Protein–RNA interactions for Protein: P38772

BCD1, Box C/D snoRNA protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BCD1P38772 ART5YGR068C 1761 nt13.56□□□□□ -0.24
BCD1P38772 YDL221WYDL221W 552 nt13.56□□□□□ -0.24
BCD1P38772 GFD2YCL036W 1701 nt13.5□□□□□ -0.25
BCD1P38772 YBR220CYBR220C 1683 nt13.47□□□□□ -0.25
BCD1P38772 Q0182Q0182 405 nt13.47□□□□□ -0.25
BCD1P38772 TIR4YOR009W 1464 nt13.47□□□□□ -0.25
BCD1P38772 IRC15YPL017C 1500 nt13.45□□□□□ -0.26
BCD1P38772 SDH1YKL148C 1923 nt13.43□□□□□ -0.26
BCD1P38772 PET9YBL030C 957 nt13.43□□□□□ -0.26
BCD1P38772 YJL152WYJL152W 360 nt13.42□□□□□ -0.26
BCD1P38772 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.42□□□□□ -0.26
BCD1P38772 RTS2YOR077W 699 nt13.42□□□□□ -0.26
BCD1P38772 BDF1YLR399C 2061 nt13.4□□□□□ -0.27
BCD1P38772 YMR057CYMR057C 372 nt13.38□□□□□ -0.27
BCD1P38772 GIS3YLR094C 1509 nt13.37□□□□□ -0.27
BCD1P38772 YCH1YGR203W 447 nt13.36□□□□□ -0.27
BCD1P38772 SCC4YER147C 1875 nt13.35□□□□□ -0.27
BCD1P38772 WHI5YOR083W 888 nt13.33□□□□□ -0.28
BCD1P38772 YLR281CYLR281C 468 nt13.3□□□□□ -0.28
BCD1P38772 CUE1YMR264W 612 nt13.23□□□□□ -0.29
BCD1P38772 TAT1YBR069C 1860 nt13.21□□□□□ -0.3
BCD1P38772 FPS1YLL043W 2010 nt13.17□□□□□ -0.3
BCD1P38772 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.17□□□□□ -0.3
BCD1P38772 PUS2YGL063W 1113 nt13.16□□□□□ -0.3
BCD1P38772 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.12□□□□□ -0.31
BCD1P38772 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.12□□□□□ -0.31
BCD1P38772 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.12□□□□□ -0.31
BCD1P38772 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.12□□□□□ -0.31
BCD1P38772 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.12□□□□□ -0.31
BCD1P38772 YIL100WYIL100W 354 nt13.1□□□□□ -0.31
BCD1P38772 YLR236CYLR236C 324 nt13.08□□□□□ -0.32
BCD1P38772 IDH1YNL037C 1083 nt13.06□□□□□ -0.32
BCD1P38772 YSC84YHR016C 1407 nt13.05□□□□□ -0.32
BCD1P38772 RRT12YCR045C 1476 nt13.02□□□□□ -0.33
BCD1P38772 DSK2YMR276W 1122 nt13.01□□□□□ -0.33
BCD1P38772 GBP2YCL011C 1284 nt13.01□□□□□ -0.33
BCD1P38772 SEC11YIR022W 504 nt12.99□□□□□ -0.33
BCD1P38772 YNL195CYNL195C 786 nt12.99□□□□□ -0.33
BCD1P38772 YPR011CYPR011C 981 nt12.98□□□□□ -0.33
BCD1P38772 PCH2YBR186W 1695 nt12.96□□□□□ -0.33
BCD1P38772 IMP2'YIL154C 1041 nt12.96□□□□□ -0.33
BCD1P38772 YHL050CYHL050C 2094 nt12.96□□□□□ -0.33
BCD1P38772 YDR433WYDR433W 441 nt12.89□□□□□ -0.35
BCD1P38772 RRD1YIL153W 1182 nt12.88□□□□□ -0.35
BCD1P38772 GUT2YIL155C 1950 nt12.88□□□□□ -0.35
BCD1P38772 TCD2YKL027W 1344 nt12.87□□□□□ -0.35
BCD1P38772 FMP45YDL222C 930 nt12.84□□□□□ -0.35
BCD1P38772 MXR2YCL033C 507 nt12.83□□□□□ -0.36
BCD1P38772 DED1YOR204W 1815 nt12.81□□□□□ -0.36
BCD1P38772 LPX1YOR084W 1164 nt12.79□□□□□ -0.36
BCD1P38772 MOT3YMR070W 1473 nt12.76□□□□□ -0.37
BCD1P38772 FMT1YBL013W 1206 nt12.74□□□□□ -0.37
BCD1P38772 ERV46YAL042W 1248 nt12.73□□□□□ -0.37
BCD1P38772 FMP52YER004W 696 nt12.69□□□□□ -0.38
BCD1P38772 YKR040CYKR040C 504 nt12.69□□□□□ -0.38
BCD1P38772 RTF1YGL244W 1677 nt12.67□□□□□ -0.38
BCD1P38772 CWP1YKL096W 720 nt12.66□□□□□ -0.38
BCD1P38772 PIB2YGL023C 1908 nt12.66□□□□□ -0.38
BCD1P38772 PCM1YEL058W 1674 nt12.64□□□□□ -0.39
BCD1P38772 ADH2YMR303C 1047 nt12.64□□□□□ -0.39
BCD1P38772 BOP3YNL042W 1191 nt12.63□□□□□ -0.39
BCD1P38772 YCL042WYCL042W 360 nt12.62□□□□□ -0.39
BCD1P38772 LCB1YMR296C 1677 nt12.57□□□□□ -0.4
BCD1P38772 FRD1YEL047C 1413 nt12.56□□□□□ -0.4
BCD1P38772 SNF6YHL025W 999 nt12.56□□□□□ -0.4
BCD1P38772 SOR2YDL246C 1074 nt12.55□□□□□ -0.4
BCD1P38772 SOR1YJR159W 1074 nt12.55□□□□□ -0.4
BCD1P38772 SIM1YIL123W 1431 nt12.54□□□□□ -0.4
BCD1P38772 NCP1YHR042W 2076 nt12.53□□□□□ -0.4
BCD1P38772 SPP1YPL138C 1062 nt12.5□□□□□ -0.41
BCD1P38772 PTK1YKL198C 1989 nt12.47□□□□□ -0.41
BCD1P38772 BIO4YNR057C 714 nt12.45□□□□□ -0.42
BCD1P38772 YIH1YCR059C 777 nt12.37□□□□□ -0.43
BCD1P38772 PTH1YHR189W 573 nt12.37□□□□□ -0.43
BCD1P38772 RNQ1YCL028W 1218 nt12.35□□□□□ -0.43
BCD1P38772 YLL053CYLL053C 459 nt12.34□□□□□ -0.43
BCD1P38772 DIC1YLR348C 897 nt12.32□□□□□ -0.44
BCD1P38772 YFL054CYFL054C 1941 nt12.31□□□□□ -0.44
BCD1P38772 PAC11YDR488C 1602 nt12.28□□□□□ -0.44
BCD1P38772 LYS4YDR234W 2082 nt12.27□□□□□ -0.45
BCD1P38772 ERF2YLR246W 1080 nt12.25□□□□□ -0.45
BCD1P38772 YLR235CYLR235C 399 nt12.24□□□□□ -0.45
BCD1P38772 FTR1YER145C 1215 nt12.21□□□□□ -0.45
BCD1P38772 ATF2YGR177C 1608 nt12.2□□□□□ -0.46
BCD1P38772 CRR1YLR213C 1269 nt12.2□□□□□ -0.46
BCD1P38772 TRM5YHR070W 1500 nt12.18□□□□□ -0.46
BCD1P38772 GAL1YBR020W 1587 nt12.18□□□□□ -0.46
BCD1P38772 TIM23YNR017W 669 nt12.17□□□□□ -0.46
BCD1P38772 YKL030WYKL030W 606 nt12.14□□□□□ -0.47
BCD1P38772 YLR179CYLR179C 606 nt12.14□□□□□ -0.47
BCD1P38772 SPT8YLR055C 1809 nt12.14□□□□□ -0.47
BCD1P38772 DDR2YOL052C-A 186 nt12.13□□□□□ -0.47
BCD1P38772 MIC10YCL057C-A 294 nt12.13□□□□□ -0.47
BCD1P38772 HEM12YDR047W 1089 nt12.12□□□□□ -0.47
BCD1P38772 YFL067WYFL067W 528 nt12.12□□□□□ -0.47
BCD1P38772 RTG1YOL067C 534 nt12.09□□□□□ -0.47
BCD1P38772 SNG1YGR197C 1644 nt12.08□□□□□ -0.48
BCD1P38772 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.04□□□□□ -0.48
BCD1P38772 AQY1YPR192W 918 nt12.04□□□□□ -0.48
BCD1P38772 STB1YNL309W 1263 nt12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49.8 ms