Protein–RNA interactions for Protein: P43535

GCN20, Protein GCN20, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN20P43535 Q0182Q0182 405 nt11.77□□□□□ -0.53
GCN20P43535 UME6YDR207C 2511 nt11.76□□□□□ -0.53
GCN20P43535 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.75□□□□□ -0.53
GCN20P43535 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.75□□□□□ -0.53
GCN20P43535 YHL050CYHL050C 2094 nt11.74□□□□□ -0.53
GCN20P43535 BOR1YNL275W 1731 nt11.73□□□□□ -0.53
GCN20P43535 ALF1YNL148C 765 nt11.72□□□□□ -0.53
GCN20P43535 FUN26YAL022C 1554 nt11.71□□□□□ -0.53
GCN20P43535 YGR021WYGR021W 873 nt11.7□□□□□ -0.54
GCN20P43535 BOP3YNL042W 1191 nt11.7□□□□□ -0.54
GCN20P43535 YKL097CYKL097C 411 nt11.68□□□□□ -0.54
GCN20P43535 LSM3YLR438C-A 270 nt11.68□□□□□ -0.54
GCN20P43535 PTK1YKL198C 1989 nt11.67□□□□□ -0.54
GCN20P43535 TRM9YML014W 840 nt11.66□□□□□ -0.54
GCN20P43535 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.64□□□□□ -0.55
GCN20P43535 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.63□□□□□ -0.55
GCN20P43535 HOM6YJR139C 1080 nt11.63□□□□□ -0.55
GCN20P43535 RRT12YCR045C 1476 nt11.59□□□□□ -0.55
GCN20P43535 CCT6YDR188W 1641 nt11.57□□□□□ -0.56
GCN20P43535 SIS1YNL007C 1059 nt11.55□□□□□ -0.56
GCN20P43535 RTS2YOR077W 699 nt11.53□□□□□ -0.56
GCN20P43535 GFD2YCL036W 1701 nt11.52□□□□□ -0.57
GCN20P43535 MNP1YGL068W 585 nt11.51□□□□□ -0.57
GCN20P43535 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.5□□□□□ -0.57
GCN20P43535 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.5□□□□□ -0.57
GCN20P43535 ART5YGR068C 1761 nt11.46□□□□□ -0.57
GCN20P43535 RKM5YLR137W 1104 nt11.46□□□□□ -0.57
GCN20P43535 YNL195CYNL195C 786 nt11.46□□□□□ -0.57
GCN20P43535 YFL054CYFL054C 1941 nt11.42□□□□□ -0.58
GCN20P43535 MCH5YOR306C 1566 nt11.41□□□□□ -0.58
GCN20P43535 CUE1YMR264W 612 nt11.4□□□□□ -0.58
GCN20P43535 SPT8YLR055C 1809 nt11.38□□□□□ -0.59
GCN20P43535 NCP1YHR042W 2076 nt11.35□□□□□ -0.59
GCN20P43535 PET9YBL030C 957 nt11.32□□□□□ -0.6
GCN20P43535 YOL037CYOL037C 354 nt11.3□□□□□ -0.6
GCN20P43535 ALG12YNR030W 1656 nt11.28□□□□□ -0.6
GCN20P43535 YIL100WYIL100W 354 nt11.28□□□□□ -0.6
GCN20P43535 HSP60YLR259C 1719 nt11.27□□□□□ -0.61
GCN20P43535 YOR139CYOR139C 393 nt11.23□□□□□ -0.61
GCN20P43535 NPL3YDR432W 1245 nt11.2□□□□□ -0.62
GCN20P43535 YCH1YGR203W 447 nt11.19□□□□□ -0.62
GCN20P43535 TIR4YOR009W 1464 nt11.17□□□□□ -0.62
GCN20P43535 SWE1YJL187C 2460 nt11.11□□□□□ -0.63
GCN20P43535 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.11□□□□□ -0.63
GCN20P43535 YLR236CYLR236C 324 nt11.08□□□□□ -0.64
GCN20P43535 GLK1YCL040W 1503 nt11.07□□□□□ -0.64
GCN20P43535 YMR057CYMR057C 372 nt11.06□□□□□ -0.64
GCN20P43535 YJL152WYJL152W 360 nt11.04□□□□□ -0.64
GCN20P43535 LCB1YMR296C 1677 nt11.02□□□□□ -0.64
GCN20P43535 YLR281CYLR281C 468 nt11.02□□□□□ -0.65
GCN20P43535 WHI5YOR083W 888 nt11.01□□□□□ -0.65
GCN20P43535 NAR1YNL240C 1476 nt10.97□□□□□ -0.65
GCN20P43535 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.92□□□□□ -0.66
GCN20P43535 DSK2YMR276W 1122 nt10.91□□□□□ -0.66
GCN20P43535 FUR4YBR021W 1902 nt10.86□□□□□ -0.67
GCN20P43535 AAC1YMR056C 930 nt10.84□□□□□ -0.67
GCN20P43535 IMP2'YIL154C 1041 nt10.83□□□□□ -0.68
GCN20P43535 PUS2YGL063W 1113 nt10.82□□□□□ -0.68
GCN20P43535 IDH1YNL037C 1083 nt10.82□□□□□ -0.68
GCN20P43535 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.81□□□□□ -0.68
GCN20P43535 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.81□□□□□ -0.68
GCN20P43535 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.81□□□□□ -0.68
GCN20P43535 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.81□□□□□ -0.68
GCN20P43535 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.81□□□□□ -0.68
GCN20P43535 PRP4YPR178W 1398 nt10.79□□□□□ -0.68
GCN20P43535 LYS4YDR234W 2082 nt10.79□□□□□ -0.68
GCN20P43535 BIO4YNR057C 714 nt10.76□□□□□ -0.69
GCN20P43535 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.75□□□□□ -0.69
GCN20P43535 YEL076CYEL076C 651 nt10.75□□□□□ -0.69
GCN20P43535 YLR464WYLR464W 651 nt10.75□□□□□ -0.69
GCN20P43535 GBP2YCL011C 1284 nt10.74□□□□□ -0.69
GCN20P43535 DPS1YLL018C 1674 nt10.73□□□□□ -0.69
GCN20P43535 MOT3YMR070W 1473 nt10.7□□□□□ -0.7
GCN20P43535 BIO5YNR056C 1686 nt10.69□□□□□ -0.7
GCN20P43535 RRD1YIL153W 1182 nt10.69□□□□□ -0.7
GCN20P43535 SIM1YIL123W 1431 nt10.68□□□□□ -0.7
GCN20P43535 CMP2YML057W 1815 nt10.68□□□□□ -0.7
GCN20P43535 CYT2YKL087C 675 nt10.67□□□□□ -0.7
GCN20P43535 TCD2YKL027W 1344 nt10.66□□□□□ -0.7
GCN20P43535 PBP1YGR178C 2169 nt10.66□□□□□ -0.7
GCN20P43535 RPM1RPM1 483 nt10.65□□□□□ -0.7
GCN20P43535 YPR011CYPR011C 981 nt10.65□□□□□ -0.7
GCN20P43535 FMP52YER004W 696 nt10.63□□□□□ -0.71
GCN20P43535 BMT6YLR063W 1098 nt10.63□□□□□ -0.71
GCN20P43535 DED1YOR204W 1815 nt10.63□□□□□ -0.71
GCN20P43535 YDR433WYDR433W 441 nt10.6□□□□□ -0.71
GCN20P43535 SNF1YDR477W 1902 nt10.6□□□□□ -0.71
GCN20P43535 FMP45YDL222C 930 nt10.59□□□□□ -0.71
GCN20P43535 ERV46YAL042W 1248 nt10.59□□□□□ -0.71
GCN20P43535 CCA1YER168C 1641 nt10.55□□□□□ -0.72
GCN20P43535 LPX1YOR084W 1164 nt10.54□□□□□ -0.72
GCN20P43535 HSL7YBR133C 2484 nt10.53□□□□□ -0.72
GCN20P43535 YKR005CYKR005C 1578 nt10.53□□□□□ -0.72
GCN20P43535 FMT1YBL013W 1206 nt10.53□□□□□ -0.72
GCN20P43535 MXR2YCL033C 507 nt10.53□□□□□ -0.72
GCN20P43535 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.52□□□□□ -0.73
GCN20P43535 YKR040CYKR040C 504 nt10.51□□□□□ -0.73
GCN20P43535 PCM1YEL058W 1674 nt10.5□□□□□ -0.73
GCN20P43535 SOR2YDL246C 1074 nt10.49□□□□□ -0.73
GCN20P43535 SOR1YJR159W 1074 nt10.49□□□□□ -0.73
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