Protein–RNA interactions for Protein: P47108

URB2, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
URB2P47108 HOM6YJR139C 1080 nt12.76□□□□□ -0.37
URB2P47108 GIS3YLR094C 1509 nt12.73□□□□□ -0.37
URB2P47108 ART5YGR068C 1761 nt12.73□□□□□ -0.37
URB2P47108 GFD2YCL036W 1701 nt12.73□□□□□ -0.37
URB2P47108 MNP1YGL068W 585 nt12.66□□□□□ -0.38
URB2P47108 RTS2YOR077W 699 nt12.64□□□□□ -0.39
URB2P47108 PCH2YBR186W 1695 nt12.61□□□□□ -0.39
URB2P47108 PET9YBL030C 957 nt12.59□□□□□ -0.39
URB2P47108 SEC11YIR022W 504 nt12.57□□□□□ -0.4
URB2P47108 RKM5YLR137W 1104 nt12.57□□□□□ -0.4
URB2P47108 GUT2YIL155C 1950 nt12.57□□□□□ -0.4
URB2P47108 TIR4YOR009W 1464 nt12.56□□□□□ -0.4
URB2P47108 YSC84YHR016C 1407 nt12.53□□□□□ -0.4
URB2P47108 YCH1YGR203W 447 nt12.49□□□□□ -0.41
URB2P47108 CUE1YMR264W 612 nt12.49□□□□□ -0.41
URB2P47108 YHL050CYHL050C 2094 nt12.47□□□□□ -0.41
URB2P47108 YMR057CYMR057C 372 nt12.46□□□□□ -0.41
URB2P47108 PAC11YDR488C 1602 nt12.44□□□□□ -0.42
URB2P47108 YKL097CYKL097C 411 nt12.44□□□□□ -0.42
URB2P47108 RRT12YCR045C 1476 nt12.41□□□□□ -0.42
URB2P47108 PIB2YGL023C 1908 nt12.41□□□□□ -0.42
URB2P47108 NPL3YDR432W 1245 nt12.38□□□□□ -0.43
URB2P47108 FPS1YLL043W 2010 nt12.38□□□□□ -0.43
URB2P47108 NVJ2YPR091C 2313 nt12.34□□□□□ -0.43
URB2P47108 YIL100WYIL100W 354 nt12.31□□□□□ -0.44
URB2P47108 YNL195CYNL195C 786 nt12.28□□□□□ -0.44
URB2P47108 RTF1YGL244W 1677 nt12.28□□□□□ -0.44
URB2P47108 YJL152WYJL152W 360 nt12.27□□□□□ -0.45
URB2P47108 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.27□□□□□ -0.45
URB2P47108 YLR236CYLR236C 324 nt12.24□□□□□ -0.45
URB2P47108 YOL037CYOL037C 354 nt12.21□□□□□ -0.45
URB2P47108 BOP3YNL042W 1191 nt12.18□□□□□ -0.46
URB2P47108 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.16□□□□□ -0.46
URB2P47108 YJL225CYJL225C 5277 nt12.15□□□□□ -0.46
URB2P47108 PTK1YKL198C 1989 nt12.14□□□□□ -0.47
URB2P47108 NCP1YHR042W 2076 nt12.1□□□□□ -0.47
URB2P47108 YOR139CYOR139C 393 nt12.08□□□□□ -0.48
URB2P47108 WHI5YOR083W 888 nt12.03□□□□□ -0.48
URB2P47108 Q0182Q0182 405 nt12□□□□□ -0.49
URB2P47108 YLR281CYLR281C 468 nt11.99□□□□□ -0.49
URB2P47108 LCB1YMR296C 1677 nt11.97□□□□□ -0.49
URB2P47108 RRD1YIL153W 1182 nt11.96□□□□□ -0.49
URB2P47108 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.93□□□□□ -0.5
URB2P47108 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.93□□□□□ -0.5
URB2P47108 IDH1YNL037C 1083 nt11.89□□□□□ -0.51
URB2P47108 DED1YOR204W 1815 nt11.88□□□□□ -0.51
URB2P47108 GBP2YCL011C 1284 nt11.88□□□□□ -0.51
URB2P47108 YFL054CYFL054C 1941 nt11.87□□□□□ -0.51
URB2P47108 FMP52YER004W 696 nt11.82□□□□□ -0.52
URB2P47108 FMT1YBL013W 1206 nt11.82□□□□□ -0.52
URB2P47108 TCD2YKL027W 1344 nt11.81□□□□□ -0.52
URB2P47108 PCM1YEL058W 1674 nt11.81□□□□□ -0.52
URB2P47108 SPT8YLR055C 1809 nt11.79□□□□□ -0.52
URB2P47108 SIM1YIL123W 1431 nt11.77□□□□□ -0.53
URB2P47108 LYS4YDR234W 2082 nt11.73□□□□□ -0.53
URB2P47108 PUS2YGL063W 1113 nt11.73□□□□□ -0.53
URB2P47108 ADH2YMR303C 1047 nt11.73□□□□□ -0.53
URB2P47108 CWP1YKL096W 720 nt11.71□□□□□ -0.53
URB2P47108 DSK2YMR276W 1122 nt11.71□□□□□ -0.53
URB2P47108 IMP2'YIL154C 1041 nt11.7□□□□□ -0.54
URB2P47108 YPR011CYPR011C 981 nt11.7□□□□□ -0.54
URB2P47108 MXR2YCL033C 507 nt11.69□□□□□ -0.54
URB2P47108 YDR433WYDR433W 441 nt11.68□□□□□ -0.54
URB2P47108 BIO4YNR057C 714 nt11.68□□□□□ -0.54
URB2P47108 SNF6YHL025W 999 nt11.66□□□□□ -0.54
URB2P47108 FMP45YDL222C 930 nt11.65□□□□□ -0.54
URB2P47108 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.64□□□□□ -0.55
URB2P47108 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.64□□□□□ -0.55
URB2P47108 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.64□□□□□ -0.55
URB2P47108 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.64□□□□□ -0.55
URB2P47108 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.64□□□□□ -0.55
URB2P47108 SOR2YDL246C 1074 nt11.61□□□□□ -0.55
URB2P47108 SOR1YJR159W 1074 nt11.61□□□□□ -0.55
URB2P47108 SWE1YJL187C 2460 nt11.6□□□□□ -0.55
URB2P47108 LPX1YOR084W 1164 nt11.56□□□□□ -0.56
URB2P47108 ERV46YAL042W 1248 nt11.55□□□□□ -0.56
URB2P47108 YCL042WYCL042W 360 nt11.54□□□□□ -0.56
URB2P47108 YIH1YCR059C 777 nt11.52□□□□□ -0.57
URB2P47108 FRD1YEL047C 1413 nt11.52□□□□□ -0.57
URB2P47108 ERF2YLR246W 1080 nt11.51□□□□□ -0.57
URB2P47108 BOR1YNL275W 1731 nt11.51□□□□□ -0.57
URB2P47108 YKR040CYKR040C 504 nt11.5□□□□□ -0.57
URB2P47108 CRR1YLR213C 1269 nt11.5□□□□□ -0.57
URB2P47108 YLL053CYLL053C 459 nt11.48□□□□□ -0.57
URB2P47108 RNQ1YCL028W 1218 nt11.46□□□□□ -0.57
URB2P47108 ATF2YGR177C 1608 nt11.42□□□□□ -0.58
URB2P47108 MIC10YCL057C-A 294 nt11.42□□□□□ -0.58
URB2P47108 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.41□□□□□ -0.58
URB2P47108 HEM12YDR047W 1089 nt11.38□□□□□ -0.59
URB2P47108 HSP60YLR259C 1719 nt11.38□□□□□ -0.59
URB2P47108 UME6YDR207C 2511 nt11.37□□□□□ -0.59
URB2P47108 SNG1YGR197C 1644 nt11.35□□□□□ -0.59
URB2P47108 FTR1YER145C 1215 nt11.35□□□□□ -0.59
URB2P47108 DIC1YLR348C 897 nt11.33□□□□□ -0.6
URB2P47108 TRM5YHR070W 1500 nt11.33□□□□□ -0.6
URB2P47108 GAL1YBR020W 1587 nt11.33□□□□□ -0.6
URB2P47108 YFL067WYFL067W 528 nt11.32□□□□□ -0.6
URB2P47108 CCA1YER168C 1641 nt11.3□□□□□ -0.6
URB2P47108 RAX1YOR301W 1308 nt11.3□□□□□ -0.6
URB2P47108 MOT3YMR070W 1473 nt11.28□□□□□ -0.6
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