -0.52
RIO1Q12196 SOR1YJR159W 1074 nt11.8□□□□□ -0.52
RIO1Q12196 LYS4YDR234W 2082 nt11.77□□□□□ -0.52
RIO1Q12196 ERV46YAL042W 1248 nt11.76□□□□□ -0.53
RIO1Q12196 LPX1YOR084W 1164 nt11.76□□□□□ -0.53
RIO1Q12196 YKR040CYKR040C 504 nt11.74□□□□□ -0.53
RIO1Q12196 ERF2YLR246W 1080 nt11.71□□□□□ -0.53
RIO1Q12196 YIH1YCR059C 777 nt11.69□□□□□ -0.54
RIO1Q12196 SWE1YJL187C 2460 nt11.68□□□□□ -0.54
RIO1Q12196 FRD1YEL047C 1413 nt11.68□□□□□ -0.54
RIO1Q12196 YLL053CYLL053C 459 nt11.66□□□□□ -0.54
RIO1Q12196 CRR1YLR213C 1269 nt11.66□□□□□ -0.54
RIO1Q12196 RNQ1YCL028W 1218 nt11.65□□□□□ -0.54
RIO1Q12196 BOR1YNL275W 1731 nt11.63□□□□□ -0.55
RIO1Q12196 YJL225CYJL225C 5277 nt11.63□□□□□ -0.55
RIO1Q12196 HEM12YDR047W 1089 nt11.58□□□□□ -0.56
RIO1Q12196 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.56□□□□□ -0.56
RIO1Q12196 DIC1YLR348C 897 nt11.56□□□□□ -0.56
RIO1Q12196 ATF2YGR177C 1608 nt11.56□□□□□ -0.56
RIO1Q12196 FTR1YER145C 1215 nt11.54□□□□□ -0.56
RIO1Q12196 YFL067WYFL067W 528 nt11.54□□□□□ -0.56
RIO1Q12196 MIC10YCL057C-A 294 nt11.53□□□□□ -0.56
RIO1Q12196 UME6YDR207C 2511 nt11.51□□□□□ -0.57
RIO1Q12196 TRM5YHR070W 1500 nt11.5□□□□□ -0.57
RIO1Q12196 SNG1YGR197C 1644 nt11.5□□□□□ -0.57
RIO1Q12196 DDR2YOL052C-A 186 nt11.5□□□□□ -0.57
RIO1Q12196 GAL1YBR020W 1587 nt11.5□□□□□ -0.57
RIO1Q12196 RAX1YOR301W 1308 nt11.49□□□□□ -0.57
RIO1Q12196 HSP60YLR259C 1719 nt11.45□□□□□ -0.58
RIO1Q12196 PTH1YHR189W 573 nt11.43□□□□□ -0.58
RIO1Q12196 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.41□□□□□ -0.58
RIO1Q12196 CCA1YER168C 1641 nt11.41□□□□□ -0.58
RIO1Q12196 AQY1YPR192W 918 nt11.4□□□□□ -0.58
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