Protein–RNA interactions for Protein: P47095

MDE1, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, yeastyeast

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDE1P47095 EMI2YDR516C 1503 nt11.31□□□□□ -0.6
MDE1P47095 RKM5YLR137W 1104 nt11.3□□□□□ -0.6
MDE1P47095 SIS1YNL007C 1059 nt11.3□□□□□ -0.6
MDE1P47095 GUT2YIL155C 1950 nt11.28□□□□□ -0.6
MDE1P47095 PCH2YBR186W 1695 nt11.27□□□□□ -0.61
MDE1P47095 UME6YDR207C 2511 nt11.26□□□□□ -0.61
MDE1P47095 PTP1YDL230W 1008 nt11.24□□□□□ -0.61
MDE1P47095 YDL221WYDL221W 552 nt11.22□□□□□ -0.61
MDE1P47095 CAC2YML102W 1407 nt11.18□□□□□ -0.62
MDE1P47095 YOL037CYOL037C 354 nt11.17□□□□□ -0.62
MDE1P47095 PIB2YGL023C 1908 nt11.17□□□□□ -0.62
MDE1P47095 SDH1YKL148C 1923 nt11.14□□□□□ -0.63
MDE1P47095 YCH1YGR203W 447 nt11.12□□□□□ -0.63
MDE1P47095 ART5YGR068C 1761 nt11.11□□□□□ -0.63
MDE1P47095 NPL3YDR432W 1245 nt11.1□□□□□ -0.63
MDE1P47095 PET9YBL030C 957 nt11.1□□□□□ -0.63
MDE1P47095 SEC11YIR022W 504 nt11.08□□□□□ -0.64
MDE1P47095 GFD2YCL036W 1701 nt11.07□□□□□ -0.64
MDE1P47095 SCC4YER147C 1875 nt11.02□□□□□ -0.64
MDE1P47095 IRC15YPL017C 1500 nt11.02□□□□□ -0.65
MDE1P47095 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11□□□□□ -0.65
MDE1P47095 YJL152WYJL152W 360 nt10.99□□□□□ -0.65
MDE1P47095 TIR4YOR009W 1464 nt10.99□□□□□ -0.65
MDE1P47095 YOR139CYOR139C 393 nt10.98□□□□□ -0.65
MDE1P47095 RTS2YOR077W 699 nt10.97□□□□□ -0.65
MDE1P47095 GIS3YLR094C 1509 nt10.97□□□□□ -0.65
MDE1P47095 YMR057CYMR057C 372 nt10.93□□□□□ -0.66
MDE1P47095 CUE1YMR264W 612 nt10.91□□□□□ -0.66
MDE1P47095 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.88□□□□□ -0.67
MDE1P47095 YIL100WYIL100W 354 nt10.87□□□□□ -0.67
MDE1P47095 RTF1YGL244W 1677 nt10.86□□□□□ -0.67
MDE1P47095 WHI5YOR083W 888 nt10.86□□□□□ -0.67
MDE1P47095 BOR1YNL275W 1731 nt10.85□□□□□ -0.67
MDE1P47095 YJL225CYJL225C 5277 nt10.85□□□□□ -0.67
MDE1P47095 YLR236CYLR236C 324 nt10.84□□□□□ -0.67
MDE1P47095 YLR281CYLR281C 468 nt10.84□□□□□ -0.67
MDE1P47095 YNL195CYNL195C 786 nt10.83□□□□□ -0.68
MDE1P47095 PTK1YKL198C 1989 nt10.8□□□□□ -0.68
MDE1P47095 YSC84YHR016C 1407 nt10.78□□□□□ -0.68
MDE1P47095 IDH1YNL037C 1083 nt10.76□□□□□ -0.69
MDE1P47095 YHL050CYHL050C 2094 nt10.76□□□□□ -0.69
MDE1P47095 IMP2'YIL154C 1041 nt10.74□□□□□ -0.69
MDE1P47095 MCH5YOR306C 1566 nt10.73□□□□□ -0.69
MDE1P47095 PUS2YGL063W 1113 nt10.69□□□□□ -0.7
MDE1P47095 RPM1RPM1 483 nt10.69□□□□□ -0.7
MDE1P47095 BOP3YNL042W 1191 nt10.66□□□□□ -0.7
MDE1P47095 DSK2YMR276W 1122 nt10.65□□□□□ -0.7
MDE1P47095 GBP2YCL011C 1284 nt10.65□□□□□ -0.7
MDE1P47095 RRT12YCR045C 1476 nt10.63□□□□□ -0.71
MDE1P47095 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.6□□□□□ -0.71
MDE1P47095 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.6□□□□□ -0.71
MDE1P47095 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.6□□□□□ -0.71
MDE1P47095 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.6□□□□□ -0.71
MDE1P47095 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.6□□□□□ -0.71
MDE1P47095 TCD2YKL027W 1344 nt10.58□□□□□ -0.71
MDE1P47095 FMP52YER004W 696 nt10.53□□□□□ -0.72
MDE1P47095 ALG12YNR030W 1656 nt10.53□□□□□ -0.72
MDE1P47095 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.52□□□□□ -0.73
MDE1P47095 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.52□□□□□ -0.73
MDE1P47095 YDR433WYDR433W 441 nt10.52□□□□□ -0.73
MDE1P47095 RRD1YIL153W 1182 nt10.49□□□□□ -0.73
MDE1P47095 SPT8YLR055C 1809 nt10.46□□□□□ -0.74
MDE1P47095 NCP1YHR042W 2076 nt10.46□□□□□ -0.74
MDE1P47095 FRE6YLL051C 2139 nt10.45□□□□□ -0.74
MDE1P47095 YFL054CYFL054C 1941 nt10.43□□□□□ -0.74
MDE1P47095 FMP45YDL222C 930 nt10.42□□□□□ -0.74
MDE1P47095 HSP60YLR259C 1719 nt10.41□□□□□ -0.74
MDE1P47095 DED1YOR204W 1815 nt10.41□□□□□ -0.74
MDE1P47095 ERV46YAL042W 1248 nt10.4□□□□□ -0.74
MDE1P47095 YCL042WYCL042W 360 nt10.4□□□□□ -0.74
MDE1P47095 YPR011CYPR011C 981 nt10.39□□□□□ -0.75
MDE1P47095 YKR040CYKR040C 504 nt10.38□□□□□ -0.75
MDE1P47095 PCM1YEL058W 1674 nt10.37□□□□□ -0.75
MDE1P47095 MXR2YCL033C 507 nt10.36□□□□□ -0.75
MDE1P47095 SNF6YHL025W 999 nt10.35□□□□□ -0.75
MDE1P47095 CWP1YKL096W 720 nt10.35□□□□□ -0.75
MDE1P47095 LPX1YOR084W 1164 nt10.35□□□□□ -0.75
MDE1P47095 SIM1YIL123W 1431 nt10.33□□□□□ -0.76
MDE1P47095 FMT1YBL013W 1206 nt10.32□□□□□ -0.76
MDE1P47095 SOR2YDL246C 1074 nt10.31□□□□□ -0.76
MDE1P47095 SOR1YJR159W 1074 nt10.31□□□□□ -0.76
MDE1P47095 ADH2YMR303C 1047 nt10.3□□□□□ -0.76
MDE1P47095 LCB1YMR296C 1677 nt10.29□□□□□ -0.76
MDE1P47095 FRD1YEL047C 1413 nt10.22□□□□□ -0.77
MDE1P47095 BIO4YNR057C 714 nt10.2□□□□□ -0.78
MDE1P47095 SWE1YJL187C 2460 nt10.18□□□□□ -0.78
MDE1P47095 GLK1YCL040W 1503 nt10.17□□□□□ -0.78
MDE1P47095 NAR1YNL240C 1476 nt10.17□□□□□ -0.78
MDE1P47095 YIH1YCR059C 777 nt10.16□□□□□ -0.78
MDE1P47095 ERF2YLR246W 1080 nt10.16□□□□□ -0.78
MDE1P47095 RNQ1YCL028W 1218 nt10.16□□□□□ -0.78
MDE1P47095 HSL7YBR133C 2484 nt10.13□□□□□ -0.79
MDE1P47095 YLL053CYLL053C 459 nt10.1□□□□□ -0.79
MDE1P47095 DIC1YLR348C 897 nt10.09□□□□□ -0.79
MDE1P47095 YLR235CYLR235C 399 nt10.08□□□□□ -0.8
MDE1P47095 CRR1YLR213C 1269 nt10.06□□□□□ -0.8
MDE1P47095 YFL067WYFL067W 528 nt10.05□□□□□ -0.8
MDE1P47095 LYS4YDR234W 2082 nt10.05□□□□□ -0.8
MDE1P47095 FTR1YER145C 1215 nt10.03□□□□□ -0.8
MDE1P47095 PTH1YHR189W 573 nt10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms