Protein–RNA interactions for Protein: P41808

SMK1, Sporulation-specific mitogen-activated protein kinase SMK1, yeastyeast

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMK1P41808 EMI2YDR516C 1503 nt11.27□□□□□ -0.61
SMK1P41808 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.23□□□□□ -0.61
SMK1P41808 ART5YGR068C 1761 nt11.23□□□□□ -0.61
SMK1P41808 YLR281CYLR281C 468 nt11.22□□□□□ -0.61
SMK1P41808 YMR090WYMR090W 684 nt11.21□□□□□ -0.61
SMK1P41808 WHI5YOR083W 888 nt11.21□□□□□ -0.61
SMK1P41808 TIR4YOR009W 1464 nt11.19□□□□□ -0.62
SMK1P41808 GFD2YCL036W 1701 nt11.18□□□□□ -0.62
SMK1P41808 YDL221WYDL221W 552 nt11.18□□□□□ -0.62
SMK1P41808 PET9YBL030C 957 nt11.18□□□□□ -0.62
SMK1P41808 YJL152WYJL152W 360 nt11.16□□□□□ -0.62
SMK1P41808 YCH1YGR203W 447 nt11.15□□□□□ -0.62
SMK1P41808 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.13□□□□□ -0.63
SMK1P41808 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.13□□□□□ -0.63
SMK1P41808 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.13□□□□□ -0.63
SMK1P41808 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.13□□□□□ -0.63
SMK1P41808 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.13□□□□□ -0.63
SMK1P41808 PUS2YGL063W 1113 nt11.11□□□□□ -0.63
SMK1P41808 IRC15YPL017C 1500 nt11.1□□□□□ -0.63
SMK1P41808 YMR057CYMR057C 372 nt11.08□□□□□ -0.64
SMK1P41808 RTS2YOR077W 699 nt11.07□□□□□ -0.64
SMK1P41808 YBR220CYBR220C 1683 nt11.07□□□□□ -0.64
SMK1P41808 SDH1YKL148C 1923 nt11.06□□□□□ -0.64
SMK1P41808 GIS3YLR094C 1509 nt11.03□□□□□ -0.64
SMK1P41808 SCC4YER147C 1875 nt11□□□□□ -0.65
SMK1P41808 IMP2'YIL154C 1041 nt10.97□□□□□ -0.65
SMK1P41808 DSK2YMR276W 1122 nt10.97□□□□□ -0.65
SMK1P41808 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.97□□□□□ -0.65
SMK1P41808 CUE1YMR264W 612 nt10.96□□□□□ -0.65
SMK1P41808 IDH1YNL037C 1083 nt10.95□□□□□ -0.66
SMK1P41808 BDF1YLR399C 2061 nt10.95□□□□□ -0.66
SMK1P41808 FPS1YLL043W 2010 nt10.94□□□□□ -0.66
SMK1P41808 YLR236CYLR236C 324 nt10.92□□□□□ -0.66
SMK1P41808 YPR011CYPR011C 981 nt10.9□□□□□ -0.66
SMK1P41808 GBP2YCL011C 1284 nt10.87□□□□□ -0.67
SMK1P41808 YIL100WYIL100W 354 nt10.84□□□□□ -0.67
SMK1P41808 FMP45YDL222C 930 nt10.82□□□□□ -0.68
SMK1P41808 TAT1YBR069C 1860 nt10.81□□□□□ -0.68
SMK1P41808 YDR433WYDR433W 441 nt10.79□□□□□ -0.68
SMK1P41808 TCD2YKL027W 1344 nt10.76□□□□□ -0.69
SMK1P41808 RRD1YIL153W 1182 nt10.74□□□□□ -0.69
SMK1P41808 ERV46YAL042W 1248 nt10.74□□□□□ -0.69
SMK1P41808 LPX1YOR084W 1164 nt10.74□□□□□ -0.69
SMK1P41808 YNL195CYNL195C 786 nt10.72□□□□□ -0.69
SMK1P41808 YSC84YHR016C 1407 nt10.72□□□□□ -0.69
SMK1P41808 NVJ2YPR091C 2313 nt10.72□□□□□ -0.69
SMK1P41808 PAC11YDR488C 1602 nt10.71□□□□□ -0.69
SMK1P41808 MXR2YCL033C 507 nt10.71□□□□□ -0.69
SMK1P41808 DED1YOR204W 1815 nt10.7□□□□□ -0.7
SMK1P41808 RRT12YCR045C 1476 nt10.68□□□□□ -0.7
SMK1P41808 SEC11YIR022W 504 nt10.68□□□□□ -0.7
SMK1P41808 YKR040CYKR040C 504 nt10.68□□□□□ -0.7
SMK1P41808 YHL050CYHL050C 2094 nt10.66□□□□□ -0.7
SMK1P41808 PCH2YBR186W 1695 nt10.62□□□□□ -0.71
SMK1P41808 FMP52YER004W 696 nt10.61□□□□□ -0.71
SMK1P41808 FMT1YBL013W 1206 nt10.61□□□□□ -0.71
SMK1P41808 GUT2YIL155C 1950 nt10.56□□□□□ -0.72
SMK1P41808 YCL042WYCL042W 360 nt10.54□□□□□ -0.72
SMK1P41808 FRD1YEL047C 1413 nt10.53□□□□□ -0.72
SMK1P41808 SOR2YDL246C 1074 nt10.53□□□□□ -0.72
SMK1P41808 SOR1YJR159W 1074 nt10.53□□□□□ -0.72
SMK1P41808 CWP1YKL096W 720 nt10.52□□□□□ -0.73
SMK1P41808 PCM1YEL058W 1674 nt10.5□□□□□ -0.73
SMK1P41808 ADH2YMR303C 1047 nt10.5□□□□□ -0.73
SMK1P41808 SPP1YPL138C 1062 nt10.5□□□□□ -0.73
SMK1P41808 SNF6YHL025W 999 nt10.45□□□□□ -0.74
SMK1P41808 PIB2YGL023C 1908 nt10.39□□□□□ -0.75
SMK1P41808 RTF1YGL244W 1677 nt10.39□□□□□ -0.75
SMK1P41808 LCB1YMR296C 1677 nt10.38□□□□□ -0.75
SMK1P41808 BOP3YNL042W 1191 nt10.38□□□□□ -0.75
SMK1P41808 SIM1YIL123W 1431 nt10.37□□□□□ -0.75
SMK1P41808 NCP1YHR042W 2076 nt10.36□□□□□ -0.75
SMK1P41808 PTH1YHR189W 573 nt10.34□□□□□ -0.75
SMK1P41808 YIH1YCR059C 777 nt10.33□□□□□ -0.76
SMK1P41808 BIO4YNR057C 714 nt10.33□□□□□ -0.76
SMK1P41808 RNQ1YCL028W 1218 nt10.32□□□□□ -0.76
SMK1P41808 YLR235CYLR235C 399 nt10.3□□□□□ -0.76
SMK1P41808 DIC1YLR348C 897 nt10.3□□□□□ -0.76
SMK1P41808 RPM1RPM1 483 nt10.26□□□□□ -0.77
SMK1P41808 RTG1YOL067C 534 nt10.26□□□□□ -0.77
SMK1P41808 YLL053CYLL053C 459 nt10.25□□□□□ -0.77
SMK1P41808 YKL030WYKL030W 606 nt10.23□□□□□ -0.77
SMK1P41808 PTK1YKL198C 1989 nt10.23□□□□□ -0.77
SMK1P41808 MRPL8YJL063C 717 nt10.2□□□□□ -0.78
SMK1P41808 TIM23YNR017W 669 nt10.2□□□□□ -0.78
SMK1P41808 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.18□□□□□ -0.78
SMK1P41808 YEL076CYEL076C 651 nt10.18□□□□□ -0.78
SMK1P41808 ERF2YLR246W 1080 nt10.18□□□□□ -0.78
SMK1P41808 YLR464WYLR464W 651 nt10.18□□□□□ -0.78
SMK1P41808 FTR1YER145C 1215 nt10.17□□□□□ -0.78
SMK1P41808 LYS4YDR234W 2082 nt10.16□□□□□ -0.78
SMK1P41808 YLR179CYLR179C 606 nt10.15□□□□□ -0.78
SMK1P41808 GAL1YBR020W 1587 nt10.14□□□□□ -0.79
SMK1P41808 ADO1YJR105W 1023 nt10.13□□□□□ -0.79
SMK1P41808 CRR1YLR213C 1269 nt10.13□□□□□ -0.79
SMK1P41808 TRM5YHR070W 1500 nt10.12□□□□□ -0.79
SMK1P41808 ATF2YGR177C 1608 nt10.12□□□□□ -0.79
SMK1P41808 FRE6YLL051C 2139 nt10.12□□□□□ -0.79
SMK1P41808 YFL067WYFL067W 528 nt10.1□□□□□ -0.79
SMK1P41808 HUA1YGR268C 597 nt10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.9 ms