Protein–RNA interactions for Protein: Q08908

FRE5, Ferric reductase transmembrane component 5, yeastyeast

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FRE5Q08908 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.19□□□□□ -0.62
FRE5Q08908 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.19□□□□□ -0.62
FRE5Q08908 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.18□□□□□ -0.62
FRE5Q08908 GFD2YCL036W 1701 nt11.18□□□□□ -0.62
FRE5Q08908 ART5YGR068C 1761 nt11.17□□□□□ -0.62
FRE5Q08908 SHU1YHL006C 453 nt11.16□□□□□ -0.62
FRE5Q08908 YGR021WYGR021W 873 nt11.14□□□□□ -0.63
FRE5Q08908 HOM6YJR139C 1080 nt11.14□□□□□ -0.63
FRE5Q08908 PCH2YBR186W 1695 nt11.14□□□□□ -0.63
FRE5Q08908 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.13□□□□□ -0.63
FRE5Q08908 GUT2YIL155C 1950 nt11.11□□□□□ -0.63
FRE5Q08908 RTS2YOR077W 699 nt11.1□□□□□ -0.63
FRE5Q08908 SEC11YIR022W 504 nt11.08□□□□□ -0.64
FRE5Q08908 PET9YBL030C 957 nt11.05□□□□□ -0.64
FRE5Q08908 MNP1YGL068W 585 nt11.04□□□□□ -0.64
FRE5Q08908 YSC84YHR016C 1407 nt11.03□□□□□ -0.64
FRE5Q08908 TIR4YOR009W 1464 nt11.01□□□□□ -0.65
FRE5Q08908 YHL050CYHL050C 2094 nt11□□□□□ -0.65
FRE5Q08908 PIB2YGL023C 1908 nt10.99□□□□□ -0.65
FRE5Q08908 RKM5YLR137W 1104 nt10.97□□□□□ -0.65
FRE5Q08908 CUE1YMR264W 612 nt10.97□□□□□ -0.65
FRE5Q08908 YCH1YGR203W 447 nt10.94□□□□□ -0.66
FRE5Q08908 RRT12YCR045C 1476 nt10.93□□□□□ -0.66
FRE5Q08908 YMR057CYMR057C 372 nt10.91□□□□□ -0.66
FRE5Q08908 NPL3YDR432W 1245 nt10.84□□□□□ -0.67
FRE5Q08908 RTF1YGL244W 1677 nt10.83□□□□□ -0.68
FRE5Q08908 YIL100WYIL100W 354 nt10.79□□□□□ -0.68
FRE5Q08908 YKL097CYKL097C 411 nt10.77□□□□□ -0.69
FRE5Q08908 YNL195CYNL195C 786 nt10.77□□□□□ -0.69
FRE5Q08908 BOP3YNL042W 1191 nt10.73□□□□□ -0.69
FRE5Q08908 PTK1YKL198C 1989 nt10.73□□□□□ -0.69
FRE5Q08908 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.72□□□□□ -0.69
FRE5Q08908 YLR236CYLR236C 324 nt10.72□□□□□ -0.69
FRE5Q08908 YJL152WYJL152W 360 nt10.7□□□□□ -0.7
FRE5Q08908 NCP1YHR042W 2076 nt10.69□□□□□ -0.7
FRE5Q08908 UME6YDR207C 2511 nt10.65□□□□□ -0.7
FRE5Q08908 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.63□□□□□ -0.71
FRE5Q08908 YOL037CYOL037C 354 nt10.62□□□□□ -0.71
FRE5Q08908 LCB1YMR296C 1677 nt10.53□□□□□ -0.72
FRE5Q08908 BOR1YNL275W 1731 nt10.53□□□□□ -0.72
FRE5Q08908 YOR139CYOR139C 393 nt10.5□□□□□ -0.73
FRE5Q08908 RRD1YIL153W 1182 nt10.49□□□□□ -0.73
FRE5Q08908 WHI5YOR083W 888 nt10.48□□□□□ -0.73
FRE5Q08908 YFL054CYFL054C 1941 nt10.46□□□□□ -0.74
FRE5Q08908 YJL225CYJL225C 5277 nt10.45□□□□□ -0.74
FRE5Q08908 YLR281CYLR281C 468 nt10.45□□□□□ -0.74
FRE5Q08908 DED1YOR204W 1815 nt10.42□□□□□ -0.74
FRE5Q08908 SPT8YLR055C 1809 nt10.41□□□□□ -0.74
FRE5Q08908 FMT1YBL013W 1206 nt10.37□□□□□ -0.75
FRE5Q08908 GBP2YCL011C 1284 nt10.37□□□□□ -0.75
FRE5Q08908 FMP52YER004W 696 nt10.36□□□□□ -0.75
FRE5Q08908 IDH1YNL037C 1083 nt10.36□□□□□ -0.75
FRE5Q08908 PCM1YEL058W 1674 nt10.35□□□□□ -0.75
FRE5Q08908 LYS4YDR234W 2082 nt10.33□□□□□ -0.76
FRE5Q08908 SIM1YIL123W 1431 nt10.32□□□□□ -0.76
FRE5Q08908 TCD2YKL027W 1344 nt10.31□□□□□ -0.76
FRE5Q08908 ADH2YMR303C 1047 nt10.27□□□□□ -0.77
FRE5Q08908 MCH5YOR306C 1566 nt10.26□□□□□ -0.77
FRE5Q08908 BIO4YNR057C 714 nt10.25□□□□□ -0.77
FRE5Q08908 SWE1YJL187C 2460 nt10.24□□□□□ -0.77
FRE5Q08908 CWP1YKL096W 720 nt10.23□□□□□ -0.77
FRE5Q08908 YPR011CYPR011C 981 nt10.22□□□□□ -0.77
FRE5Q08908 MXR2YCL033C 507 nt10.21□□□□□ -0.77
FRE5Q08908 PUS2YGL063W 1113 nt10.2□□□□□ -0.78
FRE5Q08908 SNF6YHL025W 999 nt10.2□□□□□ -0.78
FRE5Q08908 DSK2YMR276W 1122 nt10.2□□□□□ -0.78
FRE5Q08908 IMP2'YIL154C 1041 nt10.19□□□□□ -0.78
FRE5Q08908 FMP45YDL222C 930 nt10.17□□□□□ -0.78
FRE5Q08908 SOR2YDL246C 1074 nt10.17□□□□□ -0.78
FRE5Q08908 SOR1YJR159W 1074 nt10.17□□□□□ -0.78
FRE5Q08908 YDR433WYDR433W 441 nt10.16□□□□□ -0.78
FRE5Q08908 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.12□□□□□ -0.79
FRE5Q08908 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.12□□□□□ -0.79
FRE5Q08908 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.12□□□□□ -0.79
FRE5Q08908 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.12□□□□□ -0.79
FRE5Q08908 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.12□□□□□ -0.79
FRE5Q08908 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.12□□□□□ -0.79
FRE5Q08908 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.12□□□□□ -0.79
FRE5Q08908 YIH1YCR059C 777 nt10.11□□□□□ -0.79
FRE5Q08908 CRR1YLR213C 1269 nt10.11□□□□□ -0.79
FRE5Q08908 ALG12YNR030W 1656 nt10.1□□□□□ -0.79
FRE5Q08908 ERF2YLR246W 1080 nt10.09□□□□□ -0.79
FRE5Q08908 ERV46YAL042W 1248 nt10.08□□□□□ -0.8
FRE5Q08908 LPX1YOR084W 1164 nt10.08□□□□□ -0.8
FRE5Q08908 FRD1YEL047C 1413 nt10.07□□□□□ -0.8
FRE5Q08908 YLL053CYLL053C 459 nt10.06□□□□□ -0.8
FRE5Q08908 YCL042WYCL042W 360 nt10.06□□□□□ -0.8
FRE5Q08908 HSP60YLR259C 1719 nt10.06□□□□□ -0.8
FRE5Q08908 RNQ1YCL028W 1218 nt10.04□□□□□ -0.8
FRE5Q08908 MIC10YCL057C-A 294 nt10.04□□□□□ -0.8
FRE5Q08908 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.03□□□□□ -0.8
FRE5Q08908 YKR040CYKR040C 504 nt10.02□□□□□ -0.81
FRE5Q08908 ATF2YGR177C 1608 nt10.02□□□□□ -0.81
FRE5Q08908 HEM12YDR047W 1089 nt9.98□□□□□ -0.81
FRE5Q08908 SNG1YGR197C 1644 nt9.96□□□□□ -0.81
FRE5Q08908 FTR1YER145C 1215 nt9.95□□□□□ -0.82
FRE5Q08908 GLK1YCL040W 1503 nt9.95□□□□□ -0.82
FRE5Q08908 CCA1YER168C 1641 nt9.95□□□□□ -0.82
FRE5Q08908 FUR4YBR021W 1902 nt9.94□□□□□ -0.82
FRE5Q08908 GAL1YBR020W 1587 nt9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.5 ms