Protein–RNA interactions for Protein: Q04031

RRP17, Ribosomal RNA-processing protein 17, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP17Q04031 YSC84YHR016C 1407 nt11.41□□□□□ -0.58
RRP17Q04031 CCT6YDR188W 1641 nt11.39□□□□□ -0.59
RRP17Q04031 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.39□□□□□ -0.59
RRP17Q04031 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.39□□□□□ -0.59
RRP17Q04031 RTS2YOR077W 699 nt11.37□□□□□ -0.59
RRP17Q04031 ART5YGR068C 1761 nt11.35□□□□□ -0.59
RRP17Q04031 GFD2YCL036W 1701 nt11.35□□□□□ -0.59
RRP17Q04031 PST2YDR032C 597 nt11.34□□□□□ -0.59
RRP17Q04031 WWM1YFL010C 636 nt11.31□□□□□ -0.6
RRP17Q04031 PIB2YGL023C 1908 nt11.31□□□□□ -0.6
RRP17Q04031 LSM3YLR438C-A 270 nt11.3□□□□□ -0.6
RRP17Q04031 YHL050CYHL050C 2094 nt11.29□□□□□ -0.6
RRP17Q04031 RTF1YGL244W 1677 nt11.28□□□□□ -0.6
RRP17Q04031 RRT12YCR045C 1476 nt11.24□□□□□ -0.61
RRP17Q04031 PET9YBL030C 957 nt11.2□□□□□ -0.62
RRP17Q04031 CUE1YMR264W 612 nt11.18□□□□□ -0.62
RRP17Q04031 YNL195CYNL195C 786 nt11.18□□□□□ -0.62
RRP17Q04031 BOP3YNL042W 1191 nt11.16□□□□□ -0.62
RRP17Q04031 YIL100WYIL100W 354 nt11.11□□□□□ -0.63
RRP17Q04031 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.1□□□□□ -0.63
RRP17Q04031 PTK1YKL198C 1989 nt11.08□□□□□ -0.64
RRP17Q04031 YCH1YGR203W 447 nt11.07□□□□□ -0.64
RRP17Q04031 TIR4YOR009W 1464 nt11.06□□□□□ -0.64
RRP17Q04031 YMR057CYMR057C 372 nt11.04□□□□□ -0.64
RRP17Q04031 YGR021WYGR021W 873 nt11.02□□□□□ -0.65
RRP17Q04031 YLR236CYLR236C 324 nt10.95□□□□□ -0.66
RRP17Q04031 HOM6YJR139C 1080 nt10.94□□□□□ -0.66
RRP17Q04031 UME6YDR207C 2511 nt10.91□□□□□ -0.66
RRP17Q04031 SHU1YHL006C 453 nt10.91□□□□□ -0.66
RRP17Q04031 YFL054CYFL054C 1941 nt10.91□□□□□ -0.66
RRP17Q04031 NCP1YHR042W 2076 nt10.89□□□□□ -0.67
RRP17Q04031 BOR1YNL275W 1731 nt10.89□□□□□ -0.67
RRP17Q04031 RPM1RPM1 483 nt10.86□□□□□ -0.67
RRP17Q04031 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.85□□□□□ -0.67
RRP17Q04031 MNP1YGL068W 585 nt10.84□□□□□ -0.67
RRP17Q04031 SPT8YLR055C 1809 nt10.81□□□□□ -0.68
RRP17Q04031 YJL152WYJL152W 360 nt10.8□□□□□ -0.68
RRP17Q04031 RKM5YLR137W 1104 nt10.8□□□□□ -0.68
RRP17Q04031 YKL097CYKL097C 411 nt10.79□□□□□ -0.68
RRP17Q04031 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.79□□□□□ -0.68
RRP17Q04031 Q0182Q0182 405 nt10.74□□□□□ -0.69
RRP17Q04031 LCB1YMR296C 1677 nt10.73□□□□□ -0.69
RRP17Q04031 NPL3YDR432W 1245 nt10.73□□□□□ -0.69
RRP17Q04031 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.65□□□□□ -0.7
RRP17Q04031 SWE1YJL187C 2460 nt10.59□□□□□ -0.71
RRP17Q04031 HSP60YLR259C 1719 nt10.57□□□□□ -0.72
RRP17Q04031 SIM1YIL123W 1431 nt10.56□□□□□ -0.72
RRP17Q04031 YOL037CYOL037C 354 nt10.51□□□□□ -0.73
RRP17Q04031 LYS4YDR234W 2082 nt10.49□□□□□ -0.73
RRP17Q04031 GLK1YCL040W 1503 nt10.46□□□□□ -0.74
RRP17Q04031 PCM1YEL058W 1674 nt10.46□□□□□ -0.74
RRP17Q04031 RRD1YIL153W 1182 nt10.45□□□□□ -0.74
RRP17Q04031 MCH5YOR306C 1566 nt10.43□□□□□ -0.74
RRP17Q04031 ALG12YNR030W 1656 nt10.42□□□□□ -0.74
RRP17Q04031 FMP52YER004W 696 nt10.42□□□□□ -0.74
RRP17Q04031 BIO4YNR057C 714 nt10.37□□□□□ -0.75
RRP17Q04031 GBP2YCL011C 1284 nt10.37□□□□□ -0.75
RRP17Q04031 IDH1YNL037C 1083 nt10.35□□□□□ -0.75
RRP17Q04031 SNF6YHL025W 999 nt10.34□□□□□ -0.75
RRP17Q04031 FUR4YBR021W 1902 nt10.34□□□□□ -0.75
RRP17Q04031 YOR139CYOR139C 393 nt10.33□□□□□ -0.76
RRP17Q04031 TCD2YKL027W 1344 nt10.33□□□□□ -0.76
RRP17Q04031 CWP1YKL096W 720 nt10.32□□□□□ -0.76
RRP17Q04031 ADH2YMR303C 1047 nt10.32□□□□□ -0.76
RRP17Q04031 DED1YOR204W 1815 nt10.32□□□□□ -0.76
RRP17Q04031 FMT1YBL013W 1206 nt10.28□□□□□ -0.76
RRP17Q04031 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.26□□□□□ -0.77
RRP17Q04031 ERF2YLR246W 1080 nt10.26□□□□□ -0.77
RRP17Q04031 WHI5YOR083W 888 nt10.26□□□□□ -0.77
RRP17Q04031 PRP4YPR178W 1398 nt10.25□□□□□ -0.77
RRP17Q04031 CRR1YLR213C 1269 nt10.24□□□□□ -0.77
RRP17Q04031 YLR281CYLR281C 468 nt10.22□□□□□ -0.77
RRP17Q04031 CCA1YER168C 1641 nt10.22□□□□□ -0.77
RRP17Q04031 AAC1YMR056C 930 nt10.21□□□□□ -0.77
RRP17Q04031 DSK2YMR276W 1122 nt10.21□□□□□ -0.77
RRP17Q04031 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.2□□□□□ -0.78
RRP17Q04031 YEL076CYEL076C 651 nt10.2□□□□□ -0.78
RRP17Q04031 YLR464WYLR464W 651 nt10.2□□□□□ -0.78
RRP17Q04031 NAR1YNL240C 1476 nt10.19□□□□□ -0.78
RRP17Q04031 RAX1YOR301W 1308 nt10.18□□□□□ -0.78
RRP17Q04031 HEM12YDR047W 1089 nt10.18□□□□□ -0.78
RRP17Q04031 MIC10YCL057C-A 294 nt10.17□□□□□ -0.78
RRP17Q04031 DPS1YLL018C 1674 nt10.17□□□□□ -0.78
RRP17Q04031 YLL053CYLL053C 459 nt10.14□□□□□ -0.79
RRP17Q04031 BMT6YLR063W 1098 nt10.14□□□□□ -0.79
RRP17Q04031 YDR433WYDR433W 441 nt10.11□□□□□ -0.79
RRP17Q04031 IMP2'YIL154C 1041 nt10.11□□□□□ -0.79
RRP17Q04031 YCL042WYCL042W 360 nt10.11□□□□□ -0.79
RRP17Q04031 ATF2YGR177C 1608 nt10.11□□□□□ -0.79
RRP17Q04031 YIH1YCR059C 777 nt10.1□□□□□ -0.79
RRP17Q04031 SNG1YGR197C 1644 nt10.1□□□□□ -0.79
RRP17Q04031 MXR2YCL033C 507 nt10.09□□□□□ -0.79
RRP17Q04031 SOR2YDL246C 1074 nt10.08□□□□□ -0.8
RRP17Q04031 SOR1YJR159W 1074 nt10.08□□□□□ -0.8
RRP17Q04031 YKR005CYKR005C 1578 nt10.05□□□□□ -0.8
RRP17Q04031 YFL067WYFL067W 528 nt10.05□□□□□ -0.8
RRP17Q04031 RNQ1YCL028W 1218 nt10.05□□□□□ -0.8
RRP17Q04031 BIO5YNR056C 1686 nt10.05□□□□□ -0.8
RRP17Q04031 DUS1YML080W 1272 nt10.03□□□□□ -0.8
RRP17Q04031 PUS2YGL063W 1113 nt10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms