Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 SDH1YKL148C 1923 nt11.88□□□□□ -0.51
YHC1Q05900 TAT1YBR069C 1860 nt11.87□□□□□ -0.51
YHC1Q05900 ART5YGR068C 1761 nt11.86□□□□□ -0.51
YHC1Q05900 IRC15YPL017C 1500 nt11.86□□□□□ -0.51
YHC1Q05900 GFD2YCL036W 1701 nt11.84□□□□□ -0.51
YHC1Q05900 PET9YBL030C 957 nt11.77□□□□□ -0.53
YHC1Q05900 SCC4YER147C 1875 nt11.76□□□□□ -0.53
YHC1Q05900 GIS3YLR094C 1509 nt11.76□□□□□ -0.53
YHC1Q05900 TIR4YOR009W 1464 nt11.75□□□□□ -0.53
YHC1Q05900 YOL037CYOL037C 354 nt11.73□□□□□ -0.53
YHC1Q05900 NPL3YDR432W 1245 nt11.71□□□□□ -0.53
YHC1Q05900 RTS2YOR077W 699 nt11.71□□□□□ -0.53
YHC1Q05900 YOR139CYOR139C 393 nt11.71□□□□□ -0.53
YHC1Q05900 YCH1YGR203W 447 nt11.7□□□□□ -0.54
YHC1Q05900 YMR057CYMR057C 372 nt11.64□□□□□ -0.55
YHC1Q05900 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.63□□□□□ -0.55
YHC1Q05900 CUE1YMR264W 612 nt11.61□□□□□ -0.55
YHC1Q05900 YJL152WYJL152W 360 nt11.56□□□□□ -0.56
YHC1Q05900 FPS1YLL043W 2010 nt11.55□□□□□ -0.56
YHC1Q05900 SEC11YIR022W 504 nt11.52□□□□□ -0.57
YHC1Q05900 PCH2YBR186W 1695 nt11.51□□□□□ -0.57
YHC1Q05900 YSC84YHR016C 1407 nt11.51□□□□□ -0.57
YHC1Q05900 YLR281CYLR281C 468 nt11.5□□□□□ -0.57
YHC1Q05900 WHI5YOR083W 888 nt11.5□□□□□ -0.57
YHC1Q05900 YHL050CYHL050C 2094 nt11.47□□□□□ -0.57
YHC1Q05900 GUT2YIL155C 1950 nt11.47□□□□□ -0.57
YHC1Q05900 YIL100WYIL100W 354 nt11.44□□□□□ -0.58
YHC1Q05900 RRT12YCR045C 1476 nt11.44□□□□□ -0.58
YHC1Q05900 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.43□□□□□ -0.58
YHC1Q05900 YLR236CYLR236C 324 nt11.42□□□□□ -0.58
YHC1Q05900 YNL195CYNL195C 786 nt11.36□□□□□ -0.59
YHC1Q05900 PIB2YGL023C 1908 nt11.34□□□□□ -0.59
YHC1Q05900 PUS2YGL063W 1113 nt11.29□□□□□ -0.6
YHC1Q05900 IDH1YNL037C 1083 nt11.29□□□□□ -0.6
YHC1Q05900 PAC11YDR488C 1602 nt11.27□□□□□ -0.6
YHC1Q05900 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.27□□□□□ -0.61
YHC1Q05900 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.27□□□□□ -0.61
YHC1Q05900 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.27□□□□□ -0.61
YHC1Q05900 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.27□□□□□ -0.61
YHC1Q05900 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.27□□□□□ -0.61
YHC1Q05900 RRD1YIL153W 1182 nt11.25□□□□□ -0.61
YHC1Q05900 GBP2YCL011C 1284 nt11.25□□□□□ -0.61
YHC1Q05900 RTF1YGL244W 1677 nt11.24□□□□□ -0.61
YHC1Q05900 IMP2'YIL154C 1041 nt11.23□□□□□ -0.61
YHC1Q05900 DSK2YMR276W 1122 nt11.22□□□□□ -0.61
YHC1Q05900 YPR011CYPR011C 981 nt11.2□□□□□ -0.62
YHC1Q05900 DED1YOR204W 1815 nt11.19□□□□□ -0.62
YHC1Q05900 BOP3YNL042W 1191 nt11.17□□□□□ -0.62
YHC1Q05900 NCP1YHR042W 2076 nt11.16□□□□□ -0.62
YHC1Q05900 TCD2YKL027W 1344 nt11.15□□□□□ -0.62
YHC1Q05900 NVJ2YPR091C 2313 nt11.12□□□□□ -0.63
YHC1Q05900 FMP52YER004W 696 nt11.11□□□□□ -0.63
YHC1Q05900 FMT1YBL013W 1206 nt11.11□□□□□ -0.63
YHC1Q05900 FMP45YDL222C 930 nt11.1□□□□□ -0.63
YHC1Q05900 PTK1YKL198C 1989 nt11.1□□□□□ -0.63
YHC1Q05900 YDR433WYDR433W 441 nt11.09□□□□□ -0.63
YHC1Q05900 LCB1YMR296C 1677 nt11.08□□□□□ -0.64
YHC1Q05900 MXR2YCL033C 507 nt11.07□□□□□ -0.64
YHC1Q05900 PCM1YEL058W 1674 nt11.05□□□□□ -0.64
YHC1Q05900 ERV46YAL042W 1248 nt11.04□□□□□ -0.64
YHC1Q05900 LPX1YOR084W 1164 nt11.03□□□□□ -0.64
YHC1Q05900 ADH2YMR303C 1047 nt11.01□□□□□ -0.65
YHC1Q05900 CWP1YKL096W 720 nt10.99□□□□□ -0.65
YHC1Q05900 YKR040CYKR040C 504 nt10.98□□□□□ -0.65
YHC1Q05900 SOR2YDL246C 1074 nt10.97□□□□□ -0.65
YHC1Q05900 SOR1YJR159W 1074 nt10.97□□□□□ -0.65
YHC1Q05900 SIM1YIL123W 1431 nt10.95□□□□□ -0.66
YHC1Q05900 SNF6YHL025W 999 nt10.93□□□□□ -0.66
YHC1Q05900 FRD1YEL047C 1413 nt10.92□□□□□ -0.66
YHC1Q05900 YCL042WYCL042W 360 nt10.91□□□□□ -0.66
YHC1Q05900 BIO4YNR057C 714 nt10.9□□□□□ -0.66
YHC1Q05900 LYS4YDR234W 2082 nt10.87□□□□□ -0.67
YHC1Q05900 YFL054CYFL054C 1941 nt10.86□□□□□ -0.67
YHC1Q05900 YIH1YCR059C 777 nt10.82□□□□□ -0.68
YHC1Q05900 RNQ1YCL028W 1218 nt10.79□□□□□ -0.68
YHC1Q05900 SPT8YLR055C 1809 nt10.79□□□□□ -0.68
YHC1Q05900 YLL053CYLL053C 459 nt10.75□□□□□ -0.69
YHC1Q05900 ERF2YLR246W 1080 nt10.73□□□□□ -0.69
YHC1Q05900 SPP1YPL138C 1062 nt10.73□□□□□ -0.69
YHC1Q05900 CRR1YLR213C 1269 nt10.71□□□□□ -0.69
YHC1Q05900 DIC1YLR348C 897 nt10.71□□□□□ -0.69
YHC1Q05900 MOT3YMR070W 1473 nt10.69□□□□□ -0.7
YHC1Q05900 ATF2YGR177C 1608 nt10.67□□□□□ -0.7
YHC1Q05900 YJL225CYJL225C 5277 nt10.66□□□□□ -0.7
YHC1Q05900 FTR1YER145C 1215 nt10.66□□□□□ -0.7
YHC1Q05900 PTH1YHR189W 573 nt10.63□□□□□ -0.71
YHC1Q05900 GAL1YBR020W 1587 nt10.63□□□□□ -0.71
YHC1Q05900 SWE1YJL187C 2460 nt10.62□□□□□ -0.71
YHC1Q05900 MIC10YCL057C-A 294 nt10.61□□□□□ -0.71
YHC1Q05900 TRM5YHR070W 1500 nt10.61□□□□□ -0.71
YHC1Q05900 HEM12YDR047W 1089 nt10.6□□□□□ -0.71
YHC1Q05900 YFL067WYFL067W 528 nt10.6□□□□□ -0.71
YHC1Q05900 YLR235CYLR235C 399 nt10.59□□□□□ -0.71
YHC1Q05900 SNG1YGR197C 1644 nt10.58□□□□□ -0.72
YHC1Q05900 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.58□□□□□ -0.72
YHC1Q05900 DDR2YOL052C-A 186 nt10.55□□□□□ -0.72
YHC1Q05900 TIM23YNR017W 669 nt10.54□□□□□ -0.72
YHC1Q05900 AQY1YPR192W 918 nt10.52□□□□□ -0.73
YHC1Q05900 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.51□□□□□ -0.73
YHC1Q05900 YLR179CYLR179C 606 nt10.5□□□□□ -0.73
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