Protein–RNA interactions for Protein: P38915

SPT8, Transcription factor SPT8, yeastyeast

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT8P38915 YBR220CYBR220C 1683 nt13.55□□□□□ -0.24
SPT8P38915 SDH1YKL148C 1923 nt13.47□□□□□ -0.25
SPT8P38915 ART5YGR068C 1761 nt13.45□□□□□ -0.26
SPT8P38915 IRC15YPL017C 1500 nt13.44□□□□□ -0.26
SPT8P38915 GFD2YCL036W 1701 nt13.44□□□□□ -0.26
SPT8P38915 YOL037CYOL037C 354 nt13.4□□□□□ -0.26
SPT8P38915 PET9YBL030C 957 nt13.39□□□□□ -0.27
SPT8P38915 YOR139CYOR139C 393 nt13.38□□□□□ -0.27
SPT8P38915 TIR4YOR009W 1464 nt13.36□□□□□ -0.27
SPT8P38915 GIS3YLR094C 1509 nt13.34□□□□□ -0.27
SPT8P38915 SCC4YER147C 1875 nt13.33□□□□□ -0.27
SPT8P38915 NPL3YDR432W 1245 nt13.33□□□□□ -0.28
SPT8P38915 YCH1YGR203W 447 nt13.33□□□□□ -0.28
SPT8P38915 RTS2YOR077W 699 nt13.26□□□□□ -0.29
SPT8P38915 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.24□□□□□ -0.29
SPT8P38915 PAC11YDR488C 1602 nt13.21□□□□□ -0.29
SPT8P38915 YMR057CYMR057C 372 nt13.2□□□□□ -0.3
SPT8P38915 CUE1YMR264W 612 nt13.19□□□□□ -0.3
SPT8P38915 YLR281CYLR281C 468 nt13.13□□□□□ -0.31
SPT8P38915 FPS1YLL043W 2010 nt13.13□□□□□ -0.31
SPT8P38915 YJL152WYJL152W 360 nt13.12□□□□□ -0.31
SPT8P38915 WHI5YOR083W 888 nt13.11□□□□□ -0.31
SPT8P38915 SEC11YIR022W 504 nt13.08□□□□□ -0.32
SPT8P38915 PCH2YBR186W 1695 nt13.05□□□□□ -0.32
SPT8P38915 YSC84YHR016C 1407 nt13.03□□□□□ -0.32
SPT8P38915 YHL050CYHL050C 2094 nt13□□□□□ -0.33
SPT8P38915 GUT2YIL155C 1950 nt13□□□□□ -0.33
SPT8P38915 YIL100WYIL100W 354 nt12.97□□□□□ -0.33
SPT8P38915 YLR236CYLR236C 324 nt12.97□□□□□ -0.33
SPT8P38915 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.97□□□□□ -0.33
SPT8P38915 RRT12YCR045C 1476 nt12.94□□□□□ -0.34
SPT8P38915 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.89□□□□□ -0.35
SPT8P38915 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.89□□□□□ -0.35
SPT8P38915 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.89□□□□□ -0.35
SPT8P38915 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.89□□□□□ -0.35
SPT8P38915 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.89□□□□□ -0.35
SPT8P38915 PUS2YGL063W 1113 nt12.87□□□□□ -0.35
SPT8P38915 YNL195CYNL195C 786 nt12.87□□□□□ -0.35
SPT8P38915 PIB2YGL023C 1908 nt12.86□□□□□ -0.35
SPT8P38915 IDH1YNL037C 1083 nt12.85□□□□□ -0.35
SPT8P38915 IMP2'YIL154C 1041 nt12.84□□□□□ -0.35
SPT8P38915 RRD1YIL153W 1182 nt12.8□□□□□ -0.36
SPT8P38915 DSK2YMR276W 1122 nt12.8□□□□□ -0.36
SPT8P38915 GBP2YCL011C 1284 nt12.78□□□□□ -0.36
SPT8P38915 NVJ2YPR091C 2313 nt12.78□□□□□ -0.36
SPT8P38915 YPR011CYPR011C 981 nt12.76□□□□□ -0.37
SPT8P38915 DED1YOR204W 1815 nt12.74□□□□□ -0.37
SPT8P38915 RTF1YGL244W 1677 nt12.73□□□□□ -0.37
SPT8P38915 TCD2YKL027W 1344 nt12.69□□□□□ -0.38
SPT8P38915 NCP1YHR042W 2076 nt12.68□□□□□ -0.38
SPT8P38915 FMP52YER004W 696 nt12.67□□□□□ -0.38
SPT8P38915 BOP3YNL042W 1191 nt12.67□□□□□ -0.38
SPT8P38915 FMP45YDL222C 930 nt12.65□□□□□ -0.38
SPT8P38915 FMT1YBL013W 1206 nt12.64□□□□□ -0.39
SPT8P38915 ERV46YAL042W 1248 nt12.62□□□□□ -0.39
SPT8P38915 YDR433WYDR433W 441 nt12.61□□□□□ -0.39
SPT8P38915 PTK1YKL198C 1989 nt12.58□□□□□ -0.4
SPT8P38915 MXR2YCL033C 507 nt12.58□□□□□ -0.4
SPT8P38915 LCB1YMR296C 1677 nt12.57□□□□□ -0.4
SPT8P38915 LPX1YOR084W 1164 nt12.56□□□□□ -0.4
SPT8P38915 PCM1YEL058W 1674 nt12.54□□□□□ -0.4
SPT8P38915 YJL225CYJL225C 5277 nt12.53□□□□□ -0.4
SPT8P38915 SOR2YDL246C 1074 nt12.52□□□□□ -0.41
SPT8P38915 SOR1YJR159W 1074 nt12.52□□□□□ -0.41
SPT8P38915 YKR040CYKR040C 504 nt12.52□□□□□ -0.41
SPT8P38915 ADH2YMR303C 1047 nt12.48□□□□□ -0.41
SPT8P38915 CWP1YKL096W 720 nt12.46□□□□□ -0.41
SPT8P38915 FRD1YEL047C 1413 nt12.45□□□□□ -0.42
SPT8P38915 SNF6YHL025W 999 nt12.41□□□□□ -0.42
SPT8P38915 SIM1YIL123W 1431 nt12.41□□□□□ -0.42
SPT8P38915 YCL042WYCL042W 360 nt12.41□□□□□ -0.42
SPT8P38915 BIO4YNR057C 714 nt12.38□□□□□ -0.43
SPT8P38915 LYS4YDR234W 2082 nt12.34□□□□□ -0.43
SPT8P38915 YIH1YCR059C 777 nt12.33□□□□□ -0.44
SPT8P38915 Q0182Q0182 405 nt12.33□□□□□ -0.44
SPT8P38915 RNQ1YCL028W 1218 nt12.28□□□□□ -0.44
SPT8P38915 YFL054CYFL054C 1941 nt12.27□□□□□ -0.44
SPT8P38915 MOT3YMR070W 1473 nt12.24□□□□□ -0.45
SPT8P38915 YLL053CYLL053C 459 nt12.22□□□□□ -0.45
SPT8P38915 SPP1YPL138C 1062 nt12.22□□□□□ -0.45
SPT8P38915 SPT8YLR055C 1809 nt12.22□□□□□ -0.45
SPT8P38915 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.2□□□□□ -0.46
SPT8P38915 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.2□□□□□ -0.46
SPT8P38915 ERF2YLR246W 1080 nt12.2□□□□□ -0.46
SPT8P38915 CRR1YLR213C 1269 nt12.19□□□□□ -0.46
SPT8P38915 DIC1YLR348C 897 nt12.18□□□□□ -0.46
SPT8P38915 FTR1YER145C 1215 nt12.13□□□□□ -0.47
SPT8P38915 ATF2YGR177C 1608 nt12.11□□□□□ -0.47
SPT8P38915 BOR1YNL275W 1731 nt12.11□□□□□ -0.47
SPT8P38915 PTH1YHR189W 573 nt12.08□□□□□ -0.48
SPT8P38915 GAL1YBR020W 1587 nt12.08□□□□□ -0.48
SPT8P38915 YLR235CYLR235C 399 nt12.07□□□□□ -0.48
SPT8P38915 YFL067WYFL067W 528 nt12.06□□□□□ -0.48
SPT8P38915 TRM5YHR070W 1500 nt12.05□□□□□ -0.48
SPT8P38915 SWE1YJL187C 2460 nt12.04□□□□□ -0.48
SPT8P38915 HEM12YDR047W 1089 nt12.03□□□□□ -0.48
SPT8P38915 MIC10YCL057C-A 294 nt12.03□□□□□ -0.48
SPT8P38915 SNG1YGR197C 1644 nt12.03□□□□□ -0.48
SPT8P38915 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.02□□□□□ -0.49
SPT8P38915 TIM23YNR017W 669 nt12.01□□□□□ -0.49
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