Protein–RNA interactions for Protein: P53040

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, yeastyeast

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF6P53040 SHU1YHL006C 453 nt12.41□□□□□ -0.42
TAF6P53040 GFD2YCL036W 1701 nt12.41□□□□□ -0.42
TAF6P53040 HOM6YJR139C 1080 nt12.39□□□□□ -0.43
TAF6P53040 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.39□□□□□ -0.43
TAF6P53040 SEC11YIR022W 504 nt12.38□□□□□ -0.43
TAF6P53040 PCH2YBR186W 1695 nt12.38□□□□□ -0.43
TAF6P53040 RTS2YOR077W 699 nt12.33□□□□□ -0.44
TAF6P53040 PET9YBL030C 957 nt12.32□□□□□ -0.44
TAF6P53040 GUT2YIL155C 1950 nt12.31□□□□□ -0.44
TAF6P53040 YSC84YHR016C 1407 nt12.27□□□□□ -0.45
TAF6P53040 MNP1YGL068W 585 nt12.26□□□□□ -0.45
TAF6P53040 YCH1YGR203W 447 nt12.26□□□□□ -0.45
TAF6P53040 PAC11YDR488C 1602 nt12.22□□□□□ -0.45
TAF6P53040 RKM5YLR137W 1104 nt12.22□□□□□ -0.45
TAF6P53040 TIR4YOR009W 1464 nt12.21□□□□□ -0.45
TAF6P53040 CUE1YMR264W 612 nt12.21□□□□□ -0.45
TAF6P53040 YKL097CYKL097C 411 nt12.19□□□□□ -0.46
TAF6P53040 YHL050CYHL050C 2094 nt12.17□□□□□ -0.46
TAF6P53040 YMR057CYMR057C 372 nt12.16□□□□□ -0.46
TAF6P53040 RRT12YCR045C 1476 nt12.13□□□□□ -0.47
TAF6P53040 PIB2YGL023C 1908 nt12.1□□□□□ -0.47
TAF6P53040 YNL195CYNL195C 786 nt12.1□□□□□ -0.47
TAF6P53040 YIL100WYIL100W 354 nt12.09□□□□□ -0.47
TAF6P53040 FPS1YLL043W 2010 nt12.05□□□□□ -0.48
TAF6P53040 RTF1YGL244W 1677 nt12.05□□□□□ -0.48
TAF6P53040 NPL3YDR432W 1245 nt12.02□□□□□ -0.49
TAF6P53040 YLR236CYLR236C 324 nt12.02□□□□□ -0.49
TAF6P53040 YJL152WYJL152W 360 nt12□□□□□ -0.49
TAF6P53040 BOP3YNL042W 1191 nt11.98□□□□□ -0.49
TAF6P53040 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.97□□□□□ -0.49
TAF6P53040 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.92□□□□□ -0.5
TAF6P53040 NVJ2YPR091C 2313 nt11.9□□□□□ -0.5
TAF6P53040 YOL037CYOL037C 354 nt11.87□□□□□ -0.51
TAF6P53040 PTK1YKL198C 1989 nt11.87□□□□□ -0.51
TAF6P53040 NCP1YHR042W 2076 nt11.8□□□□□ -0.52
TAF6P53040 WHI5YOR083W 888 nt11.69□□□□□ -0.54
TAF6P53040 YOR139CYOR139C 393 nt11.67□□□□□ -0.54
TAF6P53040 LCB1YMR296C 1677 nt11.67□□□□□ -0.54
TAF6P53040 YFL054CYFL054C 1941 nt11.66□□□□□ -0.54
TAF6P53040 YLR281CYLR281C 468 nt11.65□□□□□ -0.54
TAF6P53040 RRD1YIL153W 1182 nt11.63□□□□□ -0.55
TAF6P53040 IDH1YNL037C 1083 nt11.62□□□□□ -0.55
TAF6P53040 GBP2YCL011C 1284 nt11.6□□□□□ -0.55
TAF6P53040 FMP52YER004W 696 nt11.57□□□□□ -0.56
TAF6P53040 SPT8YLR055C 1809 nt11.55□□□□□ -0.56
TAF6P53040 TCD2YKL027W 1344 nt11.55□□□□□ -0.56
TAF6P53040 DED1YOR204W 1815 nt11.53□□□□□ -0.56
TAF6P53040 PCM1YEL058W 1674 nt11.52□□□□□ -0.56
TAF6P53040 SIM1YIL123W 1431 nt11.52□□□□□ -0.56
TAF6P53040 FMT1YBL013W 1206 nt11.46□□□□□ -0.57
TAF6P53040 IMP2'YIL154C 1041 nt11.44□□□□□ -0.58
TAF6P53040 LYS4YDR234W 2082 nt11.43□□□□□ -0.58
TAF6P53040 CWP1YKL096W 720 nt11.42□□□□□ -0.58
TAF6P53040 ADH2YMR303C 1047 nt11.41□□□□□ -0.58
TAF6P53040 PUS2YGL063W 1113 nt11.4□□□□□ -0.58
TAF6P53040 SNF6YHL025W 999 nt11.4□□□□□ -0.58
TAF6P53040 DSK2YMR276W 1122 nt11.39□□□□□ -0.59
TAF6P53040 BIO4YNR057C 714 nt11.39□□□□□ -0.59
TAF6P53040 YDR433WYDR433W 441 nt11.38□□□□□ -0.59
TAF6P53040 BOR1YNL275W 1731 nt11.38□□□□□ -0.59
TAF6P53040 YJL225CYJL225C 5277 nt11.36□□□□□ -0.59
TAF6P53040 SWE1YJL187C 2460 nt11.35□□□□□ -0.59
TAF6P53040 MXR2YCL033C 507 nt11.33□□□□□ -0.6
TAF6P53040 FMP45YDL222C 930 nt11.31□□□□□ -0.6
TAF6P53040 SOR2YDL246C 1074 nt11.3□□□□□ -0.6
TAF6P53040 SOR1YJR159W 1074 nt11.3□□□□□ -0.6
TAF6P53040 YCL042WYCL042W 360 nt11.3□□□□□ -0.6
TAF6P53040 ERF2YLR246W 1080 nt11.27□□□□□ -0.61
TAF6P53040 YPR011CYPR011C 981 nt11.27□□□□□ -0.61
TAF6P53040 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.26□□□□□ -0.61
TAF6P53040 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.26□□□□□ -0.61
TAF6P53040 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.26□□□□□ -0.61
TAF6P53040 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.26□□□□□ -0.61
TAF6P53040 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.26□□□□□ -0.61
TAF6P53040 YIH1YCR059C 777 nt11.23□□□□□ -0.61
TAF6P53040 CRR1YLR213C 1269 nt11.22□□□□□ -0.61
TAF6P53040 ERV46YAL042W 1248 nt11.2□□□□□ -0.62
TAF6P53040 YLL053CYLL053C 459 nt11.2□□□□□ -0.62
TAF6P53040 YKR040CYKR040C 504 nt11.19□□□□□ -0.62
TAF6P53040 LPX1YOR084W 1164 nt11.19□□□□□ -0.62
TAF6P53040 RNQ1YCL028W 1218 nt11.19□□□□□ -0.62
TAF6P53040 HSP60YLR259C 1719 nt11.17□□□□□ -0.62
TAF6P53040 FRD1YEL047C 1413 nt11.17□□□□□ -0.62
TAF6P53040 HEM12YDR047W 1089 nt11.15□□□□□ -0.62
TAF6P53040 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.14□□□□□ -0.63
TAF6P53040 ATF2YGR177C 1608 nt11.13□□□□□ -0.63
TAF6P53040 MIC10YCL057C-A 294 nt11.12□□□□□ -0.63
TAF6P53040 YFL067WYFL067W 528 nt11.1□□□□□ -0.63
TAF6P53040 GLK1YCL040W 1503 nt11.09□□□□□ -0.63
TAF6P53040 RAX1YOR301W 1308 nt11.09□□□□□ -0.63
TAF6P53040 UME6YDR207C 2511 nt11.08□□□□□ -0.64
TAF6P53040 FTR1YER145C 1215 nt11.08□□□□□ -0.64
TAF6P53040 SNG1YGR197C 1644 nt11.07□□□□□ -0.64
TAF6P53040 TRM5YHR070W 1500 nt11.04□□□□□ -0.64
TAF6P53040 FUR4YBR021W 1902 nt11.04□□□□□ -0.64
TAF6P53040 DIC1YLR348C 897 nt11.04□□□□□ -0.64
TAF6P53040 DDR2YOL052C-A 186 nt11.04□□□□□ -0.64
TAF6P53040 GAL1YBR020W 1587 nt11.03□□□□□ -0.64
TAF6P53040 CCA1YER168C 1641 nt11.03□□□□□ -0.64
TAF6P53040 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 169.5 ms