Protein–RNA interactions for Protein: P53628

SNF12, Transcription regulatory protein SNF12, yeastyeast

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF12P53628 SCC4YER147C 1875 nt11.56□□□□□ -0.56
SNF12P53628 YGR021WYGR021W 873 nt11.55□□□□□ -0.56
SNF12P53628 GIS3YLR094C 1509 nt11.52□□□□□ -0.57
SNF12P53628 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.51□□□□□ -0.57
SNF12P53628 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.51□□□□□ -0.57
SNF12P53628 HOM6YJR139C 1080 nt11.5□□□□□ -0.57
SNF12P53628 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.49□□□□□ -0.57
SNF12P53628 GFD2YCL036W 1701 nt11.49□□□□□ -0.57
SNF12P53628 ART5YGR068C 1761 nt11.49□□□□□ -0.57
SNF12P53628 PCH2YBR186W 1695 nt11.46□□□□□ -0.57
SNF12P53628 GUT2YIL155C 1950 nt11.43□□□□□ -0.58
SNF12P53628 MNP1YGL068W 585 nt11.43□□□□□ -0.58
SNF12P53628 RTS2YOR077W 699 nt11.41□□□□□ -0.58
SNF12P53628 SEC11YIR022W 504 nt11.4□□□□□ -0.58
SNF12P53628 FPS1YLL043W 2010 nt11.36□□□□□ -0.59
SNF12P53628 PET9YBL030C 957 nt11.36□□□□□ -0.59
SNF12P53628 YSC84YHR016C 1407 nt11.35□□□□□ -0.59
SNF12P53628 RKM5YLR137W 1104 nt11.33□□□□□ -0.6
SNF12P53628 YOR139CYOR139C 393 nt11.32□□□□□ -0.6
SNF12P53628 PIB2YGL023C 1908 nt11.32□□□□□ -0.6
SNF12P53628 YHL050CYHL050C 2094 nt11.32□□□□□ -0.6
SNF12P53628 TIR4YOR009W 1464 nt11.31□□□□□ -0.6
SNF12P53628 CUE1YMR264W 612 nt11.28□□□□□ -0.6
SNF12P53628 YCH1YGR203W 447 nt11.25□□□□□ -0.61
SNF12P53628 RRT12YCR045C 1476 nt11.25□□□□□ -0.61
SNF12P53628 YMR057CYMR057C 372 nt11.22□□□□□ -0.61
SNF12P53628 YOL037CYOL037C 354 nt11.22□□□□□ -0.61
SNF12P53628 NPL3YDR432W 1245 nt11.21□□□□□ -0.61
SNF12P53628 RTF1YGL244W 1677 nt11.16□□□□□ -0.62
SNF12P53628 YIL100WYIL100W 354 nt11.1□□□□□ -0.63
SNF12P53628 YNL195CYNL195C 786 nt11.08□□□□□ -0.64
SNF12P53628 BOP3YNL042W 1191 nt11.05□□□□□ -0.64
SNF12P53628 PTK1YKL198C 1989 nt11.05□□□□□ -0.64
SNF12P53628 YLR236CYLR236C 324 nt11.02□□□□□ -0.65
SNF12P53628 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.01□□□□□ -0.65
SNF12P53628 NCP1YHR042W 2076 nt11□□□□□ -0.65
SNF12P53628 YJL152WYJL152W 360 nt10.99□□□□□ -0.65
SNF12P53628 YJL225CYJL225C 5277 nt10.98□□□□□ -0.65
SNF12P53628 YLR281CYLR281C 468 nt10.97□□□□□ -0.65
SNF12P53628 WHI5YOR083W 888 nt10.94□□□□□ -0.66
SNF12P53628 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.92□□□□□ -0.66
SNF12P53628 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.87□□□□□ -0.67
SNF12P53628 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.87□□□□□ -0.67
SNF12P53628 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.87□□□□□ -0.67
SNF12P53628 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.87□□□□□ -0.67
SNF12P53628 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.87□□□□□ -0.67
SNF12P53628 BOR1YNL275W 1731 nt10.87□□□□□ -0.67
SNF12P53628 LCB1YMR296C 1677 nt10.84□□□□□ -0.67
SNF12P53628 PUS2YGL063W 1113 nt10.82□□□□□ -0.68
SNF12P53628 RRD1YIL153W 1182 nt10.78□□□□□ -0.68
SNF12P53628 UME6YDR207C 2511 nt10.78□□□□□ -0.68
SNF12P53628 YFL054CYFL054C 1941 nt10.77□□□□□ -0.69
SNF12P53628 SPT8YLR055C 1809 nt10.72□□□□□ -0.69
SNF12P53628 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.71□□□□□ -0.7
SNF12P53628 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.71□□□□□ -0.7
SNF12P53628 DED1YOR204W 1815 nt10.7□□□□□ -0.7
SNF12P53628 IMP2'YIL154C 1041 nt10.7□□□□□ -0.7
SNF12P53628 DSK2YMR276W 1122 nt10.7□□□□□ -0.7
SNF12P53628 YPR011CYPR011C 981 nt10.66□□□□□ -0.7
SNF12P53628 FMT1YBL013W 1206 nt10.65□□□□□ -0.7
SNF12P53628 IDH1YNL037C 1083 nt10.65□□□□□ -0.7
SNF12P53628 GBP2YCL011C 1284 nt10.65□□□□□ -0.7
SNF12P53628 PCM1YEL058W 1674 nt10.64□□□□□ -0.71
SNF12P53628 FMP52YER004W 696 nt10.64□□□□□ -0.71
SNF12P53628 LYS4YDR234W 2082 nt10.63□□□□□ -0.71
SNF12P53628 SIM1YIL123W 1431 nt10.6□□□□□ -0.71
SNF12P53628 TCD2YKL027W 1344 nt10.58□□□□□ -0.71
SNF12P53628 FMP45YDL222C 930 nt10.55□□□□□ -0.72
SNF12P53628 ADH2YMR303C 1047 nt10.55□□□□□ -0.72
SNF12P53628 BIO4YNR057C 714 nt10.54□□□□□ -0.72
SNF12P53628 SWE1YJL187C 2460 nt10.53□□□□□ -0.72
SNF12P53628 CWP1YKL096W 720 nt10.51□□□□□ -0.73
SNF12P53628 ERV46YAL042W 1248 nt10.5□□□□□ -0.73
SNF12P53628 YDR433WYDR433W 441 nt10.49□□□□□ -0.73
SNF12P53628 SNF6YHL025W 999 nt10.49□□□□□ -0.73
SNF12P53628 LPX1YOR084W 1164 nt10.49□□□□□ -0.73
SNF12P53628 MCH5YOR306C 1566 nt10.48□□□□□ -0.73
SNF12P53628 MXR2YCL033C 507 nt10.48□□□□□ -0.73
SNF12P53628 HSP60YLR259C 1719 nt10.44□□□□□ -0.74
SNF12P53628 SOR2YDL246C 1074 nt10.44□□□□□ -0.74
SNF12P53628 SOR1YJR159W 1074 nt10.44□□□□□ -0.74
SNF12P53628 ALG12YNR030W 1656 nt10.43□□□□□ -0.74
SNF12P53628 YKR040CYKR040C 504 nt10.41□□□□□ -0.74
SNF12P53628 CRR1YLR213C 1269 nt10.39□□□□□ -0.75
SNF12P53628 YIH1YCR059C 777 nt10.38□□□□□ -0.75
SNF12P53628 ERF2YLR246W 1080 nt10.37□□□□□ -0.75
SNF12P53628 RPM1RPM1 483 nt10.35□□□□□ -0.75
SNF12P53628 YCL042WYCL042W 360 nt10.34□□□□□ -0.75
SNF12P53628 FRD1YEL047C 1413 nt10.33□□□□□ -0.76
SNF12P53628 YLL053CYLL053C 459 nt10.33□□□□□ -0.76
SNF12P53628 MIC10YCL057C-A 294 nt10.32□□□□□ -0.76
SNF12P53628 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.31□□□□□ -0.76
SNF12P53628 RNQ1YCL028W 1218 nt10.31□□□□□ -0.76
SNF12P53628 ATF2YGR177C 1608 nt10.3□□□□□ -0.76
SNF12P53628 GLK1YCL040W 1503 nt10.28□□□□□ -0.76
SNF12P53628 HEM12YDR047W 1089 nt10.26□□□□□ -0.77
SNF12P53628 SPP1YPL138C 1062 nt10.26□□□□□ -0.77
SNF12P53628 SNG1YGR197C 1644 nt10.24□□□□□ -0.77
SNF12P53628 CCA1YER168C 1641 nt10.23□□□□□ -0.77
SNF12P53628 FTR1YER145C 1215 nt10.23□□□□□ -0.77
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