Protein–RNA interactions for Protein: P36138

YKR045C, Uncharacterized protein YKR045C, yeastyeast

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR045CP36138 YDL221WYDL221W 552 nt9.91□□□□□ -0.82
YKR045CP36138 YMR090WYMR090W 684 nt9.9□□□□□ -0.82
YKR045CP36138 GFD2YCL036W 1701 nt9.89□□□□□ -0.83
YKR045CP36138 IRC15YPL017C 1500 nt9.87□□□□□ -0.83
YKR045CP36138 YBR220CYBR220C 1683 nt9.87□□□□□ -0.83
YKR045CP36138 TIR4YOR009W 1464 nt9.87□□□□□ -0.83
YKR045CP36138 BDF1YLR399C 2061 nt9.85□□□□□ -0.83
YKR045CP36138 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt9.84□□□□□ -0.83
YKR045CP36138 PET9YBL030C 957 nt9.84□□□□□ -0.83
YKR045CP36138 SDH1YKL148C 1923 nt9.83□□□□□ -0.84
YKR045CP36138 YLR281CYLR281C 468 nt9.81□□□□□ -0.84
YKR045CP36138 YMR057CYMR057C 372 nt9.8□□□□□ -0.84
YKR045CP36138 RTS2YOR077W 699 nt9.8□□□□□ -0.84
YKR045CP36138 WHI5YOR083W 888 nt9.8□□□□□ -0.84
YKR045CP36138 GIS3YLR094C 1509 nt9.8□□□□□ -0.84
YKR045CP36138 YJL152WYJL152W 360 nt9.79□□□□□ -0.84
YKR045CP36138 YCH1YGR203W 447 nt9.78□□□□□ -0.84
YKR045CP36138 SCC4YER147C 1875 nt9.76□□□□□ -0.85
YKR045CP36138 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.7□□□□□ -0.86
YKR045CP36138 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.7□□□□□ -0.86
YKR045CP36138 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.7□□□□□ -0.86
YKR045CP36138 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.7□□□□□ -0.86
YKR045CP36138 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.7□□□□□ -0.86
YKR045CP36138 TAT1YBR069C 1860 nt9.7□□□□□ -0.86
YKR045CP36138 PUS2YGL063W 1113 nt9.68□□□□□ -0.86
YKR045CP36138 FPS1YLL043W 2010 nt9.68□□□□□ -0.86
YKR045CP36138 CUE1YMR264W 612 nt9.67□□□□□ -0.86
YKR045CP36138 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.61□□□□□ -0.87
YKR045CP36138 YPR011CYPR011C 981 nt9.6□□□□□ -0.87
YKR045CP36138 YLR236CYLR236C 324 nt9.56□□□□□ -0.88
YKR045CP36138 DSK2YMR276W 1122 nt9.55□□□□□ -0.88
YKR045CP36138 IDH1YNL037C 1083 nt9.55□□□□□ -0.88
YKR045CP36138 YIL100WYIL100W 354 nt9.54□□□□□ -0.88
YKR045CP36138 YSC84YHR016C 1407 nt9.54□□□□□ -0.88
YKR045CP36138 RRT12YCR045C 1476 nt9.53□□□□□ -0.88
YKR045CP36138 GBP2YCL011C 1284 nt9.52□□□□□ -0.89
YKR045CP36138 YHL050CYHL050C 2094 nt9.51□□□□□ -0.89
YKR045CP36138 IMP2'YIL154C 1041 nt9.5□□□□□ -0.89
YKR045CP36138 PCH2YBR186W 1695 nt9.48□□□□□ -0.89
YKR045CP36138 RRD1YIL153W 1182 nt9.47□□□□□ -0.89
YKR045CP36138 SEC11YIR022W 504 nt9.46□□□□□ -0.9
YKR045CP36138 DED1YOR204W 1815 nt9.45□□□□□ -0.9
YKR045CP36138 FMP45YDL222C 930 nt9.44□□□□□ -0.9
YKR045CP36138 YDR433WYDR433W 441 nt9.44□□□□□ -0.9
YKR045CP36138 YNL195CYNL195C 786 nt9.44□□□□□ -0.9
YKR045CP36138 GUT2YIL155C 1950 nt9.43□□□□□ -0.9
YKR045CP36138 MXR2YCL033C 507 nt9.43□□□□□ -0.9
YKR045CP36138 TCD2YKL027W 1344 nt9.41□□□□□ -0.9
YKR045CP36138 LPX1YOR084W 1164 nt9.41□□□□□ -0.9
YKR045CP36138 FMT1YBL013W 1206 nt9.38□□□□□ -0.91
YKR045CP36138 ERV46YAL042W 1248 nt9.37□□□□□ -0.91
YKR045CP36138 PIB2YGL023C 1908 nt9.33□□□□□ -0.92
YKR045CP36138 YKR040CYKR040C 504 nt9.33□□□□□ -0.92
YKR045CP36138 FMP52YER004W 696 nt9.29□□□□□ -0.92
YKR045CP36138 PCM1YEL058W 1674 nt9.27□□□□□ -0.93
YKR045CP36138 CWP1YKL096W 720 nt9.27□□□□□ -0.93
YKR045CP36138 ADH2YMR303C 1047 nt9.27□□□□□ -0.93
YKR045CP36138 RTF1YGL244W 1677 nt9.26□□□□□ -0.93
YKR045CP36138 NCP1YHR042W 2076 nt9.25□□□□□ -0.93
YKR045CP36138 FRD1YEL047C 1413 nt9.24□□□□□ -0.93
YKR045CP36138 SPP1YPL138C 1062 nt9.23□□□□□ -0.93
YKR045CP36138 LCB1YMR296C 1677 nt9.23□□□□□ -0.93
YKR045CP36138 MOT3YMR070W 1473 nt9.22□□□□□ -0.93
YKR045CP36138 SOR2YDL246C 1074 nt9.22□□□□□ -0.93
YKR045CP36138 SOR1YJR159W 1074 nt9.22□□□□□ -0.93
YKR045CP36138 BOP3YNL042W 1191 nt9.21□□□□□ -0.94
YKR045CP36138 YCL042WYCL042W 360 nt9.21□□□□□ -0.94
YKR045CP36138 SNF6YHL025W 999 nt9.18□□□□□ -0.94
YKR045CP36138 PTK1YKL198C 1989 nt9.17□□□□□ -0.94
YKR045CP36138 SIM1YIL123W 1431 nt9.15□□□□□ -0.94
YKR045CP36138 BIO4YNR057C 714 nt9.12□□□□□ -0.95
YKR045CP36138 PAC11YDR488C 1602 nt9.11□□□□□ -0.95
YKR045CP36138 NVJ2YPR091C 2313 nt9.09□□□□□ -0.95
YKR045CP36138 YIH1YCR059C 777 nt9.08□□□□□ -0.96
YKR045CP36138 PTH1YHR189W 573 nt9.07□□□□□ -0.96
YKR045CP36138 RNQ1YCL028W 1218 nt9.06□□□□□ -0.96
YKR045CP36138 LYS4YDR234W 2082 nt9.05□□□□□ -0.96
YKR045CP36138 YLL053CYLL053C 459 nt9.04□□□□□ -0.96
YKR045CP36138 DIC1YLR348C 897 nt9.02□□□□□ -0.97
YKR045CP36138 YFL054CYFL054C 1941 nt8.97□□□□□ -0.97
YKR045CP36138 YLR235CYLR235C 399 nt8.97□□□□□ -0.97
YKR045CP36138 ATF2YGR177C 1608 nt8.95□□□□□ -0.98
YKR045CP36138 FTR1YER145C 1215 nt8.95□□□□□ -0.98
YKR045CP36138 ERF2YLR246W 1080 nt8.95□□□□□ -0.98
YKR045CP36138 RTG1YOL067C 534 nt8.95□□□□□ -0.98
YKR045CP36138 GAL1YBR020W 1587 nt8.94□□□□□ -0.98
YKR045CP36138 CRR1YLR213C 1269 nt8.93□□□□□ -0.98
YKR045CP36138 TRM5YHR070W 1500 nt8.93□□□□□ -0.98
YKR045CP36138 TIM23YNR017W 669 nt8.92□□□□□ -0.98
YKR045CP36138 YKL030WYKL030W 606 nt8.91□□□□□ -0.98
YKR045CP36138 YLR179CYLR179C 606 nt8.89□□□□□ -0.99
YKR045CP36138 MIC10YCL057C-A 294 nt8.89□□□□□ -0.99
YKR045CP36138 SPT8YLR055C 1809 nt8.88□□□□□ -0.99
YKR045CP36138 YFL067WYFL067W 528 nt8.86□□□□□ -0.99
YKR045CP36138 DDR2YOL052C-A 186 nt8.86□□□□□ -0.99
YKR045CP36138 SNG1YGR197C 1644 nt8.86□□□□□ -0.99
YKR045CP36138 HEM12YDR047W 1089 nt8.85□□□□□ -0.99
YKR045CP36138 WSC2YNL283C 1512 nt8.83□□□□□ -1
YKR045CP36138 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt8.82□□□□□ -1
YKR045CP36138 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.5 ms