Protein–RNA interactions for Protein: Q08920

CBC2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CBC2Q08920 SSA4YER103W 1929 nt12.66□□□□□ -0.38
CBC2Q08920 CAC2YML102W 1407 nt12.59□□□□□ -0.39
CBC2Q08920 YLR281CYLR281C 468 nt12.58□□□□□ -0.4
CBC2Q08920 WHI5YOR083W 888 nt12.54□□□□□ -0.4
CBC2Q08920 EMI2YDR516C 1503 nt12.53□□□□□ -0.4
CBC2Q08920 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.53□□□□□ -0.4
CBC2Q08920 ART5YGR068C 1761 nt12.52□□□□□ -0.41
CBC2Q08920 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.5□□□□□ -0.41
CBC2Q08920 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.5□□□□□ -0.41
CBC2Q08920 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.5□□□□□ -0.41
CBC2Q08920 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.5□□□□□ -0.41
CBC2Q08920 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.5□□□□□ -0.41
CBC2Q08920 TIR4YOR009W 1464 nt12.5□□□□□ -0.41
CBC2Q08920 GFD2YCL036W 1701 nt12.47□□□□□ -0.41
CBC2Q08920 YDL221WYDL221W 552 nt12.43□□□□□ -0.42
CBC2Q08920 YJL152WYJL152W 360 nt12.43□□□□□ -0.42
CBC2Q08920 PET9YBL030C 957 nt12.43□□□□□ -0.42
CBC2Q08920 PUS2YGL063W 1113 nt12.42□□□□□ -0.42
CBC2Q08920 YCH1YGR203W 447 nt12.41□□□□□ -0.42
CBC2Q08920 IRC15YPL017C 1500 nt12.39□□□□□ -0.43
CBC2Q08920 YMR090WYMR090W 684 nt12.39□□□□□ -0.43
CBC2Q08920 YMR057CYMR057C 372 nt12.36□□□□□ -0.43
CBC2Q08920 YBR220CYBR220C 1683 nt12.32□□□□□ -0.44
CBC2Q08920 RTS2YOR077W 699 nt12.31□□□□□ -0.44
CBC2Q08920 SDH1YKL148C 1923 nt12.29□□□□□ -0.44
CBC2Q08920 GIS3YLR094C 1509 nt12.29□□□□□ -0.44
CBC2Q08920 YPR011CYPR011C 981 nt12.29□□□□□ -0.44
CBC2Q08920 CSM2YIL132C 642 nt12.25□□□□□ -0.45
CBC2Q08920 YLR236CYLR236C 324 nt12.25□□□□□ -0.45
CBC2Q08920 DSK2YMR276W 1122 nt12.25□□□□□ -0.45
CBC2Q08920 FPS1YLL043W 2010 nt12.22□□□□□ -0.45
CBC2Q08920 IMP2'YIL154C 1041 nt12.22□□□□□ -0.45
CBC2Q08920 SCC4YER147C 1875 nt12.21□□□□□ -0.45
CBC2Q08920 BDF1YLR399C 2061 nt12.2□□□□□ -0.46
CBC2Q08920 CUE1YMR264W 612 nt12.19□□□□□ -0.46
CBC2Q08920 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.18□□□□□ -0.46
CBC2Q08920 IDH1YNL037C 1083 nt12.17□□□□□ -0.46
CBC2Q08920 GBP2YCL011C 1284 nt12.11□□□□□ -0.47
CBC2Q08920 FMP45YDL222C 930 nt12.1□□□□□ -0.47
CBC2Q08920 LPX1YOR084W 1164 nt12.05□□□□□ -0.48
CBC2Q08920 YDR433WYDR433W 441 nt12.04□□□□□ -0.48
CBC2Q08920 ERV46YAL042W 1248 nt12.03□□□□□ -0.48
CBC2Q08920 TAT1YBR069C 1860 nt12.02□□□□□ -0.49
CBC2Q08920 YIL100WYIL100W 354 nt12.01□□□□□ -0.49
CBC2Q08920 RRD1YIL153W 1182 nt12.01□□□□□ -0.49
CBC2Q08920 DED1YOR204W 1815 nt12□□□□□ -0.49
CBC2Q08920 MXR2YCL033C 507 nt11.99□□□□□ -0.49
CBC2Q08920 TCD2YKL027W 1344 nt11.97□□□□□ -0.49
CBC2Q08920 YKR040CYKR040C 504 nt11.94□□□□□ -0.5
CBC2Q08920 PAU21YOR394W 495 nt11.94□□□□□ -0.5
CBC2Q08920 PAU22YPL282C 495 nt11.94□□□□□ -0.5
CBC2Q08920 RRT12YCR045C 1476 nt11.92□□□□□ -0.5
CBC2Q08920 YSC84YHR016C 1407 nt11.92□□□□□ -0.5
CBC2Q08920 FMT1YBL013W 1206 nt11.89□□□□□ -0.51
CBC2Q08920 YHL050CYHL050C 2094 nt11.89□□□□□ -0.51
CBC2Q08920 YNL195CYNL195C 786 nt11.85□□□□□ -0.51
CBC2Q08920 SEC11YIR022W 504 nt11.83□□□□□ -0.52
CBC2Q08920 SPP1YPL138C 1062 nt11.82□□□□□ -0.52
CBC2Q08920 FMP52YER004W 696 nt11.8□□□□□ -0.52
CBC2Q08920 FRD1YEL047C 1413 nt11.79□□□□□ -0.52
CBC2Q08920 PCH2YBR186W 1695 nt11.79□□□□□ -0.52
CBC2Q08920 ARO7YPR060C 771 nt11.78□□□□□ -0.52
CBC2Q08920 SOR2YDL246C 1074 nt11.75□□□□□ -0.53
CBC2Q08920 SOR1YJR159W 1074 nt11.75□□□□□ -0.53
CBC2Q08920 ADH2YMR303C 1047 nt11.74□□□□□ -0.53
CBC2Q08920 GUT2YIL155C 1950 nt11.74□□□□□ -0.53
CBC2Q08920 CWP1YKL096W 720 nt11.73□□□□□ -0.53
CBC2Q08920 YCL042WYCL042W 360 nt11.72□□□□□ -0.53
CBC2Q08920 PCM1YEL058W 1674 nt11.71□□□□□ -0.53
CBC2Q08920 SNF6YHL025W 999 nt11.62□□□□□ -0.55
CBC2Q08920 PIB2YGL023C 1908 nt11.62□□□□□ -0.55
CBC2Q08920 LCB1YMR296C 1677 nt11.59□□□□□ -0.55
CBC2Q08920 NCP1YHR042W 2076 nt11.58□□□□□ -0.56
CBC2Q08920 PTH1YHR189W 573 nt11.56□□□□□ -0.56
CBC2Q08920 RTG1YOL067C 534 nt11.55□□□□□ -0.56
CBC2Q08920 RTF1YGL244W 1677 nt11.54□□□□□ -0.56
CBC2Q08920 SIM1YIL123W 1431 nt11.53□□□□□ -0.56
CBC2Q08920 YIH1YCR059C 777 nt11.52□□□□□ -0.57
CBC2Q08920 MET8YBR213W 825 nt11.52□□□□□ -0.57
CBC2Q08920 BIO4YNR057C 714 nt11.51□□□□□ -0.57
CBC2Q08920 BOP3YNL042W 1191 nt11.5□□□□□ -0.57
CBC2Q08920 RNQ1YCL028W 1218 nt11.5□□□□□ -0.57
CBC2Q08920 YLR235CYLR235C 399 nt11.48□□□□□ -0.57
CBC2Q08920 DIC1YLR348C 897 nt11.48□□□□□ -0.57
CBC2Q08920 MRPL8YJL063C 717 nt11.44□□□□□ -0.58
CBC2Q08920 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.43□□□□□ -0.58 RIP-Chip
CBC2Q08920 YEL076CYEL076C 651 nt11.43□□□□□ -0.58
CBC2Q08920 YLL053CYLL053C 459 nt11.43□□□□□ -0.58
CBC2Q08920 YLR464WYLR464W 651 nt11.43□□□□□ -0.58 RIP-Chip
CBC2Q08920 CLB6YGR109C 1143 nt11.42□□□□□ -0.58
CBC2Q08920 YKL030WYKL030W 606 nt11.42□□□□□ -0.58
CBC2Q08920 REG2YBR050C 1017 nt11.41□□□□□ -0.58
CBC2Q08920 PTK1YKL198C 1989 nt11.41□□□□□ -0.58
CBC2Q08920 TIM23YNR017W 669 nt11.38□□□□□ -0.59
CBC2Q08920 LYS4YDR234W 2082 nt11.36□□□□□ -0.59
CBC2Q08920 FTR1YER145C 1215 nt11.35□□□□□ -0.59
CBC2Q08920 ADO1YJR105W 1023 nt11.34□□□□□ -0.59
CBC2Q08920 YLR179CYLR179C 606 nt11.32□□□□□ -0.6
CBC2Q08920 GAL1YBR020W 1587 nt11.32□□□□□ -0.6
CBC2Q08920 ERF2YLR246W 1080 nt11.3□□□□□ -0.6
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