Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 TBPL1-204ENST00000416965 991 ntTSL 318.22■□□□□ 0.517e-29■■■■■ 81.5
FMR1Q06787 TBPL1-201ENST00000237264 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.757e-29■■■■■ 81.5
FMR1Q06787 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.216e-12■■■■■ 81.4
FMR1Q06787 SPRED2-205ENST00000440972 555 ntTSL 316.67■□□□□ 0.262e-23■■■■■ 81.3
FMR1Q06787 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.132e-23■■■■■ 81.3
FMR1Q06787 MAMDC4-205ENST00000485732 4112 ntTSL 1 (best)15.59■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 80.8
FMR1Q06787 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.731e-11■■■■■ 80.8
FMR1Q06787 RPS24-209ENST00000476545 815 ntTSL 316.57■□□□□ 0.241e-11■■■■■ 80.8
FMR1Q06787 RPS24-206ENST00000465692 778 ntTSL 214.21□□□□□ -0.131e-11■■■■■ 80.8
FMR1Q06787 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.191e-11■■■■■ 80.8
FMR1Q06787 KIAA0319L-215ENST00000478463 1489 ntTSL 228.17■■■□□ 2.15e-23■■■■■ 80.3
FMR1Q06787 KIAA0319L-209ENST00000470388 872 ntTSL 522.08■■□□□ 1.135e-23■■■■■ 80.3
FMR1Q06787 KIAA0319L-216ENST00000482929 1524 ntTSL 221.96■■□□□ 1.115e-23■■■■■ 80.3
FMR1Q06787 KIAA0319L-219ENST00000492888 872 ntTSL 320.62■□□□□ 0.895e-23■■■■■ 80.3
FMR1Q06787 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.415e-23■■■■■ 80.3
FMR1Q06787 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.325e-23■■■■■ 80.3
FMR1Q06787 KIAA0319L-208ENST00000469892 889 ntTSL 515.49■□□□□ 0.075e-23■■■■■ 80.3
FMR1Q06787 KIAA0319L-203ENST00000426982 3213 ntTSL 514.04□□□□□ -0.165e-23■■■■■ 80.3
FMR1Q06787 KIAA0319L-220ENST00000494948 766 ntTSL 411.4□□□□□ -0.585e-23■■■■■ 80.3
FMR1Q06787 KIAA0319L-205ENST00000440579 2171 ntTSL 210.85□□□□□ -0.675e-23■■■■■ 80.3
FMR1Q06787 PSMD14-203ENST00000477232 4890 ntTSL 1 (best)2.78□□□□□ -1.965e-23■■■■■ 80.3
FMR1Q06787 UBQLN4-203ENST00000472638 654 ntTSL 525.07■■□□□ 1.61e-8■■■■■ 79.6
FMR1Q06787 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.911e-8■■■■■ 79.6
FMR1Q06787 AC018521.1-202ENST00000641877 2655 ntBASIC14.38□□□□□ -0.111e-22■■■■■ 79.3
FMR1Q06787 AC018521.1-201ENST00000582262 575 ntTSL 412.44□□□□□ -0.421e-22■■■■■ 79.3
FMR1Q06787 CBFA2T3-204ENST00000563640 664 ntTSL 220.12■□□□□ 0.813e-8■■■■■ 79.2
FMR1Q06787 CBFA2T3-211ENST00000570046 284 ntTSL 311.93□□□□□ -0.53e-8■■■■■ 79.2
FMR1Q06787 TRAPPC12-204ENST00000415624 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.22□□□□□ -0.299e-14■■■■■ 78.3
FMR1Q06787 BHLHE40-203ENST00000467610 1366 ntTSL 221.42■■□□□ 1.022e-8■■■■■ 78.1
FMR1Q06787 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.132e-8■■■■■ 78.1
FMR1Q06787 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.158e-10■■■■■ 77.9
FMR1Q06787 CCM2-211ENST00000478582 937 ntTSL 332.99■■■□□ 2.878e-10■■■■■ 77.9
FMR1Q06787 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.848e-10■■■■■ 77.9
FMR1Q06787 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.588e-10■■■■■ 77.9
FMR1Q06787 CCM2-216ENST00000488727 1719 ntTSL 523.16■■□□□ 1.38e-10■■■■■ 77.9
FMR1Q06787 CCM2-203ENST00000461377 1983 ntTSL 522.96■■□□□ 1.278e-10■■■■■ 77.9
FMR1Q06787 ZNF638-204ENST00000410075 3518 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.42e-25■■■■■ 76.5
FMR1Q06787 TMPO-213ENST00000556678 713 ntTSL 56.96□□□□□ -1.32e-21■■■■■ 75.2
FMR1Q06787 TMPO-211ENST00000552831 743 ntTSL 26.53□□□□□ -1.362e-21■■■■■ 75.2
FMR1Q06787 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.533e-15■■■■■ 74.8
FMR1Q06787 GOLGA4-209ENST00000450863 1617 ntTSL 524.46■■□□□ 1.513e-15■■■■■ 74.8
FMR1Q06787 GOLGA4-203ENST00000419177 760 ntTSL 319.33■□□□□ 0.683e-15■■■■■ 74.8
FMR1Q06787 GOLGA4-205ENST00000431105 568 ntTSL 317.7■□□□□ 0.423e-15■■■■■ 74.8
FMR1Q06787 GOLGA4-206ENST00000435830 4152 ntTSL 1 (best)11.18□□□□□ -0.623e-15■■■■■ 74.8
FMR1Q06787 AC087235.1-201ENST00000538297 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.321e-8■■■■■ 74.7
FMR1Q06787 PABPC1L-211ENST00000476056 1214 ntTSL 515.15■□□□□ 0.026e-41■■■■■ 73.6
FMR1Q06787 PABPC1L-207ENST00000372824 2223 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.016e-41■■■■■ 73.6
FMR1Q06787 PABPC1L-214ENST00000482486 541 ntTSL 212.87□□□□□ -0.356e-41■■■■■ 73.6
FMR1Q06787 PABPC1L-212ENST00000479873 1178 ntTSL 212.2□□□□□ -0.466e-41■■■■■ 73.6
FMR1Q06787 PABPC1L-203ENST00000217075 670 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.716e-41■■■■■ 73.6
FMR1Q06787 PABPC1L-206ENST00000372822 536 ntTSL 58.66□□□□□ -1.026e-41■■■■■ 73.6
FMR1Q06787 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.978e-26■■■■■ 73.4
FMR1Q06787 PSMG4-201ENST00000324987 778 ntTSL 334.14■■■■□ 3.061e-40■■■■■ 73.1
FMR1Q06787 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.431e-40■■■■■ 73.1
FMR1Q06787 NDUFA11-204ENST00000591341 403 ntTSL 220.61■□□□□ 0.896e-21■■■■■ 73.1
FMR1Q06787 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.821e-40■■■■■ 73.1
FMR1Q06787 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.84e-19■■■■■ 72.8
FMR1Q06787 CEP57-208ENST00000538095 590 ntTSL 419.6■□□□□ 0.734e-19■■■■■ 72.8
FMR1Q06787 CEP57-214ENST00000541365 870 ntTSL 319.24■□□□□ 0.674e-19■■■■■ 72.8
FMR1Q06787 CEP57-216ENST00000544522 851 ntTSL 218.82■□□□□ 0.64e-19■■■■■ 72.8
FMR1Q06787 CEP57-204ENST00000535497 446 ntTSL 318.08■□□□□ 0.484e-19■■■■■ 72.8
FMR1Q06787 CEP57-211ENST00000539855 1739 ntTSL 517.3■□□□□ 0.364e-19■■■■■ 72.8
FMR1Q06787 CEP57-212ENST00000540830 1936 ntTSL 1 (best)17.2■□□□□ 0.344e-19■■■■■ 72.8
FMR1Q06787 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.044e-19■■■■■ 72.8
FMR1Q06787 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.054e-19■■■■■ 72.8
FMR1Q06787 CEP57-210ENST00000538658 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.074e-19■■■■■ 72.8
FMR1Q06787 RSBN1-206ENST00000616024 2703 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.254e-19■■■■■ 72.8
FMR1Q06787 RSBN1-203ENST00000476412 3772 ntTSL 211.66□□□□□ -0.544e-19■■■■■ 72.8
FMR1Q06787 CEP57-201ENST00000325486 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.624e-19■■■■■ 72.8
FMR1Q06787 CEP57-202ENST00000325542 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.654e-19■■■■■ 72.8
FMR1Q06787 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.044e-19■■■■■ 72.8
FMR1Q06787 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.941e-12■■■■■ 72.5
FMR1Q06787 RPTOR-206ENST00000573746 688 ntTSL 212.84□□□□□ -0.351e-20■■■■■ 72.1
FMR1Q06787 ZNF638-222ENST00000491843 332 ntTSL 38.88□□□□□ -0.992e-9■■■■■ 71.8
FMR1Q06787 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.322e-9■■■■■ 71.8
FMR1Q06787 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.652e-9■■■■■ 71.8
FMR1Q06787 TPTEP1-202ENST00000400593 1430 ntTSL 1 (best)19.47■□□□□ 0.714e-7■■■■■ 71.4
FMR1Q06787 ATP2C1-217ENST00000509662 559 ntTSL 429.71■■■□□ 2.352e-20■■■■■ 71.1
FMR1Q06787 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.52e-20■■■■■ 71.1
FMR1Q06787 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.42e-20■■■■■ 71.1
FMR1Q06787 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 316.72■□□□□ 0.272e-20■■■■■ 71.1
FMR1Q06787 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.232e-20■■■■■ 71.1
FMR1Q06787 ATP2C1-209ENST00000505072 556 ntTSL 416.35■□□□□ 0.212e-20■■■■■ 71.1
FMR1Q06787 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.172e-20■■■■■ 71.1
FMR1Q06787 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 515.99■□□□□ 0.152e-20■■■■■ 71.1
FMR1Q06787 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.132e-20■■■■■ 71.1
FMR1Q06787 ATP2C1-204ENST00000428331 4795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.462e-20■■■■■ 71.1
FMR1Q06787 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.022e-20■■■■■ 71.1
FMR1Q06787 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.262e-20■■■■■ 71.1
FMR1Q06787 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.472e-20■■■■■ 71.1
FMR1Q06787 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.52e-20■■■■■ 71.1
FMR1Q06787 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.562e-20■■■■■ 71.1
FMR1Q06787 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.712e-20■■■■■ 71.1
FMR1Q06787 CHCHD3-205ENST00000481152 1367 ntTSL 27.4□□□□□ -1.226e-11■■■■■ 70.7
FMR1Q06787 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.166e-14■■■■■ 70.4
FMR1Q06787 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.896e-14■■■■■ 70.4
FMR1Q06787 TRAPPC12-206ENST00000417243 1047 ntTSL 514.76□□□□□ -0.056e-14■■■■■ 70.4
FMR1Q06787 ZNF441-203ENST00000462251 560 ntTSL 414.12□□□□□ -0.153e-11■■■■■ 70.3
FMR1Q06787 ZNF441-202ENST00000409902 2828 ntTSL 211.68□□□□□ -0.543e-11■■■■■ 70.3
FMR1Q06787 ZNF441-201ENST00000357901 4356 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.853e-11■■■■■ 70.3
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 42.5 ms