Protein–RNA interactions for Protein: P47072

YJL016W, Uncharacterized protein YJL016W, yeastyeast

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL016WP47072 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.83□□□□□ -0.68
YJL016WP47072 YOL037CYOL037C 354 nt10.82□□□□□ -0.68
YJL016WP47072 PTP1YDL230W 1008 nt10.8□□□□□ -0.68
YJL016WP47072 UME6YDR207C 2511 nt10.79□□□□□ -0.68
YJL016WP47072 EMI2YDR516C 1503 nt10.75□□□□□ -0.69
YJL016WP47072 YOR139CYOR139C 393 nt10.75□□□□□ -0.69
YJL016WP47072 YMR090WYMR090W 684 nt10.74□□□□□ -0.69
YJL016WP47072 YBR220CYBR220C 1683 nt10.73□□□□□ -0.69
YJL016WP47072 NPL3YDR432W 1245 nt10.72□□□□□ -0.69
YJL016WP47072 CAC2YML102W 1407 nt10.69□□□□□ -0.7
YJL016WP47072 YDL221WYDL221W 552 nt10.69□□□□□ -0.7
YJL016WP47072 YCH1YGR203W 447 nt10.65□□□□□ -0.7
YJL016WP47072 PCH2YBR186W 1695 nt10.63□□□□□ -0.71
YJL016WP47072 GUT2YIL155C 1950 nt10.63□□□□□ -0.71
YJL016WP47072 PET9YBL030C 957 nt10.63□□□□□ -0.71
YJL016WP47072 ART5YGR068C 1761 nt10.61□□□□□ -0.71
YJL016WP47072 GFD2YCL036W 1701 nt10.61□□□□□ -0.71
YJL016WP47072 SDH1YKL148C 1923 nt10.58□□□□□ -0.72
YJL016WP47072 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.57□□□□□ -0.72
YJL016WP47072 IRC15YPL017C 1500 nt10.57□□□□□ -0.72
YJL016WP47072 TIR4YOR009W 1464 nt10.56□□□□□ -0.72
YJL016WP47072 YLR281CYLR281C 468 nt10.53□□□□□ -0.72
YJL016WP47072 PIB2YGL023C 1908 nt10.49□□□□□ -0.73
YJL016WP47072 SEC11YIR022W 504 nt10.49□□□□□ -0.73
YJL016WP47072 WHI5YOR083W 888 nt10.49□□□□□ -0.73
YJL016WP47072 SCC4YER147C 1875 nt10.49□□□□□ -0.73
YJL016WP47072 GIS3YLR094C 1509 nt10.48□□□□□ -0.73
YJL016WP47072 YJL152WYJL152W 360 nt10.43□□□□□ -0.74
YJL016WP47072 YMR057CYMR057C 372 nt10.43□□□□□ -0.74
YJL016WP47072 CUE1YMR264W 612 nt10.43□□□□□ -0.74
YJL016WP47072 RTS2YOR077W 699 nt10.42□□□□□ -0.74
YJL016WP47072 IMP2'YIL154C 1041 nt10.38□□□□□ -0.75
YJL016WP47072 BOR1YNL275W 1731 nt10.36□□□□□ -0.75
YJL016WP47072 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.36□□□□□ -0.75
YJL016WP47072 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.36□□□□□ -0.75
YJL016WP47072 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.36□□□□□ -0.75
YJL016WP47072 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.36□□□□□ -0.75
YJL016WP47072 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.36□□□□□ -0.75
YJL016WP47072 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.34□□□□□ -0.75
YJL016WP47072 PUS2YGL063W 1113 nt10.33□□□□□ -0.76
YJL016WP47072 YLR236CYLR236C 324 nt10.3□□□□□ -0.76
YJL016WP47072 IDH1YNL037C 1083 nt10.3□□□□□ -0.76
YJL016WP47072 YIL100WYIL100W 354 nt10.29□□□□□ -0.76
YJL016WP47072 DSK2YMR276W 1122 nt10.29□□□□□ -0.76
YJL016WP47072 MCH5YOR306C 1566 nt10.26□□□□□ -0.77
YJL016WP47072 RTF1YGL244W 1677 nt10.24□□□□□ -0.77
YJL016WP47072 Q0182Q0182 405 nt10.23□□□□□ -0.77
YJL016WP47072 YSC84YHR016C 1407 nt10.21□□□□□ -0.78
YJL016WP47072 YNL195CYNL195C 786 nt10.2□□□□□ -0.78
YJL016WP47072 GBP2YCL011C 1284 nt10.19□□□□□ -0.78
YJL016WP47072 YHL050CYHL050C 2094 nt10.18□□□□□ -0.78
YJL016WP47072 PTK1YKL198C 1989 nt10.14□□□□□ -0.79
YJL016WP47072 RRD1YIL153W 1182 nt10.14□□□□□ -0.79
YJL016WP47072 YPR011CYPR011C 981 nt10.14□□□□□ -0.79
YJL016WP47072 TCD2YKL027W 1344 nt10.13□□□□□ -0.79
YJL016WP47072 FMP52YER004W 696 nt10.12□□□□□ -0.79
YJL016WP47072 ERV46YAL042W 1248 nt10.12□□□□□ -0.79
YJL016WP47072 RRT12YCR045C 1476 nt10.11□□□□□ -0.79
YJL016WP47072 DED1YOR204W 1815 nt10.09□□□□□ -0.79
YJL016WP47072 FMP45YDL222C 930 nt10.08□□□□□ -0.8
YJL016WP47072 YDR433WYDR433W 441 nt10.07□□□□□ -0.8
YJL016WP47072 BOP3YNL042W 1191 nt10.05□□□□□ -0.8
YJL016WP47072 ALG12YNR030W 1656 nt10.03□□□□□ -0.8
YJL016WP47072 YKR040CYKR040C 504 nt10.03□□□□□ -0.8
YJL016WP47072 LPX1YOR084W 1164 nt10.01□□□□□ -0.81
YJL016WP47072 SOR2YDL246C 1074 nt9.99□□□□□ -0.81
YJL016WP47072 SOR1YJR159W 1074 nt9.99□□□□□ -0.81
YJL016WP47072 FMT1YBL013W 1206 nt9.98□□□□□ -0.81
YJL016WP47072 MXR2YCL033C 507 nt9.97□□□□□ -0.81
YJL016WP47072 PCM1YEL058W 1674 nt9.94□□□□□ -0.82
YJL016WP47072 NCP1YHR042W 2076 nt9.94□□□□□ -0.82
YJL016WP47072 YCL042WYCL042W 360 nt9.92□□□□□ -0.82
YJL016WP47072 FRD1YEL047C 1413 nt9.9□□□□□ -0.82
YJL016WP47072 MOT3YMR070W 1473 nt9.89□□□□□ -0.83
YJL016WP47072 CWP1YKL096W 720 nt9.88□□□□□ -0.83
YJL016WP47072 SNF6YHL025W 999 nt9.87□□□□□ -0.83
YJL016WP47072 ADH2YMR303C 1047 nt9.87□□□□□ -0.83
YJL016WP47072 HSP60YLR259C 1719 nt9.87□□□□□ -0.83
YJL016WP47072 LCB1YMR296C 1677 nt9.87□□□□□ -0.83
YJL016WP47072 SPT8YLR055C 1809 nt9.85□□□□□ -0.83
YJL016WP47072 SIM1YIL123W 1431 nt9.81□□□□□ -0.84
YJL016WP47072 YIH1YCR059C 777 nt9.8□□□□□ -0.84
YJL016WP47072 YFL054CYFL054C 1941 nt9.8□□□□□ -0.84
YJL016WP47072 BIO4YNR057C 714 nt9.79□□□□□ -0.84
YJL016WP47072 RNQ1YCL028W 1218 nt9.78□□□□□ -0.84
YJL016WP47072 SPP1YPL138C 1062 nt9.72□□□□□ -0.85
YJL016WP47072 YLR235CYLR235C 399 nt9.71□□□□□ -0.86
YJL016WP47072 LYS4YDR234W 2082 nt9.7□□□□□ -0.86
YJL016WP47072 ERF2YLR246W 1080 nt9.7□□□□□ -0.86
YJL016WP47072 DIC1YLR348C 897 nt9.69□□□□□ -0.86
YJL016WP47072 NAR1YNL240C 1476 nt9.68□□□□□ -0.86
YJL016WP47072 YLL053CYLL053C 459 nt9.67□□□□□ -0.86
YJL016WP47072 HSL7YBR133C 2484 nt9.66□□□□□ -0.86
YJL016WP47072 CRR1YLR213C 1269 nt9.66□□□□□ -0.86
YJL016WP47072 FTR1YER145C 1215 nt9.63□□□□□ -0.87
YJL016WP47072 AQY1YPR192W 918 nt9.63□□□□□ -0.87
YJL016WP47072 GLK1YCL040W 1503 nt9.62□□□□□ -0.87
YJL016WP47072 PTH1YHR189W 573 nt9.61□□□□□ -0.87
YJL016WP47072 YFL067WYFL067W 528 nt9.6□□□□□ -0.87
YJL016WP47072 YKL030WYKL030W 606 nt9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.2 ms