Protein–RNA interactions for Protein: Q01477

UBP3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP3Q01477 YLR281CYLR281C 468 nt13.19□□□□□ -0.3
UBP3Q01477 EMI2YDR516C 1503 nt13.18□□□□□ -0.3 RIP-Chip
UBP3Q01477 ART5YGR068C 1761 nt13.17□□□□□ -0.3
UBP3Q01477 WHI5YOR083W 888 nt13.16□□□□□ -0.3
UBP3Q01477 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.15□□□□□ -0.3
UBP3Q01477 TIR4YOR009W 1464 nt13.13□□□□□ -0.31
UBP3Q01477 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.12□□□□□ -0.31
UBP3Q01477 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.12□□□□□ -0.31
UBP3Q01477 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.12□□□□□ -0.31
UBP3Q01477 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.12□□□□□ -0.31
UBP3Q01477 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.12□□□□□ -0.31
UBP3Q01477 GFD2YCL036W 1701 nt13.1□□□□□ -0.31
UBP3Q01477 YDL221WYDL221W 552 nt13.07□□□□□ -0.32
UBP3Q01477 YCH1YGR203W 447 nt13.05□□□□□ -0.32
UBP3Q01477 PET9YBL030C 957 nt13.05□□□□□ -0.32
UBP3Q01477 IRC15YPL017C 1500 nt13.04□□□□□ -0.32
UBP3Q01477 PUS2YGL063W 1113 nt13.04□□□□□ -0.32
UBP3Q01477 YJL152WYJL152W 360 nt13.04□□□□□ -0.32
UBP3Q01477 YMR057CYMR057C 372 nt13.01□□□□□ -0.33
UBP3Q01477 YMR090WYMR090W 684 nt13□□□□□ -0.33
UBP3Q01477 YBR220CYBR220C 1683 nt12.97□□□□□ -0.33
UBP3Q01477 RTS2YOR077W 699 nt12.96□□□□□ -0.33 RIP-Chip
UBP3Q01477 YPR011CYPR011C 981 nt12.94□□□□□ -0.34
UBP3Q01477 GIS3YLR094C 1509 nt12.93□□□□□ -0.34
UBP3Q01477 SDH1YKL148C 1923 nt12.92□□□□□ -0.34
UBP3Q01477 PAC11YDR488C 1602 nt12.88□□□□□ -0.35
UBP3Q01477 YLR236CYLR236C 324 nt12.87□□□□□ -0.35
UBP3Q01477 SCC4YER147C 1875 nt12.85□□□□□ -0.35 RIP-Chip
UBP3Q01477 FPS1YLL043W 2010 nt12.84□□□□□ -0.35
UBP3Q01477 BDF1YLR399C 2061 nt12.84□□□□□ -0.35
UBP3Q01477 DSK2YMR276W 1122 nt12.83□□□□□ -0.36
UBP3Q01477 CUE1YMR264W 612 nt12.81□□□□□ -0.36
UBP3Q01477 IMP2'YIL154C 1041 nt12.77□□□□□ -0.37
UBP3Q01477 IDH1YNL037C 1083 nt12.76□□□□□ -0.37
UBP3Q01477 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.76□□□□□ -0.37
UBP3Q01477 NVJ2YPR091C 2313 nt12.71□□□□□ -0.37
UBP3Q01477 GBP2YCL011C 1284 nt12.71□□□□□ -0.37
UBP3Q01477 FMP45YDL222C 930 nt12.7□□□□□ -0.38
UBP3Q01477 LPX1YOR084W 1164 nt12.65□□□□□ -0.38 RIP-Chip
UBP3Q01477 TAT1YBR069C 1860 nt12.64□□□□□ -0.39
UBP3Q01477 YDR433WYDR433W 441 nt12.63□□□□□ -0.39
UBP3Q01477 RRD1YIL153W 1182 nt12.63□□□□□ -0.39
UBP3Q01477 MXR2YCL033C 507 nt12.62□□□□□ -0.39
UBP3Q01477 DED1YOR204W 1815 nt12.61□□□□□ -0.39
UBP3Q01477 YIL100WYIL100W 354 nt12.6□□□□□ -0.39
UBP3Q01477 ERV46YAL042W 1248 nt12.6□□□□□ -0.39
UBP3Q01477 RRT12YCR045C 1476 nt12.56□□□□□ -0.4
UBP3Q01477 TCD2YKL027W 1344 nt12.55□□□□□ -0.4
UBP3Q01477 YSC84YHR016C 1407 nt12.54□□□□□ -0.4
UBP3Q01477 YKR040CYKR040C 504 nt12.53□□□□□ -0.4
UBP3Q01477 FMT1YBL013W 1206 nt12.52□□□□□ -0.41
UBP3Q01477 YHL050CYHL050C 2094 nt12.52□□□□□ -0.41
UBP3Q01477 SPP1YPL138C 1062 nt12.45□□□□□ -0.42 RIP-Chip
UBP3Q01477 YNL195CYNL195C 786 nt12.43□□□□□ -0.42
UBP3Q01477 SEC11YIR022W 504 nt12.42□□□□□ -0.42
UBP3Q01477 PCH2YBR186W 1695 nt12.41□□□□□ -0.42
UBP3Q01477 FRD1YEL047C 1413 nt12.38□□□□□ -0.43 RIP-Chip
UBP3Q01477 FMP52YER004W 696 nt12.37□□□□□ -0.43
UBP3Q01477 GUT2YIL155C 1950 nt12.36□□□□□ -0.43
UBP3Q01477 ADH2YMR303C 1047 nt12.34□□□□□ -0.43
UBP3Q01477 CWP1YKL096W 720 nt12.33□□□□□ -0.44
UBP3Q01477 SOR2YDL246C 1074 nt12.32□□□□□ -0.44
UBP3Q01477 SOR1YJR159W 1074 nt12.32□□□□□ -0.44
UBP3Q01477 PCM1YEL058W 1674 nt12.31□□□□□ -0.44
UBP3Q01477 YCL042WYCL042W 360 nt12.28□□□□□ -0.44
UBP3Q01477 PIB2YGL023C 1908 nt12.24□□□□□ -0.45 RIP-Chip
UBP3Q01477 SNF6YHL025W 999 nt12.19□□□□□ -0.46
UBP3Q01477 LCB1YMR296C 1677 nt12.19□□□□□ -0.46
UBP3Q01477 NCP1YHR042W 2076 nt12.18□□□□□ -0.46
UBP3Q01477 PTH1YHR189W 573 nt12.15□□□□□ -0.46
UBP3Q01477 RTF1YGL244W 1677 nt12.13□□□□□ -0.47
UBP3Q01477 RTG1YOL067C 534 nt12.12□□□□□ -0.47
UBP3Q01477 SIM1YIL123W 1431 nt12.11□□□□□ -0.47
UBP3Q01477 BIO4YNR057C 714 nt12.1□□□□□ -0.47
UBP3Q01477 YIH1YCR059C 777 nt12.09□□□□□ -0.47
UBP3Q01477 BOP3YNL042W 1191 nt12.09□□□□□ -0.47 RIP-Chip
UBP3Q01477 RNQ1YCL028W 1218 nt12.07□□□□□ -0.48
UBP3Q01477 DIC1YLR348C 897 nt12.04□□□□□ -0.48
UBP3Q01477 YLL053CYLL053C 459 nt12.02□□□□□ -0.49 RIP-Chip
UBP3Q01477 YLR235CYLR235C 399 nt12.02□□□□□ -0.49
UBP3Q01477 PTK1YKL198C 1989 nt12.01□□□□□ -0.49
UBP3Q01477 YKL030WYKL030W 606 nt11.98□□□□□ -0.49
UBP3Q01477 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.97□□□□□ -0.49 RIP-Chip
UBP3Q01477 YEL076CYEL076C 651 nt11.97□□□□□ -0.49
UBP3Q01477 YLR464WYLR464W 651 nt11.97□□□□□ -0.49 RIP-Chip
UBP3Q01477 LYS4YDR234W 2082 nt11.95□□□□□ -0.5
UBP3Q01477 MRPL8YJL063C 717 nt11.95□□□□□ -0.5
UBP3Q01477 TIM23YNR017W 669 nt11.93□□□□□ -0.5
UBP3Q01477 FTR1YER145C 1215 nt11.91□□□□□ -0.5
UBP3Q01477 ATF2YGR177C 1608 nt11.89□□□□□ -0.51
UBP3Q01477 GAL1YBR020W 1587 nt11.88□□□□□ -0.51
UBP3Q01477 YLR179CYLR179C 606 nt11.87□□□□□ -0.51 RIP-Chip
UBP3Q01477 TRM5YHR070W 1500 nt11.86□□□□□ -0.51
UBP3Q01477 ERF2YLR246W 1080 nt11.86□□□□□ -0.51
UBP3Q01477 ADO1YJR105W 1023 nt11.84□□□□□ -0.51 RIP-Chip
UBP3Q01477 CRR1YLR213C 1269 nt11.84□□□□□ -0.51
UBP3Q01477 WSC2YNL283C 1512 nt11.82□□□□□ -0.52
UBP3Q01477 HUA1YGR268C 597 nt11.81□□□□□ -0.52
UBP3Q01477 AHT1YHR093W 549 nt11.79□□□□□ -0.52
UBP3Q01477 MIC10YCL057C-A 294 nt11.79□□□□□ -0.52
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