Protein–RNA interactions for Protein: P38353

SSH1, Sec sixty-one protein homolog, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSH1P38353 YBR220CYBR220C 1683 nt10.89□□□□□ -0.67
SSH1P38353 MNP1YGL068W 585 nt10.88□□□□□ -0.67
SSH1P38353 RKM5YLR137W 1104 nt10.84□□□□□ -0.67
SSH1P38353 TAT1YBR069C 1860 nt10.82□□□□□ -0.68
SSH1P38353 SDH1YKL148C 1923 nt10.82□□□□□ -0.68
SSH1P38353 ART5YGR068C 1761 nt10.76□□□□□ -0.69
SSH1P38353 IRC15YPL017C 1500 nt10.75□□□□□ -0.69
SSH1P38353 GFD2YCL036W 1701 nt10.75□□□□□ -0.69
SSH1P38353 PET9YBL030C 957 nt10.72□□□□□ -0.69
SSH1P38353 SCC4YER147C 1875 nt10.72□□□□□ -0.69
SSH1P38353 GIS3YLR094C 1509 nt10.69□□□□□ -0.7
SSH1P38353 YCH1YGR203W 447 nt10.69□□□□□ -0.7
SSH1P38353 TIR4YOR009W 1464 nt10.65□□□□□ -0.7
SSH1P38353 YOL037CYOL037C 354 nt10.64□□□□□ -0.71
SSH1P38353 RTS2YOR077W 699 nt10.63□□□□□ -0.71
SSH1P38353 NPL3YDR432W 1245 nt10.6□□□□□ -0.71
SSH1P38353 CUE1YMR264W 612 nt10.57□□□□□ -0.72
SSH1P38353 SEC11YIR022W 504 nt10.55□□□□□ -0.72
SSH1P38353 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.55□□□□□ -0.72
SSH1P38353 YMR057CYMR057C 372 nt10.55□□□□□ -0.72
SSH1P38353 YOR139CYOR139C 393 nt10.53□□□□□ -0.72
SSH1P38353 PCH2YBR186W 1695 nt10.51□□□□□ -0.73
SSH1P38353 YJL152WYJL152W 360 nt10.49□□□□□ -0.73
SSH1P38353 YSC84YHR016C 1407 nt10.47□□□□□ -0.73
SSH1P38353 GUT2YIL155C 1950 nt10.46□□□□□ -0.74
SSH1P38353 UME6YDR207C 2511 nt10.44□□□□□ -0.74
SSH1P38353 YIL100WYIL100W 354 nt10.44□□□□□ -0.74
SSH1P38353 YHL050CYHL050C 2094 nt10.42□□□□□ -0.74
SSH1P38353 YLR236CYLR236C 324 nt10.41□□□□□ -0.74
SSH1P38353 YLR281CYLR281C 468 nt10.41□□□□□ -0.74
SSH1P38353 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.41□□□□□ -0.74
SSH1P38353 WHI5YOR083W 888 nt10.4□□□□□ -0.74
SSH1P38353 YNL195CYNL195C 786 nt10.39□□□□□ -0.75
SSH1P38353 RRT12YCR045C 1476 nt10.37□□□□□ -0.75
SSH1P38353 PIB2YGL023C 1908 nt10.29□□□□□ -0.76
SSH1P38353 YJL225CYJL225C 5277 nt10.29□□□□□ -0.76
SSH1P38353 IDH1YNL037C 1083 nt10.27□□□□□ -0.77
SSH1P38353 RTF1YGL244W 1677 nt10.25□□□□□ -0.77
SSH1P38353 IMP2'YIL154C 1041 nt10.22□□□□□ -0.77
SSH1P38353 BOP3YNL042W 1191 nt10.21□□□□□ -0.77
SSH1P38353 PUS2YGL063W 1113 nt10.2□□□□□ -0.78
SSH1P38353 GBP2YCL011C 1284 nt10.2□□□□□ -0.78
SSH1P38353 RRD1YIL153W 1182 nt10.19□□□□□ -0.78
SSH1P38353 DSK2YMR276W 1122 nt10.17□□□□□ -0.78
SSH1P38353 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.16□□□□□ -0.78
SSH1P38353 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.16□□□□□ -0.78
SSH1P38353 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.16□□□□□ -0.78
SSH1P38353 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.16□□□□□ -0.78
SSH1P38353 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.16□□□□□ -0.78
SSH1P38353 TCD2YKL027W 1344 nt10.14□□□□□ -0.79
SSH1P38353 NCP1YHR042W 2076 nt10.13□□□□□ -0.79
SSH1P38353 FMP52YER004W 696 nt10.13□□□□□ -0.79
SSH1P38353 DED1YOR204W 1815 nt10.12□□□□□ -0.79
SSH1P38353 PTK1YKL198C 1989 nt10.1□□□□□ -0.79
SSH1P38353 YPR011CYPR011C 981 nt10.06□□□□□ -0.8
SSH1P38353 YDR433WYDR433W 441 nt10.05□□□□□ -0.8
SSH1P38353 LCB1YMR296C 1677 nt10.05□□□□□ -0.8
SSH1P38353 FMT1YBL013W 1206 nt10.04□□□□□ -0.8
SSH1P38353 PCM1YEL058W 1674 nt10.03□□□□□ -0.8
SSH1P38353 FMP45YDL222C 930 nt10.02□□□□□ -0.81
SSH1P38353 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.01□□□□□ -0.81
SSH1P38353 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.01□□□□□ -0.81
SSH1P38353 ERV46YAL042W 1248 nt10□□□□□ -0.81
SSH1P38353 MXR2YCL033C 507 nt9.99□□□□□ -0.81
SSH1P38353 SOR2YDL246C 1074 nt9.96□□□□□ -0.82
SSH1P38353 SOR1YJR159W 1074 nt9.96□□□□□ -0.82
SSH1P38353 CWP1YKL096W 720 nt9.96□□□□□ -0.82
SSH1P38353 SIM1YIL123W 1431 nt9.96□□□□□ -0.82
SSH1P38353 ADH2YMR303C 1047 nt9.95□□□□□ -0.82
SSH1P38353 LPX1YOR084W 1164 nt9.95□□□□□ -0.82
SSH1P38353 SNF6YHL025W 999 nt9.94□□□□□ -0.82
SSH1P38353 YKR040CYKR040C 504 nt9.94□□□□□ -0.82
SSH1P38353 RPM1RPM1 483 nt9.94□□□□□ -0.82
SSH1P38353 YCL042WYCL042W 360 nt9.92□□□□□ -0.82
SSH1P38353 YFL054CYFL054C 1941 nt9.9□□□□□ -0.83
SSH1P38353 BIO4YNR057C 714 nt9.89□□□□□ -0.83
SSH1P38353 FRD1YEL047C 1413 nt9.87□□□□□ -0.83
SSH1P38353 LYS4YDR234W 2082 nt9.86□□□□□ -0.83
SSH1P38353 SPT8YLR055C 1809 nt9.84□□□□□ -0.83
SSH1P38353 YIH1YCR059C 777 nt9.83□□□□□ -0.84
SSH1P38353 MCH5YOR306C 1566 nt9.82□□□□□ -0.84
SSH1P38353 RNQ1YCL028W 1218 nt9.8□□□□□ -0.84
SSH1P38353 ERF2YLR246W 1080 nt9.79□□□□□ -0.84
SSH1P38353 YLL053CYLL053C 459 nt9.76□□□□□ -0.85
SSH1P38353 CRR1YLR213C 1269 nt9.75□□□□□ -0.85
SSH1P38353 DIC1YLR348C 897 nt9.71□□□□□ -0.86
SSH1P38353 Q0182Q0182 405 nt9.7□□□□□ -0.86
SSH1P38353 BOR1YNL275W 1731 nt9.68□□□□□ -0.86
SSH1P38353 FTR1YER145C 1215 nt9.68□□□□□ -0.86
SSH1P38353 SWE1YJL187C 2460 nt9.67□□□□□ -0.86
SSH1P38353 ATF2YGR177C 1608 nt9.67□□□□□ -0.86
SSH1P38353 YFL067WYFL067W 528 nt9.67□□□□□ -0.86
SSH1P38353 HEM12YDR047W 1089 nt9.66□□□□□ -0.86
SSH1P38353 GAL1YBR020W 1587 nt9.64□□□□□ -0.87
SSH1P38353 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.64□□□□□ -0.87
SSH1P38353 MOT3YMR070W 1473 nt9.64□□□□□ -0.87
SSH1P38353 SPP1YPL138C 1062 nt9.63□□□□□ -0.87
SSH1P38353 TRM5YHR070W 1500 nt9.62□□□□□ -0.87
SSH1P38353 YLR235CYLR235C 399 nt9.62□□□□□ -0.87
SSH1P38353 SNG1YGR197C 1644 nt9.61□□□□□ -0.87
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