Protein–RNA interactions for Protein: Q08957

AFT2, Iron-regulated transcriptional activator AFT2, yeastyeast

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AFT2Q08957 ART5YGR068C 1761 nt13.63□□□□□ -0.23
AFT2Q08957 YMR090WYMR090W 684 nt13.61□□□□□ -0.23
AFT2Q08957 GFD2YCL036W 1701 nt13.6□□□□□ -0.23
AFT2Q08957 IRC15YPL017C 1500 nt13.59□□□□□ -0.23
AFT2Q08957 YOL037CYOL037C 354 nt13.58□□□□□ -0.24
AFT2Q08957 SDH1YKL148C 1923 nt13.56□□□□□ -0.24
AFT2Q08957 TIR4YOR009W 1464 nt13.55□□□□□ -0.24
AFT2Q08957 NPL3YDR432W 1245 nt13.53□□□□□ -0.24
AFT2Q08957 GIS3YLR094C 1509 nt13.49□□□□□ -0.25
AFT2Q08957 PET9YBL030C 957 nt13.49□□□□□ -0.25
AFT2Q08957 TAT1YBR069C 1860 nt13.48□□□□□ -0.25
AFT2Q08957 RTS2YOR077W 699 nt13.46□□□□□ -0.25
AFT2Q08957 SCC4YER147C 1875 nt13.44□□□□□ -0.26
AFT2Q08957 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.43□□□□□ -0.26
AFT2Q08957 YCH1YGR203W 447 nt13.4□□□□□ -0.26
AFT2Q08957 YMR057CYMR057C 372 nt13.39□□□□□ -0.27
AFT2Q08957 YLR281CYLR281C 468 nt13.35□□□□□ -0.27
AFT2Q08957 YJL152WYJL152W 360 nt13.34□□□□□ -0.27
AFT2Q08957 WHI5YOR083W 888 nt13.33□□□□□ -0.28
AFT2Q08957 CUE1YMR264W 612 nt13.31□□□□□ -0.28
AFT2Q08957 FPS1YLL043W 2010 nt13.3□□□□□ -0.28
AFT2Q08957 YSC84YHR016C 1407 nt13.15□□□□□ -0.3
AFT2Q08957 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.15□□□□□ -0.3
AFT2Q08957 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.15□□□□□ -0.3
AFT2Q08957 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.15□□□□□ -0.3
AFT2Q08957 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.15□□□□□ -0.3
AFT2Q08957 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.15□□□□□ -0.3
AFT2Q08957 YHL050CYHL050C 2094 nt13.13□□□□□ -0.31
AFT2Q08957 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.13□□□□□ -0.31
AFT2Q08957 PUS2YGL063W 1113 nt13.12□□□□□ -0.31
AFT2Q08957 RRT12YCR045C 1476 nt13.1□□□□□ -0.31
AFT2Q08957 PCH2YBR186W 1695 nt13.1□□□□□ -0.31
AFT2Q08957 YIL100WYIL100W 354 nt13.08□□□□□ -0.32
AFT2Q08957 SEC11YIR022W 504 nt13.08□□□□□ -0.32
AFT2Q08957 YLR236CYLR236C 324 nt13.08□□□□□ -0.32
AFT2Q08957 YPR011CYPR011C 981 nt13.06□□□□□ -0.32
AFT2Q08957 GUT2YIL155C 1950 nt13.06□□□□□ -0.32
AFT2Q08957 IDH1YNL037C 1083 nt13.02□□□□□ -0.33
AFT2Q08957 DSK2YMR276W 1122 nt13.01□□□□□ -0.33
AFT2Q08957 RRD1YIL153W 1182 nt12.98□□□□□ -0.33
AFT2Q08957 GBP2YCL011C 1284 nt12.98□□□□□ -0.33
AFT2Q08957 IMP2'YIL154C 1041 nt12.95□□□□□ -0.34
AFT2Q08957 YNL195CYNL195C 786 nt12.95□□□□□ -0.34
AFT2Q08957 PIB2YGL023C 1908 nt12.95□□□□□ -0.34
AFT2Q08957 DED1YOR204W 1815 nt12.95□□□□□ -0.34
AFT2Q08957 FMP45YDL222C 930 nt12.87□□□□□ -0.35
AFT2Q08957 FMT1YBL013W 1206 nt12.85□□□□□ -0.35
AFT2Q08957 MXR2YCL033C 507 nt12.85□□□□□ -0.35
AFT2Q08957 TCD2YKL027W 1344 nt12.85□□□□□ -0.35
AFT2Q08957 YDR433WYDR433W 441 nt12.84□□□□□ -0.35
AFT2Q08957 LPX1YOR084W 1164 nt12.83□□□□□ -0.36
AFT2Q08957 ERV46YAL042W 1248 nt12.8□□□□□ -0.36
AFT2Q08957 RTF1YGL244W 1677 nt12.8□□□□□ -0.36
AFT2Q08957 NCP1YHR042W 2076 nt12.77□□□□□ -0.36
AFT2Q08957 FMP52YER004W 696 nt12.76□□□□□ -0.37
AFT2Q08957 LCB1YMR296C 1677 nt12.71□□□□□ -0.37
AFT2Q08957 BOP3YNL042W 1191 nt12.71□□□□□ -0.37
AFT2Q08957 YKR040CYKR040C 504 nt12.7□□□□□ -0.38
AFT2Q08957 PCM1YEL058W 1674 nt12.7□□□□□ -0.38
AFT2Q08957 ADH2YMR303C 1047 nt12.69□□□□□ -0.38
AFT2Q08957 PTK1YKL198C 1989 nt12.67□□□□□ -0.38
AFT2Q08957 SOR2YDL246C 1074 nt12.66□□□□□ -0.38
AFT2Q08957 SOR1YJR159W 1074 nt12.66□□□□□ -0.38
AFT2Q08957 CWP1YKL096W 720 nt12.66□□□□□ -0.38
AFT2Q08957 FRD1YEL047C 1413 nt12.64□□□□□ -0.39
AFT2Q08957 YCL042WYCL042W 360 nt12.57□□□□□ -0.4
AFT2Q08957 SIM1YIL123W 1431 nt12.56□□□□□ -0.4
AFT2Q08957 SNF6YHL025W 999 nt12.56□□□□□ -0.4
AFT2Q08957 BIO4YNR057C 714 nt12.53□□□□□ -0.4
AFT2Q08957 SPP1YPL138C 1062 nt12.53□□□□□ -0.4
AFT2Q08957 MOT3YMR070W 1473 nt12.5□□□□□ -0.41
AFT2Q08957 LYS4YDR234W 2082 nt12.47□□□□□ -0.41
AFT2Q08957 YIH1YCR059C 777 nt12.45□□□□□ -0.42
AFT2Q08957 PAC11YDR488C 1602 nt12.44□□□□□ -0.42
AFT2Q08957 RNQ1YCL028W 1218 nt12.4□□□□□ -0.42
AFT2Q08957 YLL053CYLL053C 459 nt12.38□□□□□ -0.43
AFT2Q08957 YFL054CYFL054C 1941 nt12.37□□□□□ -0.43
AFT2Q08957 PTH1YHR189W 573 nt12.35□□□□□ -0.43
AFT2Q08957 DIC1YLR348C 897 nt12.35□□□□□ -0.43
AFT2Q08957 CRR1YLR213C 1269 nt12.3□□□□□ -0.44
AFT2Q08957 SPT8YLR055C 1809 nt12.29□□□□□ -0.44
AFT2Q08957 ERF2YLR246W 1080 nt12.28□□□□□ -0.44
AFT2Q08957 ATF2YGR177C 1608 nt12.28□□□□□ -0.44
AFT2Q08957 FTR1YER145C 1215 nt12.26□□□□□ -0.45
AFT2Q08957 GAL1YBR020W 1587 nt12.23□□□□□ -0.45
AFT2Q08957 TRM5YHR070W 1500 nt12.22□□□□□ -0.45
AFT2Q08957 YLR235CYLR235C 399 nt12.22□□□□□ -0.45
AFT2Q08957 MIC10YCL057C-A 294 nt12.21□□□□□ -0.45
AFT2Q08957 TIM23YNR017W 669 nt12.18□□□□□ -0.46
AFT2Q08957 RTG1YOL067C 534 nt12.17□□□□□ -0.46
AFT2Q08957 SNG1YGR197C 1644 nt12.16□□□□□ -0.46
AFT2Q08957 HEM12YDR047W 1089 nt12.15□□□□□ -0.46
AFT2Q08957 YFL067WYFL067W 528 nt12.15□□□□□ -0.46
AFT2Q08957 YKL030WYKL030W 606 nt12.13□□□□□ -0.47
AFT2Q08957 YLR179CYLR179C 606 nt12.13□□□□□ -0.47
AFT2Q08957 SWE1YJL187C 2460 nt12.12□□□□□ -0.47
AFT2Q08957 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.12□□□□□ -0.47
AFT2Q08957 DDR2YOL052C-A 186 nt12.1□□□□□ -0.47
AFT2Q08957 WSC2YNL283C 1512 nt12.09□□□□□ -0.47
AFT2Q08957 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.08□□□□□ -0.48
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