Protein–RNA interactions for Protein: Q07350

PRP11, Pre-mRNA-splicing factor PRP11, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP11Q07350 YJL225CYJL225C 5277 nt10.49□□□□□ -0.73
PRP11Q07350 NVJ2YPR091C 2313 nt10.49□□□□□ -0.73
PRP11Q07350 SIS1YNL007C 1059 nt10.43□□□□□ -0.74
PRP11Q07350 YDL221WYDL221W 552 nt10.41□□□□□ -0.74
PRP11Q07350 PTP1YDL230W 1008 nt10.39□□□□□ -0.75
PRP11Q07350 TAT1YBR069C 1860 nt10.38□□□□□ -0.75
PRP11Q07350 YBR220CYBR220C 1683 nt10.33□□□□□ -0.76
PRP11Q07350 CAC2YML102W 1407 nt10.33□□□□□ -0.76
PRP11Q07350 SDH1YKL148C 1923 nt10.3□□□□□ -0.76
PRP11Q07350 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.29□□□□□ -0.76
PRP11Q07350 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.29□□□□□ -0.76
PRP11Q07350 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.29□□□□□ -0.76
PRP11Q07350 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.29□□□□□ -0.76
PRP11Q07350 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.29□□□□□ -0.76
PRP11Q07350 YCH1YGR203W 447 nt10.28□□□□□ -0.76
PRP11Q07350 YLR281CYLR281C 468 nt10.28□□□□□ -0.76
PRP11Q07350 PET9YBL030C 957 nt10.25□□□□□ -0.77
PRP11Q07350 ART5YGR068C 1761 nt10.22□□□□□ -0.77
PRP11Q07350 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.22□□□□□ -0.77
PRP11Q07350 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.22□□□□□ -0.77
PRP11Q07350 SCC4YER147C 1875 nt10.22□□□□□ -0.77
PRP11Q07350 WHI5YOR083W 888 nt10.22□□□□□ -0.77
PRP11Q07350 PUS2YGL063W 1113 nt10.21□□□□□ -0.77
PRP11Q07350 GFD2YCL036W 1701 nt10.21□□□□□ -0.78
PRP11Q07350 IRC15YPL017C 1500 nt10.19□□□□□ -0.78
PRP11Q07350 GIS3YLR094C 1509 nt10.14□□□□□ -0.79
PRP11Q07350 SEC11YIR022W 504 nt10.14□□□□□ -0.79
PRP11Q07350 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.14□□□□□ -0.79
PRP11Q07350 RTS2YOR077W 699 nt10.11□□□□□ -0.79
PRP11Q07350 IMP2'YIL154C 1041 nt10.1□□□□□ -0.79
PRP11Q07350 TIR4YOR009W 1464 nt10.1□□□□□ -0.79
PRP11Q07350 CUE1YMR264W 612 nt10.09□□□□□ -0.79
PRP11Q07350 YJL152WYJL152W 360 nt10.07□□□□□ -0.8
PRP11Q07350 YIL100WYIL100W 354 nt10.06□□□□□ -0.8
PRP11Q07350 YMR057CYMR057C 372 nt10.05□□□□□ -0.8
PRP11Q07350 YNL195CYNL195C 786 nt10.05□□□□□ -0.8
PRP11Q07350 DSK2YMR276W 1122 nt10.04□□□□□ -0.8
PRP11Q07350 YLR236CYLR236C 324 nt10.02□□□□□ -0.81
PRP11Q07350 PCH2YBR186W 1695 nt10□□□□□ -0.81
PRP11Q07350 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10□□□□□ -0.81
PRP11Q07350 YSC84YHR016C 1407 nt9.97□□□□□ -0.81
PRP11Q07350 FMP45YDL222C 930 nt9.94□□□□□ -0.82
PRP11Q07350 MOT3YMR070W 1473 nt9.93□□□□□ -0.82
PRP11Q07350 IDH1YNL037C 1083 nt9.93□□□□□ -0.82
PRP11Q07350 GUT2YIL155C 1950 nt9.93□□□□□ -0.82
PRP11Q07350 YPR011CYPR011C 981 nt9.9□□□□□ -0.82
PRP11Q07350 YHL050CYHL050C 2094 nt9.84□□□□□ -0.83
PRP11Q07350 RRT12YCR045C 1476 nt9.83□□□□□ -0.84
PRP11Q07350 ERV46YAL042W 1248 nt9.8□□□□□ -0.84
PRP11Q07350 BOP3YNL042W 1191 nt9.79□□□□□ -0.84
PRP11Q07350 GBP2YCL011C 1284 nt9.79□□□□□ -0.84
PRP11Q07350 RTF1YGL244W 1677 nt9.77□□□□□ -0.84
PRP11Q07350 YDR433WYDR433W 441 nt9.77□□□□□ -0.85
PRP11Q07350 LPX1YOR084W 1164 nt9.76□□□□□ -0.85
PRP11Q07350 YKR040CYKR040C 504 nt9.73□□□□□ -0.85
PRP11Q07350 FMP52YER004W 696 nt9.71□□□□□ -0.86
PRP11Q07350 TCD2YKL027W 1344 nt9.71□□□□□ -0.86
PRP11Q07350 MRPL8YJL063C 717 nt9.66□□□□□ -0.86
PRP11Q07350 PIB2YGL023C 1908 nt9.64□□□□□ -0.87
PRP11Q07350 RRD1YIL153W 1182 nt9.63□□□□□ -0.87
PRP11Q07350 MXR2YCL033C 507 nt9.62□□□□□ -0.87
PRP11Q07350 UME6YDR207C 2511 nt9.58□□□□□ -0.88
PRP11Q07350 SPP1YPL138C 1062 nt9.57□□□□□ -0.88
PRP11Q07350 ADO1YJR105W 1023 nt9.56□□□□□ -0.88
PRP11Q07350 PCM1YEL058W 1674 nt9.55□□□□□ -0.88
PRP11Q07350 YCL042WYCL042W 360 nt9.54□□□□□ -0.88
PRP11Q07350 DED1YOR204W 1815 nt9.54□□□□□ -0.88
PRP11Q07350 SIM1YIL123W 1431 nt9.53□□□□□ -0.88
PRP11Q07350 PTK1YKL198C 1989 nt9.52□□□□□ -0.89
PRP11Q07350 SNF6YHL025W 999 nt9.52□□□□□ -0.89
PRP11Q07350 NCP1YHR042W 2076 nt9.52□□□□□ -0.89
PRP11Q07350 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.51□□□□□ -0.89
PRP11Q07350 YEL076CYEL076C 651 nt9.51□□□□□ -0.89
PRP11Q07350 CWP1YKL096W 720 nt9.51□□□□□ -0.89
PRP11Q07350 YLR464WYLR464W 651 nt9.51□□□□□ -0.89
PRP11Q07350 LCB1YMR296C 1677 nt9.5□□□□□ -0.89
PRP11Q07350 FRD1YEL047C 1413 nt9.48□□□□□ -0.89
PRP11Q07350 RTG1YOL067C 534 nt9.48□□□□□ -0.89
PRP11Q07350 SOR2YDL246C 1074 nt9.47□□□□□ -0.89
PRP11Q07350 SOR1YJR159W 1074 nt9.47□□□□□ -0.89
PRP11Q07350 FMT1YBL013W 1206 nt9.46□□□□□ -0.9
PRP11Q07350 ADH2YMR303C 1047 nt9.46□□□□□ -0.9
PRP11Q07350 YFL054CYFL054C 1941 nt9.45□□□□□ -0.9
PRP11Q07350 RPM1RPM1 483 nt9.41□□□□□ -0.9
PRP11Q07350 YLR235CYLR235C 399 nt9.4□□□□□ -0.9
PRP11Q07350 BIO4YNR057C 714 nt9.4□□□□□ -0.9
PRP11Q07350 HUA1YGR268C 597 nt9.39□□□□□ -0.91
PRP11Q07350 ERF2YLR246W 1080 nt9.39□□□□□ -0.91
PRP11Q07350 BOR1YNL275W 1731 nt9.38□□□□□ -0.91
PRP11Q07350 YIH1YCR059C 777 nt9.36□□□□□ -0.91
PRP11Q07350 RNQ1YCL028W 1218 nt9.35□□□□□ -0.91
PRP11Q07350 YKL030WYKL030W 606 nt9.34□□□□□ -0.91
PRP11Q07350 SPT8YLR055C 1809 nt9.33□□□□□ -0.92
PRP11Q07350 PTH1YHR189W 573 nt9.33□□□□□ -0.92
PRP11Q07350 YLL053CYLL053C 459 nt9.29□□□□□ -0.92
PRP11Q07350 CRR1YLR213C 1269 nt9.29□□□□□ -0.92
PRP11Q07350 YFL067WYFL067W 528 nt9.28□□□□□ -0.92
PRP11Q07350 LYS4YDR234W 2082 nt9.27□□□□□ -0.93
PRP11Q07350 DIC1YLR348C 897 nt9.25□□□□□ -0.93
PRP11Q07350 HEM12YDR047W 1089 nt9.23□□□□□ -0.93
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