Protein–RNA interactions for Protein: P40344

ATG3, Autophagy-related protein 3, yeastyeast

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG3P40344 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.45□□□□□ -0.26
ATG3P40344 YKL097CYKL097C 411 nt13.45□□□□□ -0.26
ATG3P40344 YMR090WYMR090W 684 nt13.45□□□□□ -0.26
ATG3P40344 TAT1YBR069C 1860 nt13.44□□□□□ -0.26
ATG3P40344 SDH1YKL148C 1923 nt13.39□□□□□ -0.27
ATG3P40344 RKM5YLR137W 1104 nt13.38□□□□□ -0.27
ATG3P40344 IRC15YPL017C 1500 nt13.37□□□□□ -0.27
ATG3P40344 ART5YGR068C 1761 nt13.34□□□□□ -0.27
ATG3P40344 GFD2YCL036W 1701 nt13.33□□□□□ -0.28
ATG3P40344 GIS3YLR094C 1509 nt13.26□□□□□ -0.29
ATG3P40344 SCC4YER147C 1875 nt13.25□□□□□ -0.29
ATG3P40344 RTS2YOR077W 699 nt13.23□□□□□ -0.29
ATG3P40344 TIR4YOR009W 1464 nt13.23□□□□□ -0.29
ATG3P40344 PET9YBL030C 957 nt13.19□□□□□ -0.3
ATG3P40344 NPL3YDR432W 1245 nt13.11□□□□□ -0.31
ATG3P40344 YCH1YGR203W 447 nt13.1□□□□□ -0.31
ATG3P40344 YMR057CYMR057C 372 nt13.07□□□□□ -0.32
ATG3P40344 YOL037CYOL037C 354 nt13.07□□□□□ -0.32
ATG3P40344 CUE1YMR264W 612 nt13.06□□□□□ -0.32
ATG3P40344 YOR139CYOR139C 393 nt13.05□□□□□ -0.32
ATG3P40344 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.01□□□□□ -0.33
ATG3P40344 PCH2YBR186W 1695 nt13□□□□□ -0.33
ATG3P40344 YSC84YHR016C 1407 nt12.99□□□□□ -0.33
ATG3P40344 FPS1YLL043W 2010 nt12.99□□□□□ -0.33
ATG3P40344 SEC11YIR022W 504 nt12.97□□□□□ -0.33
ATG3P40344 YJL152WYJL152W 360 nt12.96□□□□□ -0.33
ATG3P40344 GUT2YIL155C 1950 nt12.96□□□□□ -0.34
ATG3P40344 YHL050CYHL050C 2094 nt12.95□□□□□ -0.34
ATG3P40344 RRT12YCR045C 1476 nt12.9□□□□□ -0.34
ATG3P40344 YIL100WYIL100W 354 nt12.85□□□□□ -0.35
ATG3P40344 WHI5YOR083W 888 nt12.84□□□□□ -0.35
ATG3P40344 YLR281CYLR281C 468 nt12.82□□□□□ -0.36
ATG3P40344 PIB2YGL023C 1908 nt12.82□□□□□ -0.36
ATG3P40344 YLR236CYLR236C 324 nt12.81□□□□□ -0.36
ATG3P40344 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.81□□□□□ -0.36
ATG3P40344 YNL195CYNL195C 786 nt12.76□□□□□ -0.37
ATG3P40344 RTF1YGL244W 1677 nt12.68□□□□□ -0.38
ATG3P40344 NVJ2YPR091C 2313 nt12.65□□□□□ -0.38
ATG3P40344 PAC11YDR488C 1602 nt12.63□□□□□ -0.39
ATG3P40344 RRD1YIL153W 1182 nt12.62□□□□□ -0.39
ATG3P40344 IDH1YNL037C 1083 nt12.62□□□□□ -0.39
ATG3P40344 BOP3YNL042W 1191 nt12.59□□□□□ -0.39
ATG3P40344 GBP2YCL011C 1284 nt12.59□□□□□ -0.39
ATG3P40344 PUS2YGL063W 1113 nt12.58□□□□□ -0.4
ATG3P40344 NCP1YHR042W 2076 nt12.58□□□□□ -0.4
ATG3P40344 DED1YOR204W 1815 nt12.56□□□□□ -0.4
ATG3P40344 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.55□□□□□ -0.4
ATG3P40344 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.55□□□□□ -0.4
ATG3P40344 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.55□□□□□ -0.4
ATG3P40344 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.55□□□□□ -0.4
ATG3P40344 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.55□□□□□ -0.4
ATG3P40344 PTK1YKL198C 1989 nt12.54□□□□□ -0.4
ATG3P40344 DSK2YMR276W 1122 nt12.53□□□□□ -0.4
ATG3P40344 YPR011CYPR011C 981 nt12.52□□□□□ -0.41
ATG3P40344 LCB1YMR296C 1677 nt12.49□□□□□ -0.41
ATG3P40344 CSM2YIL132C 642 nt12.49□□□□□ -0.41
ATG3P40344 TCD2YKL027W 1344 nt12.48□□□□□ -0.41
ATG3P40344 IMP2'YIL154C 1041 nt12.48□□□□□ -0.41
ATG3P40344 FMT1YBL013W 1206 nt12.48□□□□□ -0.41
ATG3P40344 FMP52YER004W 696 nt12.44□□□□□ -0.42
ATG3P40344 MXR2YCL033C 507 nt12.43□□□□□ -0.42
ATG3P40344 FMP45YDL222C 930 nt12.41□□□□□ -0.42
ATG3P40344 YDR433WYDR433W 441 nt12.41□□□□□ -0.42
ATG3P40344 PCM1YEL058W 1674 nt12.4□□□□□ -0.42
ATG3P40344 ADH2YMR303C 1047 nt12.35□□□□□ -0.43
ATG3P40344 LPX1YOR084W 1164 nt12.35□□□□□ -0.43
ATG3P40344 ERV46YAL042W 1248 nt12.34□□□□□ -0.43
ATG3P40344 CWP1YKL096W 720 nt12.33□□□□□ -0.44
ATG3P40344 SIM1YIL123W 1431 nt12.3□□□□□ -0.44
ATG3P40344 SOR2YDL246C 1074 nt12.3□□□□□ -0.44
ATG3P40344 SOR1YJR159W 1074 nt12.3□□□□□ -0.44
ATG3P40344 SNF6YHL025W 999 nt12.26□□□□□ -0.45
ATG3P40344 BIO4YNR057C 714 nt12.26□□□□□ -0.45
ATG3P40344 YFL054CYFL054C 1941 nt12.25□□□□□ -0.45
ATG3P40344 YKR040CYKR040C 504 nt12.24□□□□□ -0.45
ATG3P40344 LYS4YDR234W 2082 nt12.23□□□□□ -0.45
ATG3P40344 FRD1YEL047C 1413 nt12.23□□□□□ -0.45
ATG3P40344 YCL042WYCL042W 360 nt12.21□□□□□ -0.45
ATG3P40344 SPT8YLR055C 1809 nt12.18□□□□□ -0.46
ATG3P40344 YIH1YCR059C 777 nt12.13□□□□□ -0.47
ATG3P40344 PAU21YOR394W 495 nt12.1□□□□□ -0.47
ATG3P40344 PAU22YPL282C 495 nt12.1□□□□□ -0.47
ATG3P40344 YLL053CYLL053C 459 nt12.07□□□□□ -0.48
ATG3P40344 RNQ1YCL028W 1218 nt12.07□□□□□ -0.48
ATG3P40344 CRR1YLR213C 1269 nt12.06□□□□□ -0.48
ATG3P40344 ERF2YLR246W 1080 nt12.04□□□□□ -0.48
ATG3P40344 DIC1YLR348C 897 nt12.01□□□□□ -0.49
ATG3P40344 SPP1YPL138C 1062 nt12.01□□□□□ -0.49
ATG3P40344 ARO7YPR060C 771 nt12.01□□□□□ -0.49
ATG3P40344 SWE1YJL187C 2460 nt12□□□□□ -0.49
ATG3P40344 ATF2YGR177C 1608 nt11.99□□□□□ -0.49
ATG3P40344 MIC10YCL057C-A 294 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG3P40344 FTR1YER145C 1215 nt11.95□□□□□ -0.5
ATG3P40344 PTH1YHR189W 573 nt11.93□□□□□ -0.5
ATG3P40344 GAL1YBR020W 1587 nt11.92□□□□□ -0.5
ATG3P40344 TRM5YHR070W 1500 nt11.91□□□□□ -0.5
ATG3P40344 HEM12YDR047W 1089 nt11.91□□□□□ -0.5
ATG3P40344 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.91□□□□□ -0.5
ATG3P40344 SNG1YGR197C 1644 nt11.9□□□□□ -0.5
ATG3P40344 YFL067WYFL067W 528 nt11.87□□□□□ -0.51
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