Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GSCP56915 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
GSCP56915 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GSCP56915 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GSCP56915 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GSCP56915 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GSCP56915 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GSCP56915 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GSCP56915 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GSCP56915 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GSCP56915 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GSCP56915 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GSCP56915 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GSCP56915 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GSCP56915 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GSCP56915 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GSCP56915 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GSCP56915 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GSCP56915 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
GSCP56915 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GSCP56915 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GSCP56915 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GSCP56915 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GSCP56915 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GSCP56915 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GSCP56915 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GSCP56915 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GSCP56915 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GSCP56915 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GSCP56915 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GSCP56915 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GSCP56915 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GSCP56915 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GSCP56915 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GSCP56915 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GSCP56915 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GSCP56915 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GSCP56915 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GSCP56915 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GSCP56915 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GSCP56915 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GSCP56915 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GSCP56915 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GSCP56915 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GSCP56915 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GSCP56915 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GSCP56915 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GSCP56915 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GSCP56915 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GSCP56915 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GSCP56915 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GSCP56915 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GSCP56915 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GSCP56915 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GSCP56915 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GSCP56915 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GSCP56915 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GSCP56915 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GSCP56915 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GSCP56915 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GSCP56915 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GSCP56915 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GSCP56915 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GSCP56915 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GSCP56915 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GSCP56915 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GSCP56915 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GSCP56915 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GSCP56915 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GSCP56915 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GSCP56915 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GSCP56915 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GSCP56915 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
GSCP56915 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GSCP56915 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GSCP56915 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GSCP56915 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GSCP56915 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GSCP56915 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GSCP56915 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GSCP56915 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GSCP56915 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GSCP56915 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GSCP56915 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GSCP56915 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GSCP56915 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GSCP56915 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GSCP56915 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GSCP56915 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GSCP56915 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GSCP56915 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GSCP56915 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GSCP56915 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GSCP56915 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GSCP56915 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GSCP56915 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GSCP56915 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GSCP56915 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GSCP56915 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GSCP56915 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms