Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP12AP54707 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP12AP54707 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP12AP54707 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP12AP54707 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP12AP54707 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP12AP54707 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP12AP54707 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP12AP54707 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP12AP54707 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP12AP54707 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP12AP54707 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP12AP54707 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP12AP54707 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP12AP54707 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP12AP54707 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP12AP54707 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP12AP54707 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP12AP54707 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP12AP54707 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP12AP54707 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP12AP54707 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP12AP54707 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP12AP54707 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP12AP54707 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP12AP54707 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP12AP54707 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP12AP54707 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP12AP54707 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP12AP54707 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP12AP54707 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP12AP54707 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP12AP54707 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP12AP54707 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP12AP54707 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP12AP54707 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP12AP54707 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP12AP54707 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP12AP54707 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP12AP54707 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP12AP54707 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP12AP54707 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP12AP54707 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP12AP54707 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP12AP54707 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP12AP54707 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP12AP54707 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP12AP54707 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP12AP54707 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP12AP54707 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP12AP54707 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP12AP54707 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP12AP54707 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP12AP54707 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP12AP54707 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP12AP54707 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP12AP54707 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP12AP54707 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP12AP54707 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP12AP54707 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP12AP54707 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP12AP54707 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP12AP54707 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP12AP54707 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP12AP54707 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP12AP54707 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP12AP54707 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP12AP54707 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP12AP54707 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP12AP54707 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP12AP54707 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP12AP54707 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP12AP54707 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP12AP54707 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP12AP54707 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP12AP54707 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP12AP54707 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP12AP54707 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP12AP54707 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP12AP54707 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP12AP54707 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP12AP54707 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP12AP54707 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP12AP54707 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP12AP54707 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP12AP54707 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP12AP54707 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP12AP54707 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP12AP54707 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP12AP54707 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP12AP54707 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP12AP54707 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP12AP54707 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP12AP54707 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP12AP54707 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP12AP54707 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP12AP54707 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP12AP54707 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP12AP54707 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP12AP54707 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms