Protein–RNA interactions for Protein: P36131

SPC34, DASH complex subunit SPC34, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC34P36131 ART5YGR068C 1761 nt11.69□□□□□ -0.54
SPC34P36131 SEC11YIR022W 504 nt11.68□□□□□ -0.54
SPC34P36131 HOM6YJR139C 1080 nt11.68□□□□□ -0.54
SPC34P36131 PCH2YBR186W 1695 nt11.68□□□□□ -0.54
SPC34P36131 SHU1YHL006C 453 nt11.66□□□□□ -0.54
SPC34P36131 GUT2YIL155C 1950 nt11.63□□□□□ -0.55
SPC34P36131 PAC11YDR488C 1602 nt11.63□□□□□ -0.55
SPC34P36131 PET9YBL030C 957 nt11.62□□□□□ -0.55
SPC34P36131 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.59□□□□□ -0.55
SPC34P36131 RTS2YOR077W 699 nt11.59□□□□□ -0.55
SPC34P36131 YSC84YHR016C 1407 nt11.55□□□□□ -0.56
SPC34P36131 YCH1YGR203W 447 nt11.55□□□□□ -0.56
SPC34P36131 MNP1YGL068W 585 nt11.53□□□□□ -0.56
SPC34P36131 CUE1YMR264W 612 nt11.52□□□□□ -0.57
SPC34P36131 TIR4YOR009W 1464 nt11.51□□□□□ -0.57
SPC34P36131 RKM5YLR137W 1104 nt11.5□□□□□ -0.57
SPC34P36131 YHL050CYHL050C 2094 nt11.48□□□□□ -0.57
SPC34P36131 PIB2YGL023C 1908 nt11.45□□□□□ -0.58
SPC34P36131 YMR057CYMR057C 372 nt11.41□□□□□ -0.58
SPC34P36131 RRT12YCR045C 1476 nt11.39□□□□□ -0.59
SPC34P36131 RTF1YGL244W 1677 nt11.37□□□□□ -0.59
SPC34P36131 YIL100WYIL100W 354 nt11.37□□□□□ -0.59
SPC34P36131 YNL195CYNL195C 786 nt11.37□□□□□ -0.59
SPC34P36131 FPS1YLL043W 2010 nt11.36□□□□□ -0.59
SPC34P36131 YJL225CYJL225C 5277 nt11.36□□□□□ -0.59
SPC34P36131 YKL097CYKL097C 411 nt11.34□□□□□ -0.59
SPC34P36131 NPL3YDR432W 1245 nt11.33□□□□□ -0.6
SPC34P36131 YLR236CYLR236C 324 nt11.3□□□□□ -0.6
SPC34P36131 BOP3YNL042W 1191 nt11.29□□□□□ -0.6
SPC34P36131 NVJ2YPR091C 2313 nt11.26□□□□□ -0.61
SPC34P36131 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.25□□□□□ -0.61
SPC34P36131 YJL152WYJL152W 360 nt11.23□□□□□ -0.61
SPC34P36131 YOL037CYOL037C 354 nt11.21□□□□□ -0.61
SPC34P36131 PTK1YKL198C 1989 nt11.2□□□□□ -0.62
SPC34P36131 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.2□□□□□ -0.62
SPC34P36131 NCP1YHR042W 2076 nt11.16□□□□□ -0.62
SPC34P36131 LCB1YMR296C 1677 nt11.01□□□□□ -0.65
SPC34P36131 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.99□□□□□ -0.65
SPC34P36131 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.99□□□□□ -0.65
SPC34P36131 WHI5YOR083W 888 nt10.98□□□□□ -0.65
SPC34P36131 YOR139CYOR139C 393 nt10.97□□□□□ -0.65
SPC34P36131 YFL054CYFL054C 1941 nt10.96□□□□□ -0.65
SPC34P36131 RRD1YIL153W 1182 nt10.96□□□□□ -0.65
SPC34P36131 YLR281CYLR281C 468 nt10.95□□□□□ -0.66
SPC34P36131 FMP52YER004W 696 nt10.93□□□□□ -0.66
SPC34P36131 IDH1YNL037C 1083 nt10.93□□□□□ -0.66
SPC34P36131 SPT8YLR055C 1809 nt10.91□□□□□ -0.66
SPC34P36131 GBP2YCL011C 1284 nt10.89□□□□□ -0.67
SPC34P36131 DED1YOR204W 1815 nt10.86□□□□□ -0.67
SPC34P36131 PCM1YEL058W 1674 nt10.85□□□□□ -0.67
SPC34P36131 TCD2YKL027W 1344 nt10.84□□□□□ -0.67
SPC34P36131 SIM1YIL123W 1431 nt10.83□□□□□ -0.68
SPC34P36131 IMP2'YIL154C 1041 nt10.79□□□□□ -0.68
SPC34P36131 FMT1YBL013W 1206 nt10.79□□□□□ -0.68
SPC34P36131 LYS4YDR234W 2082 nt10.79□□□□□ -0.68
SPC34P36131 BIO4YNR057C 714 nt10.74□□□□□ -0.69
SPC34P36131 SNF6YHL025W 999 nt10.73□□□□□ -0.69
SPC34P36131 ADH2YMR303C 1047 nt10.73□□□□□ -0.69
SPC34P36131 CWP1YKL096W 720 nt10.72□□□□□ -0.69
SPC34P36131 DSK2YMR276W 1122 nt10.72□□□□□ -0.69
SPC34P36131 BOR1YNL275W 1731 nt10.72□□□□□ -0.69
SPC34P36131 SWE1YJL187C 2460 nt10.71□□□□□ -0.69
SPC34P36131 SOR2YDL246C 1074 nt10.68□□□□□ -0.7
SPC34P36131 PUS2YGL063W 1113 nt10.68□□□□□ -0.7
SPC34P36131 SOR1YJR159W 1074 nt10.68□□□□□ -0.7
SPC34P36131 YDR433WYDR433W 441 nt10.67□□□□□ -0.7
SPC34P36131 Q0182Q0182 405 nt10.64□□□□□ -0.71
SPC34P36131 MXR2YCL033C 507 nt10.64□□□□□ -0.71
SPC34P36131 FMP45YDL222C 930 nt10.63□□□□□ -0.71
SPC34P36131 ERF2YLR246W 1080 nt10.63□□□□□ -0.71
SPC34P36131 CRR1YLR213C 1269 nt10.61□□□□□ -0.71
SPC34P36131 YCL042WYCL042W 360 nt10.61□□□□□ -0.71
SPC34P36131 YIH1YCR059C 777 nt10.6□□□□□ -0.71
SPC34P36131 YPR011CYPR011C 981 nt10.59□□□□□ -0.71
SPC34P36131 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.57□□□□□ -0.72
SPC34P36131 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.57□□□□□ -0.72
SPC34P36131 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.57□□□□□ -0.72
SPC34P36131 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.57□□□□□ -0.72
SPC34P36131 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.57□□□□□ -0.72
SPC34P36131 ERV46YAL042W 1248 nt10.57□□□□□ -0.72
SPC34P36131 HSP60YLR259C 1719 nt10.54□□□□□ -0.72
SPC34P36131 RNQ1YCL028W 1218 nt10.54□□□□□ -0.72
SPC34P36131 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.53□□□□□ -0.72
SPC34P36131 YKR040CYKR040C 504 nt10.53□□□□□ -0.72
SPC34P36131 YLL053CYLL053C 459 nt10.53□□□□□ -0.72
SPC34P36131 FRD1YEL047C 1413 nt10.52□□□□□ -0.73
SPC34P36131 LPX1YOR084W 1164 nt10.51□□□□□ -0.73
SPC34P36131 HEM12YDR047W 1089 nt10.49□□□□□ -0.73
SPC34P36131 ATF2YGR177C 1608 nt10.48□□□□□ -0.73
SPC34P36131 MIC10YCL057C-A 294 nt10.46□□□□□ -0.73
SPC34P36131 YFL067WYFL067W 528 nt10.45□□□□□ -0.74
SPC34P36131 GLK1YCL040W 1503 nt10.44□□□□□ -0.74
SPC34P36131 FTR1YER145C 1215 nt10.44□□□□□ -0.74
SPC34P36131 SNG1YGR197C 1644 nt10.44□□□□□ -0.74
SPC34P36131 RAX1YOR301W 1308 nt10.43□□□□□ -0.74
SPC34P36131 UME6YDR207C 2511 nt10.43□□□□□ -0.74
SPC34P36131 FUR4YBR021W 1902 nt10.41□□□□□ -0.74
SPC34P36131 CCA1YER168C 1641 nt10.4□□□□□ -0.74
SPC34P36131 DIC1YLR348C 897 nt10.4□□□□□ -0.74
SPC34P36131 GAL1YBR020W 1587 nt10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms