Protein–RNA interactions for Protein: Q04370

PEX12, Peroxisome assembly protein 12, yeastyeast

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEX12Q04370 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.77□□□□□ -0.53
PEX12Q04370 ART5YGR068C 1761 nt11.77□□□□□ -0.53
PEX12Q04370 GIS3YLR094C 1509 nt11.76□□□□□ -0.53
PEX12Q04370 GFD2YCL036W 1701 nt11.74□□□□□ -0.53
PEX12Q04370 PET9YBL030C 957 nt11.69□□□□□ -0.54
PEX12Q04370 SEC11YIR022W 504 nt11.68□□□□□ -0.54
PEX12Q04370 MNP1YGL068W 585 nt11.67□□□□□ -0.54
PEX12Q04370 PCH2YBR186W 1695 nt11.67□□□□□ -0.54
PEX12Q04370 RTS2YOR077W 699 nt11.65□□□□□ -0.54
PEX12Q04370 RKM5YLR137W 1104 nt11.64□□□□□ -0.55
PEX12Q04370 YCH1YGR203W 447 nt11.63□□□□□ -0.55
PEX12Q04370 GUT2YIL155C 1950 nt11.62□□□□□ -0.55
PEX12Q04370 TIR4YOR009W 1464 nt11.58□□□□□ -0.56
PEX12Q04370 YSC84YHR016C 1407 nt11.57□□□□□ -0.56
PEX12Q04370 CUE1YMR264W 612 nt11.56□□□□□ -0.56
PEX12Q04370 YKL097CYKL097C 411 nt11.55□□□□□ -0.56
PEX12Q04370 YHL050CYHL050C 2094 nt11.5□□□□□ -0.57
PEX12Q04370 YMR057CYMR057C 372 nt11.5□□□□□ -0.57
PEX12Q04370 PAC11YDR488C 1602 nt11.46□□□□□ -0.58
PEX12Q04370 YIL100WYIL100W 354 nt11.44□□□□□ -0.58
PEX12Q04370 RRT12YCR045C 1476 nt11.44□□□□□ -0.58
PEX12Q04370 PIB2YGL023C 1908 nt11.43□□□□□ -0.58
PEX12Q04370 NPL3YDR432W 1245 nt11.43□□□□□ -0.58
PEX12Q04370 YNL195CYNL195C 786 nt11.43□□□□□ -0.58
PEX12Q04370 FPS1YLL043W 2010 nt11.43□□□□□ -0.58
PEX12Q04370 RTF1YGL244W 1677 nt11.37□□□□□ -0.59
PEX12Q04370 YJL152WYJL152W 360 nt11.37□□□□□ -0.59
PEX12Q04370 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.37□□□□□ -0.59
PEX12Q04370 YLR236CYLR236C 324 nt11.37□□□□□ -0.59
PEX12Q04370 YOL037CYOL037C 354 nt11.35□□□□□ -0.59
PEX12Q04370 BOP3YNL042W 1191 nt11.3□□□□□ -0.6
PEX12Q04370 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.3□□□□□ -0.6
PEX12Q04370 PTK1YKL198C 1989 nt11.2□□□□□ -0.62
PEX12Q04370 YJL225CYJL225C 5277 nt11.2□□□□□ -0.62
PEX12Q04370 NCP1YHR042W 2076 nt11.18□□□□□ -0.62
PEX12Q04370 YOR139CYOR139C 393 nt11.14□□□□□ -0.63
PEX12Q04370 WHI5YOR083W 888 nt11.13□□□□□ -0.63
PEX12Q04370 YLR281CYLR281C 468 nt11.1□□□□□ -0.63
PEX12Q04370 IDH1YNL037C 1083 nt11.05□□□□□ -0.64
PEX12Q04370 RRD1YIL153W 1182 nt11.04□□□□□ -0.64
PEX12Q04370 LCB1YMR296C 1677 nt11.04□□□□□ -0.64
PEX12Q04370 GBP2YCL011C 1284 nt11.01□□□□□ -0.65
PEX12Q04370 FMP52YER004W 696 nt10.99□□□□□ -0.65
PEX12Q04370 YFL054CYFL054C 1941 nt10.97□□□□□ -0.65
PEX12Q04370 NVJ2YPR091C 2313 nt10.97□□□□□ -0.65
PEX12Q04370 TCD2YKL027W 1344 nt10.96□□□□□ -0.65
PEX12Q04370 DED1YOR204W 1815 nt10.95□□□□□ -0.66
PEX12Q04370 PCM1YEL058W 1674 nt10.92□□□□□ -0.66
PEX12Q04370 IMP2'YIL154C 1041 nt10.92□□□□□ -0.66
PEX12Q04370 SPT8YLR055C 1809 nt10.91□□□□□ -0.66
PEX12Q04370 SIM1YIL123W 1431 nt10.89□□□□□ -0.67
PEX12Q04370 FMT1YBL013W 1206 nt10.88□□□□□ -0.67
PEX12Q04370 PUS2YGL063W 1113 nt10.86□□□□□ -0.67
PEX12Q04370 DSK2YMR276W 1122 nt10.86□□□□□ -0.67
PEX12Q04370 LYS4YDR234W 2082 nt10.83□□□□□ -0.68
PEX12Q04370 CWP1YKL096W 720 nt10.82□□□□□ -0.68
PEX12Q04370 ADH2YMR303C 1047 nt10.82□□□□□ -0.68
PEX12Q04370 YDR433WYDR433W 441 nt10.81□□□□□ -0.68
PEX12Q04370 SNF6YHL025W 999 nt10.81□□□□□ -0.68
PEX12Q04370 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.8□□□□□ -0.68
PEX12Q04370 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.8□□□□□ -0.68
PEX12Q04370 BIO4YNR057C 714 nt10.79□□□□□ -0.68
PEX12Q04370 FMP45YDL222C 930 nt10.76□□□□□ -0.69
PEX12Q04370 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.76□□□□□ -0.69
PEX12Q04370 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.76□□□□□ -0.69
PEX12Q04370 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.76□□□□□ -0.69
PEX12Q04370 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.76□□□□□ -0.69
PEX12Q04370 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.76□□□□□ -0.69
PEX12Q04370 MXR2YCL033C 507 nt10.76□□□□□ -0.69
PEX12Q04370 SOR2YDL246C 1074 nt10.75□□□□□ -0.69
PEX12Q04370 SOR1YJR159W 1074 nt10.75□□□□□ -0.69
PEX12Q04370 YPR011CYPR011C 981 nt10.74□□□□□ -0.69
PEX12Q04370 YCL042WYCL042W 360 nt10.72□□□□□ -0.69
PEX12Q04370 SWE1YJL187C 2460 nt10.71□□□□□ -0.69
PEX12Q04370 ERV46YAL042W 1248 nt10.69□□□□□ -0.7
PEX12Q04370 BOR1YNL275W 1731 nt10.68□□□□□ -0.7
PEX12Q04370 ERF2YLR246W 1080 nt10.68□□□□□ -0.7
PEX12Q04370 YIH1YCR059C 777 nt10.67□□□□□ -0.7
PEX12Q04370 YKR040CYKR040C 504 nt10.66□□□□□ -0.7
PEX12Q04370 LPX1YOR084W 1164 nt10.65□□□□□ -0.7
PEX12Q04370 CRR1YLR213C 1269 nt10.64□□□□□ -0.71
PEX12Q04370 FRD1YEL047C 1413 nt10.63□□□□□ -0.71
PEX12Q04370 RNQ1YCL028W 1218 nt10.62□□□□□ -0.71
PEX12Q04370 YLL053CYLL053C 459 nt10.61□□□□□ -0.71
PEX12Q04370 HEM12YDR047W 1089 nt10.56□□□□□ -0.72
PEX12Q04370 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.55□□□□□ -0.72
PEX12Q04370 ATF2YGR177C 1608 nt10.55□□□□□ -0.72
PEX12Q04370 FTR1YER145C 1215 nt10.52□□□□□ -0.73
PEX12Q04370 YFL067WYFL067W 528 nt10.52□□□□□ -0.73
PEX12Q04370 MIC10YCL057C-A 294 nt10.52□□□□□ -0.73
PEX12Q04370 HSP60YLR259C 1719 nt10.52□□□□□ -0.73
PEX12Q04370 DIC1YLR348C 897 nt10.5□□□□□ -0.73
PEX12Q04370 SNG1YGR197C 1644 nt10.5□□□□□ -0.73
PEX12Q04370 RAX1YOR301W 1308 nt10.48□□□□□ -0.73
PEX12Q04370 GAL1YBR020W 1587 nt10.48□□□□□ -0.73
PEX12Q04370 TRM5YHR070W 1500 nt10.47□□□□□ -0.73
PEX12Q04370 DDR2YOL052C-A 186 nt10.45□□□□□ -0.74
PEX12Q04370 GLK1YCL040W 1503 nt10.44□□□□□ -0.74
PEX12Q04370 CCA1YER168C 1641 nt10.43□□□□□ -0.74
PEX12Q04370 FUR4YBR021W 1902 nt10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.4 ms