Protein–RNA interactions for Protein: P38864

YHR173C, Uncharacterized protein YHR173C, yeastyeast

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR173CP38864 PAC11YDR488C 1602 nt9.76□□□□□ -0.85
YHR173CP38864 YGR021WYGR021W 873 nt9.76□□□□□ -0.85
YHR173CP38864 GFD2YCL036W 1701 nt9.75□□□□□ -0.85
YHR173CP38864 GUT2YIL155C 1950 nt9.75□□□□□ -0.85
YHR173CP38864 ART5YGR068C 1761 nt9.75□□□□□ -0.85
YHR173CP38864 PET9YBL030C 957 nt9.7□□□□□ -0.86
YHR173CP38864 RTS2YOR077W 699 nt9.69□□□□□ -0.86
YHR173CP38864 YSC84YHR016C 1407 nt9.67□□□□□ -0.86
YHR173CP38864 HOM6YJR139C 1080 nt9.67□□□□□ -0.86
YHR173CP38864 YCH1YGR203W 447 nt9.65□□□□□ -0.86
YHR173CP38864 SHU1YHL006C 453 nt9.62□□□□□ -0.87
YHR173CP38864 CUE1YMR264W 612 nt9.62□□□□□ -0.87
YHR173CP38864 YHL050CYHL050C 2094 nt9.59□□□□□ -0.87
YHR173CP38864 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt9.59□□□□□ -0.87
YHR173CP38864 YNL195CYNL195C 786 nt9.58□□□□□ -0.88
YHR173CP38864 TIR4YOR009W 1464 nt9.57□□□□□ -0.88
YHR173CP38864 MNP1YGL068W 585 nt9.55□□□□□ -0.88
YHR173CP38864 PIB2YGL023C 1908 nt9.54□□□□□ -0.88
YHR173CP38864 RRT12YCR045C 1476 nt9.54□□□□□ -0.88
YHR173CP38864 YIL100WYIL100W 354 nt9.54□□□□□ -0.88
YHR173CP38864 RTF1YGL244W 1677 nt9.54□□□□□ -0.88
YHR173CP38864 RKM5YLR137W 1104 nt9.53□□□□□ -0.88
YHR173CP38864 YMR057CYMR057C 372 nt9.53□□□□□ -0.88
YHR173CP38864 YJL225CYJL225C 5277 nt9.5□□□□□ -0.89
YHR173CP38864 BOP3YNL042W 1191 nt9.49□□□□□ -0.89
YHR173CP38864 YLR236CYLR236C 324 nt9.47□□□□□ -0.89
YHR173CP38864 FPS1YLL043W 2010 nt9.45□□□□□ -0.9
YHR173CP38864 NPL3YDR432W 1245 nt9.4□□□□□ -0.9
YHR173CP38864 YJL152WYJL152W 360 nt9.39□□□□□ -0.91
YHR173CP38864 PTK1YKL198C 1989 nt9.36□□□□□ -0.91
YHR173CP38864 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.36□□□□□ -0.91
YHR173CP38864 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt9.35□□□□□ -0.91
YHR173CP38864 YKL097CYKL097C 411 nt9.34□□□□□ -0.91
YHR173CP38864 NVJ2YPR091C 2313 nt9.33□□□□□ -0.92
YHR173CP38864 NCP1YHR042W 2076 nt9.29□□□□□ -0.92
YHR173CP38864 YOL037CYOL037C 354 nt9.27□□□□□ -0.93
YHR173CP38864 YFL054CYFL054C 1941 nt9.22□□□□□ -0.93
YHR173CP38864 LCB1YMR296C 1677 nt9.17□□□□□ -0.94
YHR173CP38864 SPT8YLR055C 1809 nt9.14□□□□□ -0.95
YHR173CP38864 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.11□□□□□ -0.95
YHR173CP38864 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.11□□□□□ -0.95
YHR173CP38864 FMP52YER004W 696 nt9.1□□□□□ -0.95
YHR173CP38864 WHI5YOR083W 888 nt9.1□□□□□ -0.95
YHR173CP38864 RRD1YIL153W 1182 nt9.09□□□□□ -0.95
YHR173CP38864 IDH1YNL037C 1083 nt9.09□□□□□ -0.95
YHR173CP38864 SIM1YIL123W 1431 nt9.06□□□□□ -0.96
YHR173CP38864 BOR1YNL275W 1731 nt9.06□□□□□ -0.96
YHR173CP38864 GBP2YCL011C 1284 nt9.06□□□□□ -0.96
YHR173CP38864 PCM1YEL058W 1674 nt9.04□□□□□ -0.96
YHR173CP38864 YLR281CYLR281C 468 nt9.04□□□□□ -0.96
YHR173CP38864 TCD2YKL027W 1344 nt9.04□□□□□ -0.96
YHR173CP38864 YOR139CYOR139C 393 nt9□□□□□ -0.97
YHR173CP38864 DED1YOR204W 1815 nt9□□□□□ -0.97
YHR173CP38864 SWE1YJL187C 2460 nt8.97□□□□□ -0.97
YHR173CP38864 LYS4YDR234W 2082 nt8.97□□□□□ -0.97
YHR173CP38864 SNF6YHL025W 999 nt8.96□□□□□ -0.98
YHR173CP38864 IMP2'YIL154C 1041 nt8.96□□□□□ -0.98
YHR173CP38864 FMT1YBL013W 1206 nt8.95□□□□□ -0.98
YHR173CP38864 CWP1YKL096W 720 nt8.94□□□□□ -0.98
YHR173CP38864 BIO4YNR057C 714 nt8.94□□□□□ -0.98
YHR173CP38864 ADH2YMR303C 1047 nt8.93□□□□□ -0.98
YHR173CP38864 ERF2YLR246W 1080 nt8.89□□□□□ -0.99
YHR173CP38864 DSK2YMR276W 1122 nt8.87□□□□□ -0.99
YHR173CP38864 HSP60YLR259C 1719 nt8.86□□□□□ -0.99
YHR173CP38864 YDR433WYDR433W 441 nt8.86□□□□□ -0.99
YHR173CP38864 YCL042WYCL042W 360 nt8.85□□□□□ -0.99
YHR173CP38864 SOR2YDL246C 1074 nt8.84□□□□□ -0.99
YHR173CP38864 PUS2YGL063W 1113 nt8.84□□□□□ -0.99
YHR173CP38864 SOR1YJR159W 1074 nt8.84□□□□□ -0.99
YHR173CP38864 CRR1YLR213C 1269 nt8.83□□□□□ -1
YHR173CP38864 YIH1YCR059C 777 nt8.82□□□□□ -1
YHR173CP38864 MXR2YCL033C 507 nt8.82□□□□□ -1
YHR173CP38864 FMP45YDL222C 930 nt8.8□□□□□ -1
YHR173CP38864 GLK1YCL040W 1503 nt8.8□□□□□ -1
YHR173CP38864 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt8.79□□□□□ -1
YHR173CP38864 YLL053CYLL053C 459 nt8.78□□□□□ -1
YHR173CP38864 RNQ1YCL028W 1218 nt8.78□□□□□ -1
YHR173CP38864 HEM12YDR047W 1089 nt8.77□□□□□ -1.01
YHR173CP38864 RAX1YOR301W 1308 nt8.74□□□□□ -1.01
YHR173CP38864 FUR4YBR021W 1902 nt8.74□□□□□ -1.01
YHR173CP38864 YFL067WYFL067W 528 nt8.73□□□□□ -1.01
YHR173CP38864 ERV46YAL042W 1248 nt8.73□□□□□ -1.01
YHR173CP38864 YKR040CYKR040C 504 nt8.73□□□□□ -1.01
YHR173CP38864 ATF2YGR177C 1608 nt8.72□□□□□ -1.01
YHR173CP38864 YPR011CYPR011C 981 nt8.72□□□□□ -1.01
YHR173CP38864 MIC10YCL057C-A 294 nt8.72□□□□□ -1.01
YHR173CP38864 FRD1YEL047C 1413 nt8.71□□□□□ -1.01
YHR173CP38864 FTR1YER145C 1215 nt8.7□□□□□ -1.02
YHR173CP38864 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt8.7□□□□□ -1.02
YHR173CP38864 IMT4tM(CAU)E 72 nt8.7□□□□□ -1.02
YHR173CP38864 IMT3tM(CAU)J3 72 nt8.7□□□□□ -1.02
YHR173CP38864 IMT1tM(CAU)O1 72 nt8.7□□□□□ -1.02
YHR173CP38864 IMT2tM(CAU)P 72 nt8.7□□□□□ -1.02
YHR173CP38864 UME6YDR207C 2511 nt8.7□□□□□ -1.02
YHR173CP38864 CCA1YER168C 1641 nt8.69□□□□□ -1.02
YHR173CP38864 SNG1YGR197C 1644 nt8.69□□□□□ -1.02
YHR173CP38864 ALG12YNR030W 1656 nt8.69□□□□□ -1.02
YHR173CP38864 LPX1YOR084W 1164 nt8.68□□□□□ -1.02
YHR173CP38864 DDR2YOL052C-A 186 nt8.67□□□□□ -1.02
YHR173CP38864 DIC1YLR348C 897 nt8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms