Protein–RNA interactions for Protein: Q02979

GDE1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1, yeastyeast

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Length 1,223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDE1Q02979 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14□□□□□ -0.17
GDE1Q02979 IMT2tM(CAU)P 72 nt14□□□□□ -0.17
GDE1Q02979 WHI5YOR083W 888 nt13.99□□□□□ -0.17
GDE1Q02979 DCW1YKL046C 1350 nt13.98□□□□□ -0.17
GDE1Q02979 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.96□□□□□ -0.17
GDE1Q02979 PTP1YDL230W 1008 nt13.95□□□□□ -0.18
GDE1Q02979 PUS2YGL063W 1113 nt13.9□□□□□ -0.18
GDE1Q02979 YJL152WYJL152W 360 nt13.87□□□□□ -0.19
GDE1Q02979 ART5YGR068C 1761 nt13.84□□□□□ -0.19
GDE1Q02979 CAC2YML102W 1407 nt13.84□□□□□ -0.19
GDE1Q02979 TIR4YOR009W 1464 nt13.84□□□□□ -0.19
GDE1Q02979 SSA4YER103W 1929 nt13.84□□□□□ -0.19
GDE1Q02979 EMI2YDR516C 1503 nt13.81□□□□□ -0.2
GDE1Q02979 GFD2YCL036W 1701 nt13.78□□□□□ -0.2
GDE1Q02979 PET9YBL030C 957 nt13.77□□□□□ -0.21
GDE1Q02979 YCH1YGR203W 447 nt13.76□□□□□ -0.21
GDE1Q02979 YMR090WYMR090W 684 nt13.73□□□□□ -0.21
GDE1Q02979 YDL221WYDL221W 552 nt13.71□□□□□ -0.21
GDE1Q02979 YMR057CYMR057C 372 nt13.7□□□□□ -0.22
GDE1Q02979 DSK2YMR276W 1122 nt13.7□□□□□ -0.22
GDE1Q02979 IMP2'YIL154C 1041 nt13.68□□□□□ -0.22
GDE1Q02979 YLR236CYLR236C 324 nt13.64□□□□□ -0.23
GDE1Q02979 RTS2YOR077W 699 nt13.64□□□□□ -0.23
GDE1Q02979 IRC15YPL017C 1500 nt13.63□□□□□ -0.23
GDE1Q02979 IDH1YNL037C 1083 nt13.62□□□□□ -0.23
GDE1Q02979 YPR011CYPR011C 981 nt13.61□□□□□ -0.23
GDE1Q02979 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.59□□□□□ -0.23
GDE1Q02979 FMP45YDL222C 930 nt13.56□□□□□ -0.24
GDE1Q02979 GIS3YLR094C 1509 nt13.53□□□□□ -0.24
GDE1Q02979 SDH1YKL148C 1923 nt13.52□□□□□ -0.24
GDE1Q02979 YBR220CYBR220C 1683 nt13.51□□□□□ -0.25
GDE1Q02979 GBP2YCL011C 1284 nt13.5□□□□□ -0.25
GDE1Q02979 CUE1YMR264W 612 nt13.49□□□□□ -0.25
GDE1Q02979 FPS1YLL043W 2010 nt13.49□□□□□ -0.25
GDE1Q02979 SCC4YER147C 1875 nt13.47□□□□□ -0.25
GDE1Q02979 YDR433WYDR433W 441 nt13.45□□□□□ -0.26
GDE1Q02979 LPX1YOR084W 1164 nt13.42□□□□□ -0.26
GDE1Q02979 ERV46YAL042W 1248 nt13.39□□□□□ -0.27
GDE1Q02979 YIL100WYIL100W 354 nt13.36□□□□□ -0.27
GDE1Q02979 TCD2YKL027W 1344 nt13.36□□□□□ -0.27
GDE1Q02979 MXR2YCL033C 507 nt13.33□□□□□ -0.28
GDE1Q02979 YKR040CYKR040C 504 nt13.3□□□□□ -0.28
GDE1Q02979 RRD1YIL153W 1182 nt13.28□□□□□ -0.28
GDE1Q02979 BDF1YLR399C 2061 nt13.25□□□□□ -0.29
GDE1Q02979 DED1YOR204W 1815 nt13.25□□□□□ -0.29
GDE1Q02979 SPP1YPL138C 1062 nt13.19□□□□□ -0.3
GDE1Q02979 YNL195CYNL195C 786 nt13.17□□□□□ -0.3
GDE1Q02979 YSC84YHR016C 1407 nt13.13□□□□□ -0.31
GDE1Q02979 FMT1YBL013W 1206 nt13.13□□□□□ -0.31
GDE1Q02979 FMP52YER004W 696 nt13.12□□□□□ -0.31
GDE1Q02979 RRT12YCR045C 1476 nt13.1□□□□□ -0.31
GDE1Q02979 TAT1YBR069C 1860 nt13.09□□□□□ -0.31
GDE1Q02979 YCL042WYCL042W 360 nt13.09□□□□□ -0.31
GDE1Q02979 FRD1YEL047C 1413 nt13.08□□□□□ -0.32
GDE1Q02979 SOR2YDL246C 1074 nt13.04□□□□□ -0.32
GDE1Q02979 SEC11YIR022W 504 nt13.04□□□□□ -0.32
GDE1Q02979 SOR1YJR159W 1074 nt13.04□□□□□ -0.32
GDE1Q02979 CWP1YKL096W 720 nt13.04□□□□□ -0.32
GDE1Q02979 YHL050CYHL050C 2094 nt13.04□□□□□ -0.32
GDE1Q02979 ADH2YMR303C 1047 nt13□□□□□ -0.33
GDE1Q02979 PCM1YEL058W 1674 nt12.97□□□□□ -0.33
GDE1Q02979 MRPL8YJL063C 717 nt12.96□□□□□ -0.33
GDE1Q02979 PCH2YBR186W 1695 nt12.93□□□□□ -0.34
GDE1Q02979 SNF6YHL025W 999 nt12.92□□□□□ -0.34
GDE1Q02979 RTG1YOL067C 534 nt12.91□□□□□ -0.34
GDE1Q02979 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.89□□□□□ -0.35
GDE1Q02979 YEL076CYEL076C 651 nt12.89□□□□□ -0.35
GDE1Q02979 PTH1YHR189W 573 nt12.89□□□□□ -0.35
GDE1Q02979 YLR464WYLR464W 651 nt12.89□□□□□ -0.35
GDE1Q02979 ADO1YJR105W 1023 nt12.85□□□□□ -0.35
GDE1Q02979 GUT2YIL155C 1950 nt12.85□□□□□ -0.35
GDE1Q02979 YLR235CYLR235C 399 nt12.83□□□□□ -0.36
GDE1Q02979 NVJ2YPR091C 2313 nt12.83□□□□□ -0.36
GDE1Q02979 SIM1YIL123W 1431 nt12.79□□□□□ -0.36
GDE1Q02979 DIC1YLR348C 897 nt12.78□□□□□ -0.36
GDE1Q02979 YIH1YCR059C 777 nt12.76□□□□□ -0.37
GDE1Q02979 RNQ1YCL028W 1218 nt12.76□□□□□ -0.37
GDE1Q02979 YKL030WYKL030W 606 nt12.75□□□□□ -0.37
GDE1Q02979 LCB1YMR296C 1677 nt12.75□□□□□ -0.37
GDE1Q02979 BIO4YNR057C 714 nt12.74□□□□□ -0.37
GDE1Q02979 RTF1YGL244W 1677 nt12.68□□□□□ -0.38
GDE1Q02979 HUA1YGR268C 597 nt12.68□□□□□ -0.38
GDE1Q02979 BOP3YNL042W 1191 nt12.68□□□□□ -0.38
GDE1Q02979 TIM23YNR017W 669 nt12.68□□□□□ -0.38
GDE1Q02979 UBX6YJL048C 1191 nt12.67□□□□□ -0.38
GDE1Q02979 YLL053CYLL053C 459 nt12.67□□□□□ -0.38
GDE1Q02979 NCP1YHR042W 2076 nt12.65□□□□□ -0.39
GDE1Q02979 PIB2YGL023C 1908 nt12.62□□□□□ -0.39
GDE1Q02979 YLR179CYLR179C 606 nt12.62□□□□□ -0.39
GDE1Q02979 FTR1YER145C 1215 nt12.58□□□□□ -0.4
GDE1Q02979 PAC11YDR488C 1602 nt12.55□□□□□ -0.4
GDE1Q02979 ERF2YLR246W 1080 nt12.55□□□□□ -0.4
GDE1Q02979 GAL1YBR020W 1587 nt12.54□□□□□ -0.4
GDE1Q02979 TRM5YHR070W 1500 nt12.52□□□□□ -0.41
GDE1Q02979 YPR064WYPR064W 420 nt12.51□□□□□ -0.41
GDE1Q02979 AQY1YPR192W 918 nt12.51□□□□□ -0.41
GDE1Q02979 CRR1YLR213C 1269 nt12.49□□□□□ -0.41
GDE1Q02979 ATF2YGR177C 1608 nt12.48□□□□□ -0.41
GDE1Q02979 WSC2YNL283C 1512 nt12.47□□□□□ -0.41
GDE1Q02979 YFL067WYFL067W 528 nt12.46□□□□□ -0.41
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