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Protein–RNA interactions for Protein: P60010
ACT1, Actin, yeast
Known RBP
Predictions only
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375 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
ACT1
P60010
GIS3
YLR094C
1509 nt
10.51
□□□□□ -0.73
ACT1
P60010
LSM3
YLR438C-A
270 nt
10.49
□□□□□ -0.73
ACT1
P60010
YSC84
YHR016C
1407 nt
10.44
□□□□□ -0.74
ACT1
P60010
GFD2
YCL036W
1701 nt
10.44
□□□□□ -0.74
ACT1
P60010
WWM1
YFL010C
636 nt
10.43
□□□□□ -0.74
ACT1
P60010
YKL097C
YKL097C
411 nt
10.43
□□□□□ -0.74
ACT1
P60010
ART5
YGR068C
1761 nt
10.41
□□□□□ -0.74
ACT1
P60010
RTS2
YOR077W
699 nt
10.38
□□□□□ -0.75
ACT1
P60010
PIB2
YGL023C
1908 nt
10.37
□□□□□ -0.75
ACT1
P60010
YHL050C
YHL050C
2094 nt
10.35
□□□□□ -0.75
ACT1
P60010
PET9
YBL030C
957 nt
10.33
□□□□□ -0.76
ACT1
P60010
RTF1
YGL244W
1677 nt
10.33
□□□□□ -0.76
ACT1
P60010
YFL021C-A
YFL021C-A
855 nt
10.32
□□□□□ -0.76
ACT1
P60010
CUE1
YMR264W
612 nt
10.29
□□□□□ -0.76
ACT1
P60010
YJL225C
YJL225C
5277 nt
10.28
□□□□□ -0.76
ACT1
P60010
YGR021W
YGR021W
873 nt
10.28
□□□□□ -0.76
ACT1
P60010
YCH1
YGR203W
447 nt
10.28
□□□□□ -0.76
ACT1
P60010
SHU1
YHL006C
453 nt
10.26
□□□□□ -0.77
ACT1
P60010
YNL195C
YNL195C
786 nt
10.26
□□□□□ -0.77
ACT1
P60010
RRT12
YCR045C
1476 nt
10.24
□□□□□ -0.77
ACT1
P60010
BOP3
YNL042W
1191 nt
10.24
□□□□□ -0.77
ACT1
P60010
YIL100W
YIL100W
354 nt
10.2
□□□□□ -0.78
ACT1
P60010
TIR4
YOR009W
1464 nt
10.19
□□□□□ -0.78
ACT1
P60010
HOM6
YJR139C
1080 nt
10.17
□□□□□ -0.78
ACT1
P60010
PTK1
YKL198C
1989 nt
10.14
□□□□□ -0.79
ACT1
P60010
YMR057C
YMR057C
372 nt
10.12
□□□□□ -0.79
ACT1
P60010
YLR236C
YLR236C
324 nt
10.09
□□□□□ -0.79
ACT1
P60010
MNP1
YGL068W
585 nt
10.04
□□□□□ -0.8
ACT1
P60010
RKM5
YLR137W
1104 nt
10.03
□□□□□ -0.8
ACT1
P60010
NCP1
YHR042W
2076 nt
10.02
□□□□□ -0.81
ACT1
P60010
YAL037C-B
YAL037C-B
975 nt
10.01
□□□□□ -0.81
ACT1
P60010
YFL054C
YFL054C
1941 nt
9.95
□□□□□ -0.82
ACT1
P60010
YOR139C
YOR139C
393 nt
9.94
□□□□□ -0.82
ACT1
P60010
YCL048W-A
YCL048W-A
240 nt
9.94
□□□□□ -0.82
ACT1
P60010
NPL3
YDR432W
1245 nt
9.93
□□□□□ -0.82
ACT1
P60010
YJL152W
YJL152W
360 nt
9.91
□□□□□ -0.82
ACT1
P60010
SPT8
YLR055C
1809 nt
9.91
□□□□□ -0.82
ACT1
P60010
BOR1
YNL275W
1731 nt
9.9
□□□□□ -0.82
ACT1
P60010
YLR154C-G
YLR154C-G
150 nt
9.86
□□□□□ -0.83
ACT1
P60010
RDN37-1
RDN37-1
5354 nt
9.85
□□□□□ -0.83
ACT1
P60010
RDN37-2
RDN37-2
5354 nt
9.85
□□□□□ -0.83
ACT1
P60010
LCB1
YMR296C
1677 nt
9.85
□□□□□ -0.83
ACT1
P60010
UME6
YDR207C
2511 nt
9.85
□□□□□ -0.83
ACT1
P60010
YOL037C
YOL037C
354 nt
9.81
□□□□□ -0.84
ACT1
P60010
SWE1
YJL187C
2460 nt
9.71
□□□□□ -0.86
ACT1
P60010
FMP52
YER004W
696 nt
9.69
□□□□□ -0.86
ACT1
P60010
SIM1
YIL123W
1431 nt
9.68
□□□□□ -0.86
ACT1
P60010
LYS4
YDR234W
2082 nt
9.65
□□□□□ -0.87
ACT1
P60010
HSP60
YLR259C
1719 nt
9.65
□□□□□ -0.87
ACT1
P60010
RRD1
YIL153W
1182 nt
9.64
□□□□□ -0.87
ACT1
P60010
PCM1
YEL058W
1674 nt
9.62
□□□□□ -0.87
ACT1
P60010
IDH1
YNL037C
1083 nt
9.59
□□□□□ -0.87
ACT1
P60010
GBP2
YCL011C
1284 nt
9.56
□□□□□ -0.88
ACT1
P60010
TCD2
YKL027W
1344 nt
9.56
□□□□□ -0.88
ACT1
P60010
BIO4
YNR057C
714 nt
9.55
□□□□□ -0.88
ACT1
P60010
tM(CAU)C
tM(CAU)C
72 nt
9.54
□□□□□ -0.88
ACT1
P60010
IMT4
tM(CAU)E
72 nt
9.54
□□□□□ -0.88
ACT1
P60010
IMT3
tM(CAU)J3
72 nt
9.54
□□□□□ -0.88
ACT1
P60010
IMT1
tM(CAU)O1
72 nt
9.54
□□□□□ -0.88
ACT1
P60010
IMT2
tM(CAU)P
72 nt
9.54
□□□□□ -0.88
ACT1
P60010
GLK1
YCL040W
1503 nt
9.54
□□□□□ -0.88
ACT1
P60010
DED1
YOR204W
1815 nt
9.54
□□□□□ -0.88
ACT1
P60010
SNF6
YHL025W
999 nt
9.52
□□□□□ -0.89
ACT1
P60010
WHI5
YOR083W
888 nt
9.52
□□□□□ -0.89
ACT1
P60010
ALG12
YNR030W
1656 nt
9.51
□□□□□ -0.89
ACT1
P60010
YLR281C
YLR281C
468 nt
9.5
□□□□□ -0.89
ACT1
P60010
ERF2
YLR246W
1080 nt
9.49
□□□□□ -0.89
ACT1
P60010
CWP1
YKL096W
720 nt
9.48
□□□□□ -0.89
ACT1
P60010
ADH2
YMR303C
1047 nt
9.48
□□□□□ -0.89
ACT1
P60010
CRR1
YLR213C
1269 nt
9.46
□□□□□ -0.9
ACT1
P60010
FMT1
YBL013W
1206 nt
9.46
□□□□□ -0.9
ACT1
P60010
MCH5
YOR306C
1566 nt
9.46
□□□□□ -0.9
ACT1
P60010
FUR4
YBR021W
1902 nt
9.45
□□□□□ -0.9
ACT1
P60010
YHR056W-A
YHR056W-A
435 nt
9.45
□□□□□ -0.9
ACT1
P60010
PUS2
YGL063W
1113 nt
9.43
□□□□□ -0.9
ACT1
P60010
Q0182
Q0182
405 nt
9.43
□□□□□ -0.9
ACT1
P60010
SOR2
YDL246C
1074 nt
9.38
□□□□□ -0.91
ACT1
P60010
IMP2'
YIL154C
1041 nt
9.38
□□□□□ -0.91
ACT1
P60010
SOR1
YJR159W
1074 nt
9.38
□□□□□ -0.91
ACT1
P60010
DSK2
YMR276W
1122 nt
9.37
□□□□□ -0.91
ACT1
P60010
YIH1
YCR059C
777 nt
9.36
□□□□□ -0.91
ACT1
P60010
HEM12
YDR047W
1089 nt
9.36
□□□□□ -0.91
ACT1
P60010
RAX1
YOR301W
1308 nt
9.35
□□□□□ -0.91
ACT1
P60010
CCA1
YER168C
1641 nt
9.35
□□□□□ -0.91
ACT1
P60010
YCL042W
YCL042W
360 nt
9.35
□□□□□ -0.91
ACT1
P60010
PRP4
YPR178W
1398 nt
9.35
□□□□□ -0.91
ACT1
P60010
YEL076C-A
YEL076C-A
651 nt
9.33
□□□□□ -0.92
ACT1
P60010
YEL076C
YEL076C
651 nt
9.33
□□□□□ -0.92
ACT1
P60010
YLL053C
YLL053C
459 nt
9.33
□□□□□ -0.92
ACT1
P60010
YLR464W
YLR464W
651 nt
9.33
□□□□□ -0.92
ACT1
P60010
AAC1
YMR056C
930 nt
9.33
□□□□□ -0.92
ACT1
P60010
YDR433W
YDR433W
441 nt
9.32
□□□□□ -0.92
ACT1
P60010
MIC10
YCL057C-A
294 nt
9.31
□□□□□ -0.92
ACT1
P60010
RNQ1
YCL028W
1218 nt
9.3
□□□□□ -0.92
ACT1
P60010
ATF2
YGR177C
1608 nt
9.3
□□□□□ -0.92
ACT1
P60010
DPS1
YLL018C
1674 nt
9.29
□□□□□ -0.92
ACT1
P60010
YFL067W
YFL067W
528 nt
9.29
□□□□□ -0.92
ACT1
P60010
BMT6
YLR063W
1098 nt
9.29
□□□□□ -0.92
ACT1
P60010
SNG1
YGR197C
1644 nt
9.29
□□□□□ -0.92
ACT1
P60010
MXR2
YCL033C
507 nt
9.28
□□□□□ -0.92
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