Protein–RNA interactions for Protein: P40018

SMB1, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMB1P40018 SHU1YHL006C 453 nt10.81□□□□□ -0.68
SMB1P40018 HOM6YJR139C 1080 nt10.81□□□□□ -0.68
SMB1P40018 ART5YGR068C 1761 nt10.8□□□□□ -0.68
SMB1P40018 GIS3YLR094C 1509 nt10.78□□□□□ -0.68
SMB1P40018 GFD2YCL036W 1701 nt10.78□□□□□ -0.68
SMB1P40018 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.77□□□□□ -0.69
SMB1P40018 SEC11YIR022W 504 nt10.76□□□□□ -0.69
SMB1P40018 PET9YBL030C 957 nt10.74□□□□□ -0.69
SMB1P40018 RTS2YOR077W 699 nt10.72□□□□□ -0.69
SMB1P40018 PCH2YBR186W 1695 nt10.72□□□□□ -0.69
SMB1P40018 YCH1YGR203W 447 nt10.7□□□□□ -0.7
SMB1P40018 MNP1YGL068W 585 nt10.69□□□□□ -0.7
SMB1P40018 RKM5YLR137W 1104 nt10.67□□□□□ -0.7
SMB1P40018 FPS1YLL043W 2010 nt10.66□□□□□ -0.7
SMB1P40018 GUT2YIL155C 1950 nt10.65□□□□□ -0.71
SMB1P40018 CUE1YMR264W 612 nt10.63□□□□□ -0.71
SMB1P40018 YSC84YHR016C 1407 nt10.63□□□□□ -0.71
SMB1P40018 TIR4YOR009W 1464 nt10.61□□□□□ -0.71
SMB1P40018 YKL097CYKL097C 411 nt10.6□□□□□ -0.71
SMB1P40018 YNL195CYNL195C 786 nt10.59□□□□□ -0.71
SMB1P40018 YIL100WYIL100W 354 nt10.57□□□□□ -0.72
SMB1P40018 YMR057CYMR057C 372 nt10.57□□□□□ -0.72
SMB1P40018 YHL050CYHL050C 2094 nt10.53□□□□□ -0.72
SMB1P40018 YJL152WYJL152W 360 nt10.51□□□□□ -0.73
SMB1P40018 YLR236CYLR236C 324 nt10.5□□□□□ -0.73
SMB1P40018 RRT12YCR045C 1476 nt10.49□□□□□ -0.73
SMB1P40018 Q0182Q0182 405 nt10.48□□□□□ -0.73
SMB1P40018 RTF1YGL244W 1677 nt10.45□□□□□ -0.74
SMB1P40018 NPL3YDR432W 1245 nt10.45□□□□□ -0.74
SMB1P40018 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.45□□□□□ -0.74
SMB1P40018 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.45□□□□□ -0.74
SMB1P40018 YOL037CYOL037C 354 nt10.42□□□□□ -0.74
SMB1P40018 BOP3YNL042W 1191 nt10.41□□□□□ -0.74
SMB1P40018 PIB2YGL023C 1908 nt10.4□□□□□ -0.74
SMB1P40018 YJL225CYJL225C 5277 nt10.29□□□□□ -0.76
SMB1P40018 PTK1YKL198C 1989 nt10.23□□□□□ -0.77
SMB1P40018 WHI5YOR083W 888 nt10.2□□□□□ -0.78
SMB1P40018 IDH1YNL037C 1083 nt10.19□□□□□ -0.78
SMB1P40018 NCP1YHR042W 2076 nt10.18□□□□□ -0.78
SMB1P40018 YLR281CYLR281C 468 nt10.15□□□□□ -0.78
SMB1P40018 YOR139CYOR139C 393 nt10.15□□□□□ -0.78
SMB1P40018 GBP2YCL011C 1284 nt10.14□□□□□ -0.79
SMB1P40018 YFL054CYFL054C 1941 nt10.12□□□□□ -0.79
SMB1P40018 FMP52YER004W 696 nt10.11□□□□□ -0.79
SMB1P40018 LCB1YMR296C 1677 nt10.1□□□□□ -0.79
SMB1P40018 TCD2YKL027W 1344 nt10.09□□□□□ -0.79
SMB1P40018 RRD1YIL153W 1182 nt10.08□□□□□ -0.8
SMB1P40018 IMP2'YIL154C 1041 nt10.05□□□□□ -0.8
SMB1P40018 SIM1YIL123W 1431 nt10.04□□□□□ -0.8
SMB1P40018 PCM1YEL058W 1674 nt10.02□□□□□ -0.8
SMB1P40018 SPT8YLR055C 1809 nt10.01□□□□□ -0.81
SMB1P40018 DED1YOR204W 1815 nt9.99□□□□□ -0.81
SMB1P40018 UME6YDR207C 2511 nt9.98□□□□□ -0.81
SMB1P40018 SNF6YHL025W 999 nt9.97□□□□□ -0.81
SMB1P40018 DSK2YMR276W 1122 nt9.97□□□□□ -0.81
SMB1P40018 YDR433WYDR433W 441 nt9.96□□□□□ -0.82
SMB1P40018 PUS2YGL063W 1113 nt9.96□□□□□ -0.82
SMB1P40018 CWP1YKL096W 720 nt9.96□□□□□ -0.82
SMB1P40018 ADH2YMR303C 1047 nt9.92□□□□□ -0.82
SMB1P40018 FMT1YBL013W 1206 nt9.91□□□□□ -0.82
SMB1P40018 YCL042WYCL042W 360 nt9.91□□□□□ -0.82
SMB1P40018 BIO4YNR057C 714 nt9.9□□□□□ -0.82
SMB1P40018 BOR1YNL275W 1731 nt9.88□□□□□ -0.83
SMB1P40018 LYS4YDR234W 2082 nt9.87□□□□□ -0.83
SMB1P40018 MXR2YCL033C 507 nt9.86□□□□□ -0.83
SMB1P40018 FMP45YDL222C 930 nt9.83□□□□□ -0.84
SMB1P40018 SOR2YDL246C 1074 nt9.83□□□□□ -0.84
SMB1P40018 SOR1YJR159W 1074 nt9.83□□□□□ -0.84
SMB1P40018 ERF2YLR246W 1080 nt9.83□□□□□ -0.84
SMB1P40018 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.83□□□□□ -0.84
SMB1P40018 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.83□□□□□ -0.84
SMB1P40018 SWE1YJL187C 2460 nt9.82□□□□□ -0.84
SMB1P40018 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.8□□□□□ -0.84
SMB1P40018 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.8□□□□□ -0.84
SMB1P40018 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.8□□□□□ -0.84
SMB1P40018 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.8□□□□□ -0.84
SMB1P40018 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.8□□□□□ -0.84
SMB1P40018 YIH1YCR059C 777 nt9.77□□□□□ -0.85
SMB1P40018 ERV46YAL042W 1248 nt9.77□□□□□ -0.85
SMB1P40018 YKR040CYKR040C 504 nt9.77□□□□□ -0.85
SMB1P40018 MOT3YMR070W 1473 nt9.77□□□□□ -0.85
SMB1P40018 CRR1YLR213C 1269 nt9.76□□□□□ -0.85
SMB1P40018 YPR011CYPR011C 981 nt9.75□□□□□ -0.85
SMB1P40018 YLL053CYLL053C 459 nt9.74□□□□□ -0.85
SMB1P40018 LPX1YOR084W 1164 nt9.74□□□□□ -0.85
SMB1P40018 RNQ1YCL028W 1218 nt9.74□□□□□ -0.85
SMB1P40018 HEM12YDR047W 1089 nt9.72□□□□□ -0.85
SMB1P40018 FRD1YEL047C 1413 nt9.71□□□□□ -0.86
SMB1P40018 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.7□□□□□ -0.86
SMB1P40018 YFL067WYFL067W 528 nt9.69□□□□□ -0.86
SMB1P40018 HSP60YLR259C 1719 nt9.67□□□□□ -0.86
SMB1P40018 ATF2YGR177C 1608 nt9.66□□□□□ -0.86
SMB1P40018 RAX1YOR301W 1308 nt9.65□□□□□ -0.86
SMB1P40018 DIC1YLR348C 897 nt9.65□□□□□ -0.86
SMB1P40018 DDR2YOL052C-A 186 nt9.65□□□□□ -0.86
SMB1P40018 FTR1YER145C 1215 nt9.64□□□□□ -0.87
SMB1P40018 MIC10YCL057C-A 294 nt9.63□□□□□ -0.87
SMB1P40018 SNG1YGR197C 1644 nt9.63□□□□□ -0.87
SMB1P40018 GLK1YCL040W 1503 nt9.62□□□□□ -0.87
SMB1P40018 GAL1YBR020W 1587 nt9.61□□□□□ -0.87
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