Protein–RNA interactions for Protein: P53900

GIM3, Prefoldin subunit 4, yeastyeast

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIM3P53900 SIS1YNL007C 1059 nt10.85□□□□□ -0.67
GIM3P53900 CAC2YML102W 1407 nt10.84□□□□□ -0.67
GIM3P53900 WWM1YFL010C 636 nt10.8□□□□□ -0.68
GIM3P53900 SCC4YER147C 1875 nt10.8□□□□□ -0.68
GIM3P53900 YGR021WYGR021W 873 nt10.79□□□□□ -0.68
GIM3P53900 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.78□□□□□ -0.68
GIM3P53900 IRC15YPL017C 1500 nt10.72□□□□□ -0.69
GIM3P53900 PCH2YBR186W 1695 nt10.72□□□□□ -0.69
GIM3P53900 YCH1YGR203W 447 nt10.68□□□□□ -0.7
GIM3P53900 PET9YBL030C 957 nt10.67□□□□□ -0.7
GIM3P53900 GIS3YLR094C 1509 nt10.66□□□□□ -0.7
GIM3P53900 GUT2YIL155C 1950 nt10.65□□□□□ -0.71
GIM3P53900 GFD2YCL036W 1701 nt10.64□□□□□ -0.71
GIM3P53900 ART5YGR068C 1761 nt10.63□□□□□ -0.71
GIM3P53900 HOM6YJR139C 1080 nt10.6□□□□□ -0.71
GIM3P53900 UME6YDR207C 2511 nt10.6□□□□□ -0.71
GIM3P53900 CUE1YMR264W 612 nt10.55□□□□□ -0.72
GIM3P53900 YNL195CYNL195C 786 nt10.55□□□□□ -0.72
GIM3P53900 YSC84YHR016C 1407 nt10.54□□□□□ -0.72
GIM3P53900 RTS2YOR077W 699 nt10.53□□□□□ -0.72
GIM3P53900 MOT3YMR070W 1473 nt10.52□□□□□ -0.73
GIM3P53900 SHU1YHL006C 453 nt10.49□□□□□ -0.73
GIM3P53900 YIL100WYIL100W 354 nt10.49□□□□□ -0.73
GIM3P53900 RKM5YLR137W 1104 nt10.46□□□□□ -0.73
GIM3P53900 RTF1YGL244W 1677 nt10.44□□□□□ -0.74
GIM3P53900 YHL050CYHL050C 2094 nt10.43□□□□□ -0.74
GIM3P53900 TIR4YOR009W 1464 nt10.43□□□□□ -0.74
GIM3P53900 BOP3YNL042W 1191 nt10.43□□□□□ -0.74
GIM3P53900 YLR236CYLR236C 324 nt10.42□□□□□ -0.74
GIM3P53900 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.4□□□□□ -0.74
GIM3P53900 MNP1YGL068W 585 nt10.39□□□□□ -0.75
GIM3P53900 YMR057CYMR057C 372 nt10.38□□□□□ -0.75
GIM3P53900 PIB2YGL023C 1908 nt10.37□□□□□ -0.75
GIM3P53900 RRT12YCR045C 1476 nt10.35□□□□□ -0.75
GIM3P53900 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.29□□□□□ -0.76
GIM3P53900 YKL097CYKL097C 411 nt10.28□□□□□ -0.76
GIM3P53900 NPL3YDR432W 1245 nt10.27□□□□□ -0.77
GIM3P53900 YJL152WYJL152W 360 nt10.26□□□□□ -0.77
GIM3P53900 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.26□□□□□ -0.77
GIM3P53900 YOL037CYOL037C 354 nt10.25□□□□□ -0.77
GIM3P53900 PTK1YKL198C 1989 nt10.19□□□□□ -0.78
GIM3P53900 NCP1YHR042W 2076 nt10.13□□□□□ -0.79
GIM3P53900 FRE6YLL051C 2139 nt10.1□□□□□ -0.79
GIM3P53900 FMP52YER004W 696 nt10.06□□□□□ -0.8
GIM3P53900 YFL054CYFL054C 1941 nt10.05□□□□□ -0.8
GIM3P53900 IDH1YNL037C 1083 nt10.02□□□□□ -0.81
GIM3P53900 SPT8YLR055C 1809 nt9.99□□□□□ -0.81
GIM3P53900 SSN3YPL042C 1668 nt9.99□□□□□ -0.81
GIM3P53900 LCB1YMR296C 1677 nt9.98□□□□□ -0.81
GIM3P53900 WHI5YOR083W 888 nt9.97□□□□□ -0.81
GIM3P53900 IMP2'YIL154C 1041 nt9.94□□□□□ -0.82
GIM3P53900 TCD2YKL027W 1344 nt9.93□□□□□ -0.82
GIM3P53900 YLR281CYLR281C 468 nt9.93□□□□□ -0.82
GIM3P53900 GBP2YCL011C 1284 nt9.93□□□□□ -0.82
GIM3P53900 BOR1YNL275W 1731 nt9.93□□□□□ -0.82
GIM3P53900 SIM1YIL123W 1431 nt9.91□□□□□ -0.82
GIM3P53900 RRD1YIL153W 1182 nt9.91□□□□□ -0.82
GIM3P53900 MCH5YOR306C 1566 nt9.9□□□□□ -0.82
GIM3P53900 PCM1YEL058W 1674 nt9.89□□□□□ -0.83
GIM3P53900 SNF6YHL025W 999 nt9.83□□□□□ -0.84
GIM3P53900 YOR139CYOR139C 393 nt9.81□□□□□ -0.84
GIM3P53900 SWE1YJL187C 2460 nt9.79□□□□□ -0.84
GIM3P53900 ERF2YLR246W 1080 nt9.79□□□□□ -0.84
GIM3P53900 DED1YOR204W 1815 nt9.79□□□□□ -0.84
GIM3P53900 LYS4YDR234W 2082 nt9.78□□□□□ -0.84
GIM3P53900 BIO4YNR057C 714 nt9.77□□□□□ -0.85
GIM3P53900 CWP1YKL096W 720 nt9.76□□□□□ -0.85
GIM3P53900 DSK2YMR276W 1122 nt9.75□□□□□ -0.85
GIM3P53900 BSP1YPR171W 1731 nt9.74□□□□□ -0.85
GIM3P53900 ADH2YMR303C 1047 nt9.73□□□□□ -0.85
GIM3P53900 YCL042WYCL042W 360 nt9.73□□□□□ -0.85
GIM3P53900 SOR2YDL246C 1074 nt9.72□□□□□ -0.85
GIM3P53900 SOR1YJR159W 1074 nt9.72□□□□□ -0.85
GIM3P53900 FMT1YBL013W 1206 nt9.71□□□□□ -0.86
GIM3P53900 GID7YCL039W 2238 nt9.7□□□□□ -0.86
GIM3P53900 YDR433WYDR433W 441 nt9.7□□□□□ -0.86
GIM3P53900 CRR1YLR213C 1269 nt9.69□□□□□ -0.86
GIM3P53900 YIH1YCR059C 777 nt9.68□□□□□ -0.86
GIM3P53900 HSP60YLR259C 1719 nt9.68□□□□□ -0.86
GIM3P53900 PUS2YGL063W 1113 nt9.67□□□□□ -0.86
GIM3P53900 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.66□□□□□ -0.86
GIM3P53900 RNQ1YCL028W 1218 nt9.65□□□□□ -0.86
GIM3P53900 UBX6YJL048C 1191 nt9.64□□□□□ -0.87
GIM3P53900 GLK1YCL040W 1503 nt9.63□□□□□ -0.87
GIM3P53900 YFL067WYFL067W 528 nt9.63□□□□□ -0.87
GIM3P53900 RAX1YOR301W 1308 nt9.61□□□□□ -0.87
GIM3P53900 HEM12YDR047W 1089 nt9.61□□□□□ -0.87
GIM3P53900 FMP45YDL222C 930 nt9.6□□□□□ -0.87
GIM3P53900 ERV46YAL042W 1248 nt9.59□□□□□ -0.87
GIM3P53900 YKR040CYKR040C 504 nt9.59□□□□□ -0.87
GIM3P53900 YLL053CYLL053C 459 nt9.59□□□□□ -0.87
GIM3P53900 MXR2YCL033C 507 nt9.55□□□□□ -0.88
GIM3P53900 FUR4YBR021W 1902 nt9.53□□□□□ -0.88
GIM3P53900 ALG12YNR030W 1656 nt9.53□□□□□ -0.88
GIM3P53900 FTR1YER145C 1215 nt9.53□□□□□ -0.88
GIM3P53900 DDR2YOL052C-A 186 nt9.52□□□□□ -0.89
GIM3P53900 AQY1YPR192W 918 nt9.52□□□□□ -0.89
GIM3P53900 FRD1YEL047C 1413 nt9.51□□□□□ -0.89
GIM3P53900 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.51□□□□□ -0.89
GIM3P53900 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.6 ms