Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 DCW1YKL046C 1350 nt15.16■□□□□ 0.02
CSI1Q04368 PTP1YDL230W 1008 nt15.16■□□□□ 0.02
CSI1Q04368 RPP2AYOL039W 321 nt15.14■□□□□ 0.01
CSI1Q04368 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.11■□□□□ 0.01
CSI1Q04368 PUS2YGL063W 1113 nt15.09■□□□□ 0.01
CSI1Q04368 CAC2YML102W 1407 nt15.04■□□□□ -0
CSI1Q04368 TIR4YOR009W 1464 nt15.02■□□□□ -0
CSI1Q04368 ART5YGR068C 1761 nt15.01□□□□□ -0.01
CSI1Q04368 YCH1YGR203W 447 nt14.97□□□□□ -0.01
CSI1Q04368 YJL152WYJL152W 360 nt14.97□□□□□ -0.01
CSI1Q04368 SSA4YER103W 1929 nt14.96□□□□□ -0.01
CSI1Q04368 GFD2YCL036W 1701 nt14.93□□□□□ -0.02
CSI1Q04368 YPR011CYPR011C 981 nt14.93□□□□□ -0.02
CSI1Q04368 EMI2YDR516C 1503 nt14.92□□□□□ -0.02
CSI1Q04368 YLR236CYLR236C 324 nt14.89□□□□□ -0.03
CSI1Q04368 PET9YBL030C 957 nt14.86□□□□□ -0.03
CSI1Q04368 YMR057CYMR057C 372 nt14.84□□□□□ -0.03
CSI1Q04368 DSK2YMR276W 1122 nt14.84□□□□□ -0.03
CSI1Q04368 YDL221WYDL221W 552 nt14.81□□□□□ -0.04
CSI1Q04368 IRC15YPL017C 1500 nt14.8□□□□□ -0.04
CSI1Q04368 RTS2YOR077W 699 nt14.78□□□□□ -0.04
CSI1Q04368 IMP2'YIL154C 1041 nt14.73□□□□□ -0.05
CSI1Q04368 FMP45YDL222C 930 nt14.72□□□□□ -0.05
CSI1Q04368 YMR090WYMR090W 684 nt14.69□□□□□ -0.06
CSI1Q04368 IDH1YNL037C 1083 nt14.69□□□□□ -0.06
CSI1Q04368 GIS3YLR094C 1509 nt14.66□□□□□ -0.06
CSI1Q04368 FPS1YLL043W 2010 nt14.65□□□□□ -0.06
CSI1Q04368 YBR220CYBR220C 1683 nt14.63□□□□□ -0.07
CSI1Q04368 LPX1YOR084W 1164 nt14.62□□□□□ -0.07
CSI1Q04368 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt14.62□□□□□ -0.07
CSI1Q04368 SDH1YKL148C 1923 nt14.61□□□□□ -0.07
CSI1Q04368 GBP2YCL011C 1284 nt14.61□□□□□ -0.07
CSI1Q04368 MOT3YMR070W 1473 nt14.59□□□□□ -0.07
CSI1Q04368 CUE1YMR264W 612 nt14.58□□□□□ -0.08
CSI1Q04368 YDR433WYDR433W 441 nt14.56□□□□□ -0.08
CSI1Q04368 ERV46YAL042W 1248 nt14.54□□□□□ -0.08
CSI1Q04368 SCC4YER147C 1875 nt14.54□□□□□ -0.08
CSI1Q04368 MXR2YCL033C 507 nt14.53□□□□□ -0.08
CSI1Q04368 RRD1YIL153W 1182 nt14.45□□□□□ -0.1
CSI1Q04368 DED1YOR204W 1815 nt14.44□□□□□ -0.1
CSI1Q04368 YKR040CYKR040C 504 nt14.42□□□□□ -0.1
CSI1Q04368 SPP1YPL138C 1062 nt14.41□□□□□ -0.1
CSI1Q04368 TCD2YKL027W 1344 nt14.41□□□□□ -0.1
CSI1Q04368 BDF1YLR399C 2061 nt14.38□□□□□ -0.11
CSI1Q04368 YIL100WYIL100W 354 nt14.35□□□□□ -0.11
CSI1Q04368 FMT1YBL013W 1206 nt14.33□□□□□ -0.12
CSI1Q04368 FRD1YEL047C 1413 nt14.24□□□□□ -0.13
CSI1Q04368 RRT12YCR045C 1476 nt14.23□□□□□ -0.13
CSI1Q04368 YSC84YHR016C 1407 nt14.2□□□□□ -0.14
CSI1Q04368 TAT1YBR069C 1860 nt14.18□□□□□ -0.14
CSI1Q04368 YHL050CYHL050C 2094 nt14.16□□□□□ -0.14
CSI1Q04368 SOR2YDL246C 1074 nt14.14□□□□□ -0.15
CSI1Q04368 SOR1YJR159W 1074 nt14.14□□□□□ -0.15
CSI1Q04368 FMP52YER004W 696 nt14.13□□□□□ -0.15
CSI1Q04368 CWP1YKL096W 720 nt14.11□□□□□ -0.15
CSI1Q04368 ADH2YMR303C 1047 nt14.11□□□□□ -0.15
CSI1Q04368 YNL195CYNL195C 786 nt14.11□□□□□ -0.15
CSI1Q04368 YCL042WYCL042W 360 nt14.11□□□□□ -0.15
CSI1Q04368 RTG1YOL067C 534 nt14.07□□□□□ -0.16
CSI1Q04368 PCM1YEL058W 1674 nt14.04□□□□□ -0.16
CSI1Q04368 PTH1YHR189W 573 nt14.02□□□□□ -0.17
CSI1Q04368 SEC11YIR022W 504 nt13.99□□□□□ -0.17
CSI1Q04368 PCH2YBR186W 1695 nt13.96□□□□□ -0.17
CSI1Q04368 SNF6YHL025W 999 nt13.95□□□□□ -0.18
CSI1Q04368 MRPL8YJL063C 717 nt13.95□□□□□ -0.18
CSI1Q04368 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.94□□□□□ -0.18
CSI1Q04368 YEL076CYEL076C 651 nt13.94□□□□□ -0.18
CSI1Q04368 YLR464WYLR464W 651 nt13.94□□□□□ -0.18
CSI1Q04368 GUT2YIL155C 1950 nt13.89□□□□□ -0.19
CSI1Q04368 YLR235CYLR235C 399 nt13.85□□□□□ -0.19
CSI1Q04368 LCB1YMR296C 1677 nt13.85□□□□□ -0.19
CSI1Q04368 DIC1YLR348C 897 nt13.84□□□□□ -0.19
CSI1Q04368 YIH1YCR059C 777 nt13.82□□□□□ -0.2
CSI1Q04368 YKL030WYKL030W 606 nt13.81□□□□□ -0.2
CSI1Q04368 BIO4YNR057C 714 nt13.81□□□□□ -0.2
CSI1Q04368 SIM1YIL123W 1431 nt13.81□□□□□ -0.2
CSI1Q04368 ADO1YJR105W 1023 nt13.8□□□□□ -0.2
CSI1Q04368 RNQ1YCL028W 1218 nt13.8□□□□□ -0.2
CSI1Q04368 NCP1YHR042W 2076 nt13.76□□□□□ -0.21
CSI1Q04368 PIB2YGL023C 1908 nt13.76□□□□□ -0.21
CSI1Q04368 YLL053CYLL053C 459 nt13.73□□□□□ -0.21
CSI1Q04368 TIM23YNR017W 669 nt13.73□□□□□ -0.21
CSI1Q04368 HUA1YGR268C 597 nt13.71□□□□□ -0.21
CSI1Q04368 RTF1YGL244W 1677 nt13.68□□□□□ -0.22
CSI1Q04368 YLR179CYLR179C 606 nt13.65□□□□□ -0.22
CSI1Q04368 BOP3YNL042W 1191 nt13.64□□□□□ -0.23
CSI1Q04368 FTR1YER145C 1215 nt13.61□□□□□ -0.23
CSI1Q04368 GAL1YBR020W 1587 nt13.59□□□□□ -0.23
CSI1Q04368 WSC2YNL283C 1512 nt13.59□□□□□ -0.23
CSI1Q04368 TRM5YHR070W 1500 nt13.57□□□□□ -0.24
CSI1Q04368 ATF2YGR177C 1608 nt13.56□□□□□ -0.24
CSI1Q04368 LYS4YDR234W 2082 nt13.55□□□□□ -0.24
CSI1Q04368 AHT1YHR093W 549 nt13.53□□□□□ -0.24
CSI1Q04368 PTK1YKL198C 1989 nt13.52□□□□□ -0.24
CSI1Q04368 UBX6YJL048C 1191 nt13.51□□□□□ -0.25
CSI1Q04368 CRR1YLR213C 1269 nt13.51□□□□□ -0.25
CSI1Q04368 ERF2YLR246W 1080 nt13.51□□□□□ -0.25
CSI1Q04368 YPR064WYPR064W 420 nt13.5□□□□□ -0.25
CSI1Q04368 AQY1YPR192W 918 nt13.46□□□□□ -0.25
CSI1Q04368 TAD3YLR316C 969 nt13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms