Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUDPQ08623 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PUDPQ08623 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUDPQ08623 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUDPQ08623 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUDPQ08623 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUDPQ08623 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUDPQ08623 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUDPQ08623 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUDPQ08623 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PUDPQ08623 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUDPQ08623 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUDPQ08623 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUDPQ08623 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUDPQ08623 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUDPQ08623 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUDPQ08623 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUDPQ08623 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUDPQ08623 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUDPQ08623 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUDPQ08623 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUDPQ08623 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUDPQ08623 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUDPQ08623 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUDPQ08623 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUDPQ08623 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUDPQ08623 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUDPQ08623 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUDPQ08623 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUDPQ08623 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUDPQ08623 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUDPQ08623 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUDPQ08623 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUDPQ08623 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUDPQ08623 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUDPQ08623 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUDPQ08623 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUDPQ08623 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUDPQ08623 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUDPQ08623 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUDPQ08623 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUDPQ08623 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PUDPQ08623 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUDPQ08623 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUDPQ08623 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUDPQ08623 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUDPQ08623 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUDPQ08623 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUDPQ08623 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUDPQ08623 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUDPQ08623 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUDPQ08623 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUDPQ08623 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUDPQ08623 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUDPQ08623 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUDPQ08623 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUDPQ08623 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUDPQ08623 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUDPQ08623 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUDPQ08623 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUDPQ08623 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUDPQ08623 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUDPQ08623 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUDPQ08623 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUDPQ08623 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUDPQ08623 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUDPQ08623 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUDPQ08623 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUDPQ08623 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUDPQ08623 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUDPQ08623 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUDPQ08623 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUDPQ08623 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUDPQ08623 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUDPQ08623 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUDPQ08623 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUDPQ08623 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUDPQ08623 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUDPQ08623 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUDPQ08623 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUDPQ08623 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PUDPQ08623 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUDPQ08623 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUDPQ08623 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUDPQ08623 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUDPQ08623 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUDPQ08623 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUDPQ08623 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUDPQ08623 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PUDPQ08623 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PUDPQ08623 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUDPQ08623 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUDPQ08623 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUDPQ08623 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUDPQ08623 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUDPQ08623 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUDPQ08623 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUDPQ08623 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUDPQ08623 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUDPQ08623 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms