Protein–RNA interactions for Protein: Q05166

ASM4, Nucleoporin ASM4, yeastyeast

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ASM4Q05166 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.46□□□□□ -0.73
ASM4Q05166 MNP1YGL068W 585 nt10.45□□□□□ -0.74
ASM4Q05166 YKL097CYKL097C 411 nt10.44□□□□□ -0.74
ASM4Q05166 SIS1YNL007C 1059 nt10.44□□□□□ -0.74
ASM4Q05166 PCH2YBR186W 1695 nt10.41□□□□□ -0.74
ASM4Q05166 SCC4YER147C 1875 nt10.4□□□□□ -0.75
ASM4Q05166 GUT2YIL155C 1950 nt10.36□□□□□ -0.75
ASM4Q05166 RKM5YLR137W 1104 nt10.36□□□□□ -0.75
ASM4Q05166 SEC11YIR022W 504 nt10.35□□□□□ -0.75
ASM4Q05166 ART5YGR068C 1761 nt10.34□□□□□ -0.75
ASM4Q05166 IRC15YPL017C 1500 nt10.33□□□□□ -0.76
ASM4Q05166 GIS3YLR094C 1509 nt10.3□□□□□ -0.76
ASM4Q05166 GFD2YCL036W 1701 nt10.3□□□□□ -0.76
ASM4Q05166 RTS2YOR077W 699 nt10.25□□□□□ -0.77
ASM4Q05166 YSC84YHR016C 1407 nt10.24□□□□□ -0.77
ASM4Q05166 PET9YBL030C 957 nt10.23□□□□□ -0.77
ASM4Q05166 TIR4YOR009W 1464 nt10.22□□□□□ -0.77
ASM4Q05166 NME1NME1 340 nt10.21□□□□□ -0.77
ASM4Q05166 NVJ2YPR091C 2313 nt10.21□□□□□ -0.78
ASM4Q05166 PIB2YGL023C 1908 nt10.17□□□□□ -0.78
ASM4Q05166 YMR057CYMR057C 372 nt10.16□□□□□ -0.78
ASM4Q05166 YCH1YGR203W 447 nt10.15□□□□□ -0.78
ASM4Q05166 YHL050CYHL050C 2094 nt10.14□□□□□ -0.79
ASM4Q05166 YJL152WYJL152W 360 nt10.13□□□□□ -0.79
ASM4Q05166 NPL3YDR432W 1245 nt10.12□□□□□ -0.79
ASM4Q05166 YOL037CYOL037C 354 nt10.12□□□□□ -0.79
ASM4Q05166 RTF1YGL244W 1677 nt10.12□□□□□ -0.79
ASM4Q05166 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.1□□□□□ -0.79
ASM4Q05166 CUE1YMR264W 612 nt10.1□□□□□ -0.79
ASM4Q05166 RRT12YCR045C 1476 nt10.09□□□□□ -0.79
ASM4Q05166 YOR139CYOR139C 393 nt10.08□□□□□ -0.8
ASM4Q05166 FPS1YLL043W 2010 nt10.02□□□□□ -0.8
ASM4Q05166 YNL195CYNL195C 786 nt10.02□□□□□ -0.81
ASM4Q05166 YIL100WYIL100W 354 nt10.01□□□□□ -0.81
ASM4Q05166 BOP3YNL042W 1191 nt10.01□□□□□ -0.81
ASM4Q05166 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.98□□□□□ -0.81
ASM4Q05166 YLR236CYLR236C 324 nt9.96□□□□□ -0.82
ASM4Q05166 WHI5YOR083W 888 nt9.96□□□□□ -0.82
ASM4Q05166 PTK1YKL198C 1989 nt9.95□□□□□ -0.82
ASM4Q05166 YLR281CYLR281C 468 nt9.93□□□□□ -0.82
ASM4Q05166 IDH1YNL037C 1083 nt9.81□□□□□ -0.84
ASM4Q05166 GBP2YCL011C 1284 nt9.8□□□□□ -0.84
ASM4Q05166 NCP1YHR042W 2076 nt9.79□□□□□ -0.84
ASM4Q05166 PUS2YGL063W 1113 nt9.79□□□□□ -0.84
ASM4Q05166 YFL054CYFL054C 1941 nt9.79□□□□□ -0.84
ASM4Q05166 RRD1YIL153W 1182 nt9.75□□□□□ -0.85
ASM4Q05166 BOR1YNL275W 1731 nt9.75□□□□□ -0.85
ASM4Q05166 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.71□□□□□ -0.86
ASM4Q05166 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.71□□□□□ -0.86
ASM4Q05166 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.71□□□□□ -0.86
ASM4Q05166 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.71□□□□□ -0.86
ASM4Q05166 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.71□□□□□ -0.86
ASM4Q05166 DSK2YMR276W 1122 nt9.71□□□□□ -0.86
ASM4Q05166 SPT8YLR055C 1809 nt9.7□□□□□ -0.86
ASM4Q05166 TCD2YKL027W 1344 nt9.7□□□□□ -0.86
ASM4Q05166 DED1YOR204W 1815 nt9.69□□□□□ -0.86
ASM4Q05166 IMP2'YIL154C 1041 nt9.68□□□□□ -0.86
ASM4Q05166 YPR011CYPR011C 981 nt9.68□□□□□ -0.86
ASM4Q05166 YDR433WYDR433W 441 nt9.67□□□□□ -0.86
ASM4Q05166 LCB1YMR296C 1677 nt9.64□□□□□ -0.87
ASM4Q05166 MXR2YCL033C 507 nt9.64□□□□□ -0.87
ASM4Q05166 FMT1YBL013W 1206 nt9.63□□□□□ -0.87
ASM4Q05166 FMP52YER004W 696 nt9.62□□□□□ -0.87
ASM4Q05166 FMP45YDL222C 930 nt9.61□□□□□ -0.87
ASM4Q05166 PCM1YEL058W 1674 nt9.61□□□□□ -0.87
ASM4Q05166 YGR139WYGR139W 339 nt9.59□□□□□ -0.87
ASM4Q05166 CWP1YKL096W 720 nt9.59□□□□□ -0.87
ASM4Q05166 ADH2YMR303C 1047 nt9.58□□□□□ -0.88
ASM4Q05166 SIM1YIL123W 1431 nt9.56□□□□□ -0.88
ASM4Q05166 LPX1YOR084W 1164 nt9.56□□□□□ -0.88
ASM4Q05166 SNF6YHL025W 999 nt9.53□□□□□ -0.88
ASM4Q05166 ERV46YAL042W 1248 nt9.52□□□□□ -0.89
ASM4Q05166 YCL042WYCL042W 360 nt9.51□□□□□ -0.89
ASM4Q05166 UME6YDR207C 2511 nt9.51□□□□□ -0.89
ASM4Q05166 SWE1YJL187C 2460 nt9.5□□□□□ -0.89
ASM4Q05166 YKR040CYKR040C 504 nt9.5□□□□□ -0.89
ASM4Q05166 HSP60YLR259C 1719 nt9.48□□□□□ -0.89
ASM4Q05166 YJL225CYJL225C 5277 nt9.47□□□□□ -0.89
ASM4Q05166 SOR2YDL246C 1074 nt9.47□□□□□ -0.89
ASM4Q05166 SOR1YJR159W 1074 nt9.47□□□□□ -0.89
ASM4Q05166 BIO4YNR057C 714 nt9.47□□□□□ -0.89
ASM4Q05166 LYS4YDR234W 2082 nt9.47□□□□□ -0.89
ASM4Q05166 FRD1YEL047C 1413 nt9.45□□□□□ -0.9
ASM4Q05166 GLK1YCL040W 1503 nt9.37□□□□□ -0.91
ASM4Q05166 YIH1YCR059C 777 nt9.37□□□□□ -0.91
ASM4Q05166 YLL053CYLL053C 459 nt9.36□□□□□ -0.91
ASM4Q05166 MCH5YOR306C 1566 nt9.35□□□□□ -0.91
ASM4Q05166 RNQ1YCL028W 1218 nt9.35□□□□□ -0.91
ASM4Q05166 ALG12YNR030W 1656 nt9.34□□□□□ -0.91
ASM4Q05166 ERF2YLR246W 1080 nt9.33□□□□□ -0.92
ASM4Q05166 SPP1YPL138C 1062 nt9.3□□□□□ -0.92
ASM4Q05166 CRR1YLR213C 1269 nt9.29□□□□□ -0.92
ASM4Q05166 DIC1YLR348C 897 nt9.29□□□□□ -0.92
ASM4Q05166 ATF2YGR177C 1608 nt9.27□□□□□ -0.92
ASM4Q05166 FUR4YBR021W 1902 nt9.27□□□□□ -0.93
ASM4Q05166 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.27□□□□□ -0.93
ASM4Q05166 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.27□□□□□ -0.93
ASM4Q05166 PTH1YHR189W 573 nt9.27□□□□□ -0.93
ASM4Q05166 FTR1YER145C 1215 nt9.25□□□□□ -0.93
ASM4Q05166 MIC10YCL057C-A 294 nt9.25□□□□□ -0.93
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