Protein–RNA interactions for Protein: Q12143

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1, yeastyeast

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSL1Q12143 IRC15YPL017C 1500 nt11.99□□□□□ -0.49
NSL1Q12143 ART5YGR068C 1761 nt11.97□□□□□ -0.49
NSL1Q12143 GFD2YCL036W 1701 nt11.95□□□□□ -0.5
NSL1Q12143 MNP1YGL068W 585 nt11.95□□□□□ -0.5
NSL1Q12143 GIS3YLR094C 1509 nt11.93□□□□□ -0.5
NSL1Q12143 PET9YBL030C 957 nt11.9□□□□□ -0.5
NSL1Q12143 RKM5YLR137W 1104 nt11.89□□□□□ -0.51
NSL1Q12143 YKL097CYKL097C 411 nt11.88□□□□□ -0.51
NSL1Q12143 RTS2YOR077W 699 nt11.88□□□□□ -0.51
NSL1Q12143 YCH1YGR203W 447 nt11.85□□□□□ -0.51
NSL1Q12143 SEC11YIR022W 504 nt11.84□□□□□ -0.51
NSL1Q12143 PCH2YBR186W 1695 nt11.81□□□□□ -0.52
NSL1Q12143 TIR4YOR009W 1464 nt11.8□□□□□ -0.52
NSL1Q12143 CUE1YMR264W 612 nt11.77□□□□□ -0.53
NSL1Q12143 YSC84YHR016C 1407 nt11.74□□□□□ -0.53
NSL1Q12143 GUT2YIL155C 1950 nt11.74□□□□□ -0.53
NSL1Q12143 YMR057CYMR057C 372 nt11.73□□□□□ -0.53
NSL1Q12143 YIL100WYIL100W 354 nt11.67□□□□□ -0.54
NSL1Q12143 YNL195CYNL195C 786 nt11.66□□□□□ -0.54
NSL1Q12143 YJL152WYJL152W 360 nt11.65□□□□□ -0.54
NSL1Q12143 YHL050CYHL050C 2094 nt11.64□□□□□ -0.55
NSL1Q12143 NPL3YDR432W 1245 nt11.64□□□□□ -0.55
NSL1Q12143 YOL037CYOL037C 354 nt11.63□□□□□ -0.55
NSL1Q12143 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.62□□□□□ -0.55
NSL1Q12143 RRT12YCR045C 1476 nt11.61□□□□□ -0.55
NSL1Q12143 FPS1YLL043W 2010 nt11.6□□□□□ -0.55
NSL1Q12143 YLR236CYLR236C 324 nt11.6□□□□□ -0.55
NSL1Q12143 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.57□□□□□ -0.56
NSL1Q12143 PAC11YDR488C 1602 nt11.54□□□□□ -0.56
NSL1Q12143 RTF1YGL244W 1677 nt11.52□□□□□ -0.57
NSL1Q12143 PIB2YGL023C 1908 nt11.5□□□□□ -0.57
NSL1Q12143 BOP3YNL042W 1191 nt11.47□□□□□ -0.57
NSL1Q12143 YOR139CYOR139C 393 nt11.42□□□□□ -0.58
NSL1Q12143 WHI5YOR083W 888 nt11.39□□□□□ -0.59
NSL1Q12143 YLR281CYLR281C 468 nt11.35□□□□□ -0.59
NSL1Q12143 IDH1YNL037C 1083 nt11.33□□□□□ -0.6
NSL1Q12143 PTK1YKL198C 1989 nt11.3□□□□□ -0.6
NSL1Q12143 GBP2YCL011C 1284 nt11.28□□□□□ -0.6
NSL1Q12143 NCP1YHR042W 2076 nt11.27□□□□□ -0.61
NSL1Q12143 RRD1YIL153W 1182 nt11.24□□□□□ -0.61
NSL1Q12143 TCD2YKL027W 1344 nt11.21□□□□□ -0.61
NSL1Q12143 NVJ2YPR091C 2313 nt11.2□□□□□ -0.62
NSL1Q12143 FMP52YER004W 696 nt11.2□□□□□ -0.62
NSL1Q12143 LCB1YMR296C 1677 nt11.19□□□□□ -0.62
NSL1Q12143 IMP2'YIL154C 1041 nt11.18□□□□□ -0.62
NSL1Q12143 YJL225CYJL225C 5277 nt11.16□□□□□ -0.62
NSL1Q12143 YFL054CYFL054C 1941 nt11.14□□□□□ -0.63
NSL1Q12143 PUS2YGL063W 1113 nt11.14□□□□□ -0.63
NSL1Q12143 DED1YOR204W 1815 nt11.14□□□□□ -0.63
NSL1Q12143 DSK2YMR276W 1122 nt11.13□□□□□ -0.63
NSL1Q12143 PCM1YEL058W 1674 nt11.12□□□□□ -0.63
NSL1Q12143 SIM1YIL123W 1431 nt11.11□□□□□ -0.63
NSL1Q12143 YDR433WYDR433W 441 nt11.09□□□□□ -0.63
NSL1Q12143 FMT1YBL013W 1206 nt11.06□□□□□ -0.64
NSL1Q12143 CWP1YKL096W 720 nt11.05□□□□□ -0.64
NSL1Q12143 SNF6YHL025W 999 nt11.04□□□□□ -0.64
NSL1Q12143 SPT8YLR055C 1809 nt11.04□□□□□ -0.64
NSL1Q12143 ADH2YMR303C 1047 nt11.03□□□□□ -0.64
NSL1Q12143 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.01□□□□□ -0.65
NSL1Q12143 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.01□□□□□ -0.65
NSL1Q12143 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.01□□□□□ -0.65
NSL1Q12143 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.01□□□□□ -0.65
NSL1Q12143 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.01□□□□□ -0.65
NSL1Q12143 MXR2YCL033C 507 nt11□□□□□ -0.65
NSL1Q12143 FMP45YDL222C 930 nt10.99□□□□□ -0.65
NSL1Q12143 BIO4YNR057C 714 nt10.99□□□□□ -0.65
NSL1Q12143 YCL042WYCL042W 360 nt10.99□□□□□ -0.65
NSL1Q12143 SOR2YDL246C 1074 nt10.96□□□□□ -0.65
NSL1Q12143 SOR1YJR159W 1074 nt10.96□□□□□ -0.65
NSL1Q12143 YPR011CYPR011C 981 nt10.95□□□□□ -0.66
NSL1Q12143 LYS4YDR234W 2082 nt10.95□□□□□ -0.66
NSL1Q12143 ERV46YAL042W 1248 nt10.92□□□□□ -0.66
NSL1Q12143 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.91□□□□□ -0.66
NSL1Q12143 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.91□□□□□ -0.66
NSL1Q12143 YKR040CYKR040C 504 nt10.9□□□□□ -0.66
NSL1Q12143 LPX1YOR084W 1164 nt10.9□□□□□ -0.66
NSL1Q12143 ERF2YLR246W 1080 nt10.88□□□□□ -0.67
NSL1Q12143 YIH1YCR059C 777 nt10.85□□□□□ -0.67
NSL1Q12143 SWE1YJL187C 2460 nt10.84□□□□□ -0.67
NSL1Q12143 FRD1YEL047C 1413 nt10.84□□□□□ -0.67
NSL1Q12143 CRR1YLR213C 1269 nt10.82□□□□□ -0.68
NSL1Q12143 RNQ1YCL028W 1218 nt10.82□□□□□ -0.68
NSL1Q12143 BOR1YNL275W 1731 nt10.81□□□□□ -0.68
NSL1Q12143 YLL053CYLL053C 459 nt10.81□□□□□ -0.68
NSL1Q12143 HEM12YDR047W 1089 nt10.75□□□□□ -0.69
NSL1Q12143 YFL067WYFL067W 528 nt10.73□□□□□ -0.69
NSL1Q12143 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.73□□□□□ -0.69
NSL1Q12143 ATF2YGR177C 1608 nt10.73□□□□□ -0.69
NSL1Q12143 DIC1YLR348C 897 nt10.72□□□□□ -0.69
NSL1Q12143 FTR1YER145C 1215 nt10.71□□□□□ -0.69
NSL1Q12143 MIC10YCL057C-A 294 nt10.69□□□□□ -0.7
NSL1Q12143 DDR2YOL052C-A 186 nt10.68□□□□□ -0.7
NSL1Q12143 SNG1YGR197C 1644 nt10.68□□□□□ -0.7
NSL1Q12143 GAL1YBR020W 1587 nt10.67□□□□□ -0.7
NSL1Q12143 TRM5YHR070W 1500 nt10.67□□□□□ -0.7
NSL1Q12143 RAX1YOR301W 1308 nt10.66□□□□□ -0.7
NSL1Q12143 HSP60YLR259C 1719 nt10.64□□□□□ -0.71
NSL1Q12143 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.6□□□□□ -0.71
NSL1Q12143 AQY1YPR192W 918 nt10.59□□□□□ -0.71
NSL1Q12143 CCA1YER168C 1641 nt10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.3 ms