Protein–RNA interactions for Protein: P34162

SRB2, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, yeastyeast

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRB2P34162 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.85□□□□□ -0.35
SRB2P34162 SSA4YER103W 1929 nt12.85□□□□□ -0.35
SRB2P34162 DCW1YKL046C 1350 nt12.83□□□□□ -0.36
SRB2P34162 PTP1YDL230W 1008 nt12.83□□□□□ -0.36
SRB2P34162 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.82□□□□□ -0.36
SRB2P34162 PUS2YGL063W 1113 nt12.77□□□□□ -0.37
SRB2P34162 CAC2YML102W 1407 nt12.72□□□□□ -0.37
SRB2P34162 TIR4YOR009W 1464 nt12.72□□□□□ -0.37
SRB2P34162 ART5YGR068C 1761 nt12.71□□□□□ -0.38
SRB2P34162 YJL152WYJL152W 360 nt12.69□□□□□ -0.38
SRB2P34162 EMI2YDR516C 1503 nt12.67□□□□□ -0.38
SRB2P34162 GFD2YCL036W 1701 nt12.66□□□□□ -0.38
SRB2P34162 YCH1YGR203W 447 nt12.65□□□□□ -0.38
SRB2P34162 PET9YBL030C 957 nt12.64□□□□□ -0.39
SRB2P34162 DSK2YMR276W 1122 nt12.59□□□□□ -0.39
SRB2P34162 YDL221WYDL221W 552 nt12.58□□□□□ -0.4
SRB2P34162 YMR057CYMR057C 372 nt12.57□□□□□ -0.4
SRB2P34162 IMP2'YIL154C 1041 nt12.56□□□□□ -0.4
SRB2P34162 YLR236CYLR236C 324 nt12.56□□□□□ -0.4
SRB2P34162 YMR090WYMR090W 684 nt12.56□□□□□ -0.4
SRB2P34162 YPR011CYPR011C 981 nt12.56□□□□□ -0.4
SRB2P34162 IRC15YPL017C 1500 nt12.53□□□□□ -0.4
SRB2P34162 RTS2YOR077W 699 nt12.5□□□□□ -0.41
SRB2P34162 IDH1YNL037C 1083 nt12.48□□□□□ -0.41
SRB2P34162 FMP45YDL222C 930 nt12.45□□□□□ -0.42
SRB2P34162 GIS3YLR094C 1509 nt12.43□□□□□ -0.42
SRB2P34162 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.43□□□□□ -0.42
SRB2P34162 SDH1YKL148C 1923 nt12.42□□□□□ -0.42
SRB2P34162 YBR220CYBR220C 1683 nt12.42□□□□□ -0.42
SRB2P34162 FPS1YLL043W 2010 nt12.4□□□□□ -0.42
SRB2P34162 CUE1YMR264W 612 nt12.38□□□□□ -0.43
SRB2P34162 GBP2YCL011C 1284 nt12.38□□□□□ -0.43
SRB2P34162 BDF1YLR399C 2061 nt12.36□□□□□ -0.43
SRB2P34162 SCC4YER147C 1875 nt12.36□□□□□ -0.43
SRB2P34162 LPX1YOR084W 1164 nt12.34□□□□□ -0.43
SRB2P34162 MOT3YMR070W 1473 nt12.34□□□□□ -0.43
SRB2P34162 ERV46YAL042W 1248 nt12.33□□□□□ -0.44
SRB2P34162 YDR433WYDR433W 441 nt12.32□□□□□ -0.44
SRB2P34162 MXR2YCL033C 507 nt12.25□□□□□ -0.45
SRB2P34162 TCD2YKL027W 1344 nt12.24□□□□□ -0.45
SRB2P34162 RRD1YIL153W 1182 nt12.23□□□□□ -0.45
SRB2P34162 Q0182Q0182 405 nt12.22□□□□□ -0.45
SRB2P34162 YIL100WYIL100W 354 nt12.22□□□□□ -0.45
SRB2P34162 YKR040CYKR040C 504 nt12.22□□□□□ -0.45
SRB2P34162 TAT1YBR069C 1860 nt12.2□□□□□ -0.46
SRB2P34162 DED1YOR204W 1815 nt12.2□□□□□ -0.46
SRB2P34162 SPP1YPL138C 1062 nt12.11□□□□□ -0.47
SRB2P34162 FMT1YBL013W 1206 nt12.09□□□□□ -0.47
SRB2P34162 YSC84YHR016C 1407 nt12.04□□□□□ -0.48
SRB2P34162 FMP52YER004W 696 nt12.04□□□□□ -0.48
SRB2P34162 YNL195CYNL195C 786 nt12.04□□□□□ -0.48
SRB2P34162 FRD1YEL047C 1413 nt12.03□□□□□ -0.48
SRB2P34162 RRT12YCR045C 1476 nt12.03□□□□□ -0.48
SRB2P34162 SOR2YDL246C 1074 nt12.01□□□□□ -0.49
SRB2P34162 SOR1YJR159W 1074 nt12.01□□□□□ -0.49
SRB2P34162 YCL042WYCL042W 360 nt11.99□□□□□ -0.49
SRB2P34162 YHL050CYHL050C 2094 nt11.99□□□□□ -0.49
SRB2P34162 SEC11YIR022W 504 nt11.96□□□□□ -0.49
SRB2P34162 CWP1YKL096W 720 nt11.95□□□□□ -0.5
SRB2P34162 ADH2YMR303C 1047 nt11.94□□□□□ -0.5
SRB2P34162 PCM1YEL058W 1674 nt11.91□□□□□ -0.5
SRB2P34162 PCH2YBR186W 1695 nt11.87□□□□□ -0.51
SRB2P34162 RTG1YOL067C 534 nt11.87□□□□□ -0.51
SRB2P34162 SNF6YHL025W 999 nt11.85□□□□□ -0.51
SRB2P34162 MRPL8YJL063C 717 nt11.85□□□□□ -0.51
SRB2P34162 PTH1YHR189W 573 nt11.83□□□□□ -0.52
SRB2P34162 GUT2YIL155C 1950 nt11.8□□□□□ -0.52
SRB2P34162 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.8□□□□□ -0.52
SRB2P34162 YEL076CYEL076C 651 nt11.8□□□□□ -0.52
SRB2P34162 YLR464WYLR464W 651 nt11.8□□□□□ -0.52
SRB2P34162 YLR235CYLR235C 399 nt11.78□□□□□ -0.52
SRB2P34162 YIH1YCR059C 777 nt11.73□□□□□ -0.53
SRB2P34162 DIC1YLR348C 897 nt11.73□□□□□ -0.53
SRB2P34162 SIM1YIL123W 1431 nt11.72□□□□□ -0.53
SRB2P34162 ADO1YJR105W 1023 nt11.72□□□□□ -0.53
SRB2P34162 RNQ1YCL028W 1218 nt11.72□□□□□ -0.53
SRB2P34162 LCB1YMR296C 1677 nt11.71□□□□□ -0.53
SRB2P34162 PAC11YDR488C 1602 nt11.71□□□□□ -0.53
SRB2P34162 YKL030WYKL030W 606 nt11.71□□□□□ -0.53
SRB2P34162 BIO4YNR057C 714 nt11.7□□□□□ -0.54
SRB2P34162 NCP1YHR042W 2076 nt11.65□□□□□ -0.54
SRB2P34162 TIM23YNR017W 669 nt11.65□□□□□ -0.54
SRB2P34162 PIB2YGL023C 1908 nt11.64□□□□□ -0.55
SRB2P34162 HUA1YGR268C 597 nt11.64□□□□□ -0.55
SRB2P34162 RTF1YGL244W 1677 nt11.63□□□□□ -0.55
SRB2P34162 YLL053CYLL053C 459 nt11.63□□□□□ -0.55
SRB2P34162 BOP3YNL042W 1191 nt11.63□□□□□ -0.55
SRB2P34162 YLR179CYLR179C 606 nt11.58□□□□□ -0.56
SRB2P34162 FTR1YER145C 1215 nt11.56□□□□□ -0.56
SRB2P34162 GAL1YBR020W 1587 nt11.52□□□□□ -0.57
SRB2P34162 ERF2YLR246W 1080 nt11.51□□□□□ -0.57
SRB2P34162 TRM5YHR070W 1500 nt11.49□□□□□ -0.57
SRB2P34162 WSC2YNL283C 1512 nt11.49□□□□□ -0.57
SRB2P34162 CRR1YLR213C 1269 nt11.48□□□□□ -0.57
SRB2P34162 AQY1YPR192W 918 nt11.48□□□□□ -0.57
SRB2P34162 ATF2YGR177C 1608 nt11.48□□□□□ -0.57
SRB2P34162 AHT1YHR093W 549 nt11.47□□□□□ -0.57
SRB2P34162 YPR064WYPR064W 420 nt11.47□□□□□ -0.57
SRB2P34162 LYS4YDR234W 2082 nt11.47□□□□□ -0.57
SRB2P34162 PTK1YKL198C 1989 nt11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.7 ms