Protein–RNA interactions for Protein: Q08236

AVO1, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO1, yeastyeast

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Length 1,176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO1Q08236 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.34□□□□□ -0.59
AVO1Q08236 YOL037CYOL037C 354 nt11.34□□□□□ -0.59
AVO1Q08236 NPL3YDR432W 1245 nt11.33□□□□□ -0.6
AVO1Q08236 DCW1YKL046C 1350 nt11.27□□□□□ -0.61
AVO1Q08236 TAT1YBR069C 1860 nt11.26□□□□□ -0.61
AVO1Q08236 RPP2AYOL039W 321 nt11.26□□□□□ -0.61
AVO1Q08236 SIS1YNL007C 1059 nt11.23□□□□□ -0.61
AVO1Q08236 PTP1YDL230W 1008 nt11.19□□□□□ -0.62
AVO1Q08236 EMI2YDR516C 1503 nt11.13□□□□□ -0.63
AVO1Q08236 CAC2YML102W 1407 nt11.11□□□□□ -0.63
AVO1Q08236 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.07□□□□□ -0.64
AVO1Q08236 YMR090WYMR090W 684 nt11.07□□□□□ -0.64
AVO1Q08236 ART5YGR068C 1761 nt11.07□□□□□ -0.64
AVO1Q08236 YLR281CYLR281C 468 nt11.05□□□□□ -0.64
AVO1Q08236 TIR4YOR009W 1464 nt11.05□□□□□ -0.64
AVO1Q08236 YDL221WYDL221W 552 nt11.04□□□□□ -0.64
AVO1Q08236 WHI5YOR083W 888 nt11.04□□□□□ -0.64
AVO1Q08236 GFD2YCL036W 1701 nt11.04□□□□□ -0.64
AVO1Q08236 YJL152WYJL152W 360 nt11.02□□□□□ -0.65
AVO1Q08236 PET9YBL030C 957 nt11.01□□□□□ -0.65
AVO1Q08236 YCH1YGR203W 447 nt10.99□□□□□ -0.65
AVO1Q08236 IRC15YPL017C 1500 nt10.96□□□□□ -0.65
AVO1Q08236 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.95□□□□□ -0.66
AVO1Q08236 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.95□□□□□ -0.66
AVO1Q08236 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.95□□□□□ -0.66
AVO1Q08236 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.95□□□□□ -0.66
AVO1Q08236 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.95□□□□□ -0.66
AVO1Q08236 RTS2YOR077W 699 nt10.94□□□□□ -0.66
AVO1Q08236 PUS2YGL063W 1113 nt10.93□□□□□ -0.66
AVO1Q08236 YMR057CYMR057C 372 nt10.92□□□□□ -0.66
AVO1Q08236 YBR220CYBR220C 1683 nt10.91□□□□□ -0.66
AVO1Q08236 SDH1YKL148C 1923 nt10.9□□□□□ -0.66
AVO1Q08236 GIS3YLR094C 1509 nt10.87□□□□□ -0.67
AVO1Q08236 SCC4YER147C 1875 nt10.84□□□□□ -0.67
AVO1Q08236 CUE1YMR264W 612 nt10.82□□□□□ -0.68
AVO1Q08236 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.82□□□□□ -0.68
AVO1Q08236 DSK2YMR276W 1122 nt10.81□□□□□ -0.68
AVO1Q08236 IMP2'YIL154C 1041 nt10.8□□□□□ -0.68
AVO1Q08236 IDH1YNL037C 1083 nt10.79□□□□□ -0.68
AVO1Q08236 YLR236CYLR236C 324 nt10.77□□□□□ -0.69
AVO1Q08236 MCH5YOR306C 1566 nt10.74□□□□□ -0.69
AVO1Q08236 YPR011CYPR011C 981 nt10.73□□□□□ -0.69
AVO1Q08236 GBP2YCL011C 1284 nt10.71□□□□□ -0.69
AVO1Q08236 FRE6YLL051C 2139 nt10.7□□□□□ -0.7
AVO1Q08236 YIL100WYIL100W 354 nt10.7□□□□□ -0.7
AVO1Q08236 FMP45YDL222C 930 nt10.67□□□□□ -0.7
AVO1Q08236 YDR433WYDR433W 441 nt10.64□□□□□ -0.71
AVO1Q08236 SSN3YPL042C 1668 nt10.63□□□□□ -0.71
AVO1Q08236 TCD2YKL027W 1344 nt10.6□□□□□ -0.71
AVO1Q08236 LPX1YOR084W 1164 nt10.6□□□□□ -0.71
AVO1Q08236 ERV46YAL042W 1248 nt10.59□□□□□ -0.71
AVO1Q08236 YSC84YHR016C 1407 nt10.58□□□□□ -0.72
AVO1Q08236 RRD1YIL153W 1182 nt10.58□□□□□ -0.72
AVO1Q08236 YNL195CYNL195C 786 nt10.58□□□□□ -0.72
AVO1Q08236 CSM2YIL132C 642 nt10.57□□□□□ -0.72
AVO1Q08236 MXR2YCL033C 507 nt10.56□□□□□ -0.72
AVO1Q08236 GUT2YIL155C 1950 nt10.55□□□□□ -0.72
AVO1Q08236 SEC11YIR022W 504 nt10.54□□□□□ -0.72
AVO1Q08236 YJL225CYJL225C 5277 nt10.54□□□□□ -0.72
AVO1Q08236 DED1YOR204W 1815 nt10.54□□□□□ -0.72
AVO1Q08236 RRT12YCR045C 1476 nt10.53□□□□□ -0.72
AVO1Q08236 YKR040CYKR040C 504 nt10.51□□□□□ -0.73
AVO1Q08236 YHL050CYHL050C 2094 nt10.51□□□□□ -0.73
AVO1Q08236 BOR1YNL275W 1731 nt10.48□□□□□ -0.73
AVO1Q08236 PCH2YBR186W 1695 nt10.47□□□□□ -0.73
AVO1Q08236 FMP52YER004W 696 nt10.46□□□□□ -0.73
AVO1Q08236 FMT1YBL013W 1206 nt10.45□□□□□ -0.74
AVO1Q08236 YCL042WYCL042W 360 nt10.39□□□□□ -0.75
AVO1Q08236 GID7YCL039W 2238 nt10.39□□□□□ -0.75
AVO1Q08236 SOR2YDL246C 1074 nt10.38□□□□□ -0.75
AVO1Q08236 SOR1YJR159W 1074 nt10.38□□□□□ -0.75
AVO1Q08236 CWP1YKL096W 720 nt10.38□□□□□ -0.75
AVO1Q08236 FRD1YEL047C 1413 nt10.38□□□□□ -0.75
AVO1Q08236 ADH2YMR303C 1047 nt10.36□□□□□ -0.75
AVO1Q08236 PCM1YEL058W 1674 nt10.35□□□□□ -0.75
AVO1Q08236 SPP1YPL138C 1062 nt10.35□□□□□ -0.75
AVO1Q08236 BSP1YPR171W 1731 nt10.33□□□□□ -0.76
AVO1Q08236 SNF6YHL025W 999 nt10.31□□□□□ -0.76
AVO1Q08236 RTF1YGL244W 1677 nt10.25□□□□□ -0.77
AVO1Q08236 BOP3YNL042W 1191 nt10.24□□□□□ -0.77
AVO1Q08236 PAU21YOR394W 495 nt10.24□□□□□ -0.77
AVO1Q08236 PAU22YPL282C 495 nt10.24□□□□□ -0.77
AVO1Q08236 LCB1YMR296C 1677 nt10.24□□□□□ -0.77
AVO1Q08236 SIM1YIL123W 1431 nt10.23□□□□□ -0.77
AVO1Q08236 PIB2YGL023C 1908 nt10.23□□□□□ -0.77
AVO1Q08236 ESBP6YNL125C 2022 nt10.23□□□□□ -0.77
AVO1Q08236 NPP1YCR026C 2229 nt10.2□□□□□ -0.78
AVO1Q08236 PTH1YHR189W 573 nt10.2□□□□□ -0.78
AVO1Q08236 BIO4YNR057C 714 nt10.19□□□□□ -0.78
AVO1Q08236 NCP1YHR042W 2076 nt10.19□□□□□ -0.78
AVO1Q08236 ALG12YNR030W 1656 nt10.18□□□□□ -0.78
AVO1Q08236 YIH1YCR059C 777 nt10.18□□□□□ -0.78
AVO1Q08236 HSL7YBR133C 2484 nt10.18□□□□□ -0.78
AVO1Q08236 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.17□□□□□ -0.78
AVO1Q08236 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.17□□□□□ -0.78
AVO1Q08236 DIC1YLR348C 897 nt10.16□□□□□ -0.78
AVO1Q08236 RNQ1YCL028W 1218 nt10.16□□□□□ -0.78
AVO1Q08236 SFP1YLR403W 2052 nt10.15□□□□□ -0.78
AVO1Q08236 YLR235CYLR235C 399 nt10.15□□□□□ -0.78
AVO1Q08236 ARO7YPR060C 771 nt10.14□□□□□ -0.79
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