Protein–RNA interactions for Protein: P53010

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PAN2P53010 MNP1YGL068W 585 nt12.47□□□□□ -0.41
PAN2P53010 IRC15YPL017C 1500 nt12.47□□□□□ -0.41
PAN2P53010 ART5YGR068C 1761 nt12.42□□□□□ -0.42
PAN2P53010 GFD2YCL036W 1701 nt12.4□□□□□ -0.42
PAN2P53010 SCC4YER147C 1875 nt12.4□□□□□ -0.42
PAN2P53010 GIS3YLR094C 1509 nt12.37□□□□□ -0.43
PAN2P53010 RKM5YLR137W 1104 nt12.35□□□□□ -0.43
PAN2P53010 RTS2YOR077W 699 nt12.33□□□□□ -0.44
PAN2P53010 PAC11YDR488C 1602 nt12.32□□□□□ -0.44
PAN2P53010 PET9YBL030C 957 nt12.29□□□□□ -0.44
PAN2P53010 TIR4YOR009W 1464 nt12.27□□□□□ -0.44
PAN2P53010 YOR139CYOR139C 393 nt12.27□□□□□ -0.45
PAN2P53010 NPL3YDR432W 1245 nt12.24□□□□□ -0.45
PAN2P53010 PCH2YBR186W 1695 nt12.19□□□□□ -0.46
PAN2P53010 YCH1YGR203W 447 nt12.19□□□□□ -0.46
PAN2P53010 YMR057CYMR057C 372 nt12.19□□□□□ -0.46
PAN2P53010 SEC11YIR022W 504 nt12.17□□□□□ -0.46
PAN2P53010 CUE1YMR264W 612 nt12.17□□□□□ -0.46
PAN2P53010 NVJ2YPR091C 2313 nt12.17□□□□□ -0.46
PAN2P53010 YSC84YHR016C 1407 nt12.16□□□□□ -0.46
PAN2P53010 GUT2YIL155C 1950 nt12.14□□□□□ -0.47
PAN2P53010 YOL037CYOL037C 354 nt12.12□□□□□ -0.47
PAN2P53010 YHL050CYHL050C 2094 nt12.09□□□□□ -0.47
PAN2P53010 RRT12YCR045C 1476 nt12.08□□□□□ -0.48
PAN2P53010 FPS1YLL043W 2010 nt12.07□□□□□ -0.48
PAN2P53010 YJL152WYJL152W 360 nt12.06□□□□□ -0.48
PAN2P53010 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.06□□□□□ -0.48
PAN2P53010 YIL100WYIL100W 354 nt12.01□□□□□ -0.49
PAN2P53010 YNL195CYNL195C 786 nt11.97□□□□□ -0.49
PAN2P53010 PIB2YGL023C 1908 nt11.97□□□□□ -0.49
PAN2P53010 YLR236CYLR236C 324 nt11.95□□□□□ -0.5
PAN2P53010 Q0182Q0182 405 nt11.92□□□□□ -0.5
PAN2P53010 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.92□□□□□ -0.5
PAN2P53010 RTF1YGL244W 1677 nt11.88□□□□□ -0.51
PAN2P53010 WHI5YOR083W 888 nt11.86□□□□□ -0.51
PAN2P53010 YLR281CYLR281C 468 nt11.81□□□□□ -0.52
PAN2P53010 BOP3YNL042W 1191 nt11.81□□□□□ -0.52
PAN2P53010 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.8□□□□□ -0.52
PAN2P53010 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.8□□□□□ -0.52
PAN2P53010 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.8□□□□□ -0.52
PAN2P53010 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.8□□□□□ -0.52
PAN2P53010 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.8□□□□□ -0.52
PAN2P53010 PTK1YKL198C 1989 nt11.73□□□□□ -0.53
PAN2P53010 PUS2YGL063W 1113 nt11.72□□□□□ -0.53
PAN2P53010 NCP1YHR042W 2076 nt11.71□□□□□ -0.53
PAN2P53010 RRD1YIL153W 1182 nt11.7□□□□□ -0.54
PAN2P53010 IDH1YNL037C 1083 nt11.69□□□□□ -0.54
PAN2P53010 GBP2YCL011C 1284 nt11.68□□□□□ -0.54
PAN2P53010 LCB1YMR296C 1677 nt11.63□□□□□ -0.55
PAN2P53010 DED1YOR204W 1815 nt11.63□□□□□ -0.55
PAN2P53010 TCD2YKL027W 1344 nt11.58□□□□□ -0.56
PAN2P53010 FMT1YBL013W 1206 nt11.57□□□□□ -0.56
PAN2P53010 FMP52YER004W 696 nt11.55□□□□□ -0.56
PAN2P53010 IMP2'YIL154C 1041 nt11.55□□□□□ -0.56
PAN2P53010 DSK2YMR276W 1122 nt11.54□□□□□ -0.56
PAN2P53010 YPR011CYPR011C 981 nt11.54□□□□□ -0.56
PAN2P53010 PCM1YEL058W 1674 nt11.53□□□□□ -0.56
PAN2P53010 YFL054CYFL054C 1941 nt11.5□□□□□ -0.57
PAN2P53010 MXR2YCL033C 507 nt11.5□□□□□ -0.57
PAN2P53010 YDR433WYDR433W 441 nt11.49□□□□□ -0.57
PAN2P53010 SIM1YIL123W 1431 nt11.49□□□□□ -0.57
PAN2P53010 ADH2YMR303C 1047 nt11.48□□□□□ -0.57
PAN2P53010 CWP1YKL096W 720 nt11.47□□□□□ -0.57
PAN2P53010 FMP45YDL222C 930 nt11.46□□□□□ -0.57
PAN2P53010 MOT3YMR070W 1473 nt11.43□□□□□ -0.58
PAN2P53010 SNF6YHL025W 999 nt11.41□□□□□ -0.58
PAN2P53010 SPT8YLR055C 1809 nt11.4□□□□□ -0.58
PAN2P53010 BIO4YNR057C 714 nt11.4□□□□□ -0.58
PAN2P53010 LPX1YOR084W 1164 nt11.39□□□□□ -0.59
PAN2P53010 LYS4YDR234W 2082 nt11.38□□□□□ -0.59
PAN2P53010 SOR2YDL246C 1074 nt11.37□□□□□ -0.59
PAN2P53010 SOR1YJR159W 1074 nt11.37□□□□□ -0.59
PAN2P53010 ERV46YAL042W 1248 nt11.36□□□□□ -0.59
PAN2P53010 YCL042WYCL042W 360 nt11.34□□□□□ -0.59
PAN2P53010 YKR040CYKR040C 504 nt11.33□□□□□ -0.6
PAN2P53010 FRD1YEL047C 1413 nt11.3□□□□□ -0.6
PAN2P53010 UME6YDR207C 2511 nt11.28□□□□□ -0.6
PAN2P53010 YIH1YCR059C 777 nt11.26□□□□□ -0.61
PAN2P53010 SWE1YJL187C 2460 nt11.23□□□□□ -0.61
PAN2P53010 YLL053CYLL053C 459 nt11.23□□□□□ -0.61
PAN2P53010 ERF2YLR246W 1080 nt11.22□□□□□ -0.61
PAN2P53010 RNQ1YCL028W 1218 nt11.21□□□□□ -0.61
PAN2P53010 CRR1YLR213C 1269 nt11.2□□□□□ -0.62
PAN2P53010 ATF2YGR177C 1608 nt11.15□□□□□ -0.62
PAN2P53010 MIC10YCL057C-A 294 nt11.14□□□□□ -0.63
PAN2P53010 DIC1YLR348C 897 nt11.12□□□□□ -0.63
PAN2P53010 FTR1YER145C 1215 nt11.11□□□□□ -0.63
PAN2P53010 HEM12YDR047W 1089 nt11.1□□□□□ -0.63
PAN2P53010 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.1□□□□□ -0.63
PAN2P53010 MRPL8YJL063C 717 nt11.08□□□□□ -0.64
PAN2P53010 BOR1YNL275W 1731 nt11.08□□□□□ -0.64
PAN2P53010 TRM5YHR070W 1500 nt11.08□□□□□ -0.64
PAN2P53010 SNG1YGR197C 1644 nt11.07□□□□□ -0.64
PAN2P53010 GAL1YBR020W 1587 nt11.07□□□□□ -0.64
PAN2P53010 YFL067WYFL067W 528 nt11.06□□□□□ -0.64
PAN2P53010 SPP1YPL138C 1062 nt11.06□□□□□ -0.64
PAN2P53010 PTH1YHR189W 573 nt11.04□□□□□ -0.64
PAN2P53010 DDR2YOL052C-A 186 nt11.02□□□□□ -0.65
PAN2P53010 RAX1YOR301W 1308 nt10.99□□□□□ -0.65
PAN2P53010 CCA1YER168C 1641 nt10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14 ms