Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL3P36405 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL3P36405 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL3P36405 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL3P36405 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL3P36405 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL3P36405 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL3P36405 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL3P36405 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL3P36405 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL3P36405 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL3P36405 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL3P36405 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL3P36405 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARL3P36405 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARL3P36405 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARL3P36405 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARL3P36405 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARL3P36405 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARL3P36405 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARL3P36405 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL3P36405 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL3P36405 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL3P36405 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL3P36405 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL3P36405 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL3P36405 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL3P36405 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL3P36405 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL3P36405 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL3P36405 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL3P36405 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL3P36405 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL3P36405 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL3P36405 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL3P36405 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL3P36405 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL3P36405 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL3P36405 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL3P36405 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL3P36405 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL3P36405 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL3P36405 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL3P36405 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL3P36405 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL3P36405 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL3P36405 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL3P36405 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL3P36405 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL3P36405 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL3P36405 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL3P36405 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL3P36405 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL3P36405 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL3P36405 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL3P36405 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL3P36405 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL3P36405 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL3P36405 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL3P36405 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL3P36405 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL3P36405 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARL3P36405 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL3P36405 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL3P36405 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL3P36405 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL3P36405 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL3P36405 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL3P36405 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL3P36405 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL3P36405 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL3P36405 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARL3P36405 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL3P36405 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL3P36405 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL3P36405 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL3P36405 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL3P36405 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL3P36405 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL3P36405 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL3P36405 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL3P36405 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARL3P36405 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL3P36405 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL3P36405 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL3P36405 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL3P36405 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL3P36405 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL3P36405 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARL3P36405 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARL3P36405 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARL3P36405 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARL3P36405 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARL3P36405 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARL3P36405 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARL3P36405 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARL3P36405 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARL3P36405 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARL3P36405 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARL3P36405 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms