Protein–RNA interactions for Protein: Q12089

AEP3, ATPase expression protein 3, yeastyeast

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Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AEP3Q12089 RTF1YGL244W 1677 nt10.69□□□□□ -0.7
AEP3Q12089 BDH2YAL061W 1254 nt10.64□□□□□ -0.71
AEP3Q12089 YHL050CYHL050C 2094 nt10.62□□□□□ -0.71
AEP3Q12089 SHU1YHL006C 453 nt10.61□□□□□ -0.71
AEP3Q12089 TRM9YML014W 840 nt10.58□□□□□ -0.72
AEP3Q12089 SIS1YNL007C 1059 nt10.58□□□□□ -0.72
AEP3Q12089 BOP3YNL042W 1191 nt10.56□□□□□ -0.72
AEP3Q12089 RTS2YOR077W 699 nt10.53□□□□□ -0.72
AEP3Q12089 RRT12YCR045C 1476 nt10.53□□□□□ -0.72
AEP3Q12089 GFD2YCL036W 1701 nt10.52□□□□□ -0.73
AEP3Q12089 PTK1YKL198C 1989 nt10.52□□□□□ -0.73
AEP3Q12089 WWM1YFL010C 636 nt10.51□□□□□ -0.73
AEP3Q12089 CCT6YDR188W 1641 nt10.5□□□□□ -0.73
AEP3Q12089 ART5YGR068C 1761 nt10.49□□□□□ -0.73
AEP3Q12089 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.48□□□□□ -0.73
AEP3Q12089 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.48□□□□□ -0.73
AEP3Q12089 YKL097CYKL097C 411 nt10.48□□□□□ -0.73
AEP3Q12089 BOR1YNL275W 1731 nt10.47□□□□□ -0.73
AEP3Q12089 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.45□□□□□ -0.74
AEP3Q12089 YNL195CYNL195C 786 nt10.44□□□□□ -0.74
AEP3Q12089 HOM6YJR139C 1080 nt10.4□□□□□ -0.74
AEP3Q12089 CUE1YMR264W 612 nt10.4□□□□□ -0.74
AEP3Q12089 YGR021WYGR021W 873 nt10.39□□□□□ -0.75
AEP3Q12089 LSM3YLR438C-A 270 nt10.38□□□□□ -0.75
AEP3Q12089 PET9YBL030C 957 nt10.37□□□□□ -0.75
AEP3Q12089 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.35□□□□□ -0.75
AEP3Q12089 YFL054CYFL054C 1941 nt10.32□□□□□ -0.76
AEP3Q12089 YIL100WYIL100W 354 nt10.31□□□□□ -0.76
AEP3Q12089 MNP1YGL068W 585 nt10.29□□□□□ -0.76
AEP3Q12089 NCP1YHR042W 2076 nt10.27□□□□□ -0.76
AEP3Q12089 YCH1YGR203W 447 nt10.25□□□□□ -0.77
AEP3Q12089 SPT8YLR055C 1809 nt10.25□□□□□ -0.77
AEP3Q12089 RKM5YLR137W 1104 nt10.23□□□□□ -0.77
AEP3Q12089 TIR4YOR009W 1464 nt10.17□□□□□ -0.78
AEP3Q12089 YMR057CYMR057C 372 nt10.17□□□□□ -0.78
AEP3Q12089 YOR139CYOR139C 393 nt10.15□□□□□ -0.78
AEP3Q12089 YLR236CYLR236C 324 nt10.14□□□□□ -0.79
AEP3Q12089 RPM1RPM1 483 nt10.13□□□□□ -0.79
AEP3Q12089 MCH5YOR306C 1566 nt10.11□□□□□ -0.79
AEP3Q12089 HSP60YLR259C 1719 nt10.1□□□□□ -0.79
AEP3Q12089 YOL037CYOL037C 354 nt10.08□□□□□ -0.8
AEP3Q12089 YJL225CYJL225C 5277 nt10.06□□□□□ -0.8
AEP3Q12089 ALG12YNR030W 1656 nt10.04□□□□□ -0.8
AEP3Q12089 LCB1YMR296C 1677 nt10.02□□□□□ -0.8
AEP3Q12089 SWE1YJL187C 2460 nt10.02□□□□□ -0.8
AEP3Q12089 NPL3YDR432W 1245 nt10□□□□□ -0.81
AEP3Q12089 GLK1YCL040W 1503 nt9.95□□□□□ -0.82
AEP3Q12089 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt9.9□□□□□ -0.82
AEP3Q12089 YLR281CYLR281C 468 nt9.89□□□□□ -0.83
AEP3Q12089 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.87□□□□□ -0.83
AEP3Q12089 WHI5YOR083W 888 nt9.85□□□□□ -0.83
AEP3Q12089 YJL152WYJL152W 360 nt9.81□□□□□ -0.84
AEP3Q12089 LYS4YDR234W 2082 nt9.81□□□□□ -0.84
AEP3Q12089 FUR4YBR021W 1902 nt9.79□□□□□ -0.84
AEP3Q12089 NAR1YNL240C 1476 nt9.79□□□□□ -0.84
AEP3Q12089 SIM1YIL123W 1431 nt9.77□□□□□ -0.85
AEP3Q12089 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.77□□□□□ -0.85
AEP3Q12089 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.77□□□□□ -0.85
AEP3Q12089 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.77□□□□□ -0.85
AEP3Q12089 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.77□□□□□ -0.85
AEP3Q12089 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.77□□□□□ -0.85
AEP3Q12089 DSK2YMR276W 1122 nt9.77□□□□□ -0.85
AEP3Q12089 AAC1YMR056C 930 nt9.72□□□□□ -0.85
AEP3Q12089 BIO4YNR057C 714 nt9.72□□□□□ -0.85
AEP3Q12089 PRP4YPR178W 1398 nt9.72□□□□□ -0.85
AEP3Q12089 PUS2YGL063W 1113 nt9.7□□□□□ -0.86
AEP3Q12089 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.68□□□□□ -0.86
AEP3Q12089 YEL076CYEL076C 651 nt9.68□□□□□ -0.86
AEP3Q12089 YLR464WYLR464W 651 nt9.68□□□□□ -0.86
AEP3Q12089 DPS1YLL018C 1674 nt9.66□□□□□ -0.86
AEP3Q12089 YPR011CYPR011C 981 nt9.65□□□□□ -0.86
AEP3Q12089 PCM1YEL058W 1674 nt9.64□□□□□ -0.87
AEP3Q12089 IMP2'YIL154C 1041 nt9.63□□□□□ -0.87
AEP3Q12089 FMP52YER004W 696 nt9.6□□□□□ -0.87
AEP3Q12089 BMT6YLR063W 1098 nt9.59□□□□□ -0.87
AEP3Q12089 IDH1YNL037C 1083 nt9.59□□□□□ -0.87
AEP3Q12089 RRD1YIL153W 1182 nt9.58□□□□□ -0.88
AEP3Q12089 BIO5YNR056C 1686 nt9.58□□□□□ -0.88
AEP3Q12089 CCA1YER168C 1641 nt9.57□□□□□ -0.88
AEP3Q12089 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.56□□□□□ -0.88
AEP3Q12089 CYT2YKL087C 675 nt9.53□□□□□ -0.88
AEP3Q12089 GBP2YCL011C 1284 nt9.53□□□□□ -0.88
AEP3Q12089 DED1YOR204W 1815 nt9.53□□□□□ -0.88
AEP3Q12089 PBP1YGR178C 2169 nt9.53□□□□□ -0.88
AEP3Q12089 ERF2YLR246W 1080 nt9.52□□□□□ -0.89
AEP3Q12089 SNF1YDR477W 1902 nt9.52□□□□□ -0.89
AEP3Q12089 YKR005CYKR005C 1578 nt9.5□□□□□ -0.89
AEP3Q12089 CMP2YML057W 1815 nt9.5□□□□□ -0.89
AEP3Q12089 FMP45YDL222C 930 nt9.5□□□□□ -0.89
AEP3Q12089 CRR1YLR213C 1269 nt9.5□□□□□ -0.89
AEP3Q12089 SNF6YHL025W 999 nt9.49□□□□□ -0.89
AEP3Q12089 ERV46YAL042W 1248 nt9.49□□□□□ -0.89
AEP3Q12089 RAX1YOR301W 1308 nt9.49□□□□□ -0.89
AEP3Q12089 ADH2YMR303C 1047 nt9.46□□□□□ -0.9
AEP3Q12089 HSL7YBR133C 2484 nt9.46□□□□□ -0.9
AEP3Q12089 FMT1YBL013W 1206 nt9.45□□□□□ -0.9
AEP3Q12089 LPX1YOR084W 1164 nt9.45□□□□□ -0.9
AEP3Q12089 TCD2YKL027W 1344 nt9.45□□□□□ -0.9
AEP3Q12089 HEM12YDR047W 1089 nt9.44□□□□□ -0.9
AEP3Q12089 CWP1YKL096W 720 nt9.44□□□□□ -0.9
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