Protein–RNA interactions for Protein: P25582

SPB1, 27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPB1P25582 LSM3YLR438C-A 270 nt12□□□□□ -0.49
SPB1P25582 CCT6YDR188W 1641 nt11.99□□□□□ -0.49
SPB1P25582 RKM5YLR137W 1104 nt11.96□□□□□ -0.49
SPB1P25582 NPL3YDR432W 1245 nt11.95□□□□□ -0.5
SPB1P25582 SIS1YNL007C 1059 nt11.94□□□□□ -0.5
SPB1P25582 SCC4YER147C 1875 nt11.93□□□□□ -0.5
SPB1P25582 IRC15YPL017C 1500 nt11.93□□□□□ -0.5
SPB1P25582 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.9□□□□□ -0.5
SPB1P25582 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.9□□□□□ -0.5
SPB1P25582 YOL037CYOL037C 354 nt11.87□□□□□ -0.51
SPB1P25582 GIS3YLR094C 1509 nt11.86□□□□□ -0.51
SPB1P25582 FPS1YLL043W 2010 nt11.84□□□□□ -0.51
SPB1P25582 PCH2YBR186W 1695 nt11.84□□□□□ -0.51
SPB1P25582 GFD2YCL036W 1701 nt11.83□□□□□ -0.52
SPB1P25582 ART5YGR068C 1761 nt11.82□□□□□ -0.52
SPB1P25582 SEC11YIR022W 504 nt11.8□□□□□ -0.52
SPB1P25582 GUT2YIL155C 1950 nt11.79□□□□□ -0.52
SPB1P25582 RTS2YOR077W 699 nt11.76□□□□□ -0.53
SPB1P25582 YSC84YHR016C 1407 nt11.71□□□□□ -0.53
SPB1P25582 PET9YBL030C 957 nt11.7□□□□□ -0.54
SPB1P25582 MOT3YMR070W 1473 nt11.66□□□□□ -0.54
SPB1P25582 YHL050CYHL050C 2094 nt11.64□□□□□ -0.55
SPB1P25582 CUE1YMR264W 612 nt11.63□□□□□ -0.55
SPB1P25582 TIR4YOR009W 1464 nt11.63□□□□□ -0.55
SPB1P25582 PIB2YGL023C 1908 nt11.62□□□□□ -0.55
SPB1P25582 YCH1YGR203W 447 nt11.6□□□□□ -0.55
SPB1P25582 YLR281CYLR281C 468 nt11.59□□□□□ -0.55
SPB1P25582 WHI5YOR083W 888 nt11.58□□□□□ -0.56
SPB1P25582 RRT12YCR045C 1476 nt11.57□□□□□ -0.56
SPB1P25582 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.55□□□□□ -0.56
SPB1P25582 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.54□□□□□ -0.56
SPB1P25582 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.54□□□□□ -0.56
SPB1P25582 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.54□□□□□ -0.56
SPB1P25582 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.54□□□□□ -0.56
SPB1P25582 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.54□□□□□ -0.56
SPB1P25582 YMR057CYMR057C 372 nt11.53□□□□□ -0.56
SPB1P25582 YJL225CYJL225C 5277 nt11.53□□□□□ -0.56
SPB1P25582 RTF1YGL244W 1677 nt11.52□□□□□ -0.56
SPB1P25582 PUS2YGL063W 1113 nt11.51□□□□□ -0.57
SPB1P25582 YJL152WYJL152W 360 nt11.49□□□□□ -0.57
SPB1P25582 YNL195CYNL195C 786 nt11.49□□□□□ -0.57
SPB1P25582 YIL100WYIL100W 354 nt11.48□□□□□ -0.57
SPB1P25582 BOP3YNL042W 1191 nt11.43□□□□□ -0.58
SPB1P25582 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.41□□□□□ -0.58
SPB1P25582 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.41□□□□□ -0.58
SPB1P25582 YLR236CYLR236C 324 nt11.39□□□□□ -0.59
SPB1P25582 PTK1YKL198C 1989 nt11.36□□□□□ -0.59
SPB1P25582 DSK2YMR276W 1122 nt11.33□□□□□ -0.6
SPB1P25582 IMP2'YIL154C 1041 nt11.3□□□□□ -0.6
SPB1P25582 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.3□□□□□ -0.6
SPB1P25582 NCP1YHR042W 2076 nt11.29□□□□□ -0.6
SPB1P25582 YPR011CYPR011C 981 nt11.28□□□□□ -0.6
SPB1P25582 IDH1YNL037C 1083 nt11.27□□□□□ -0.61
SPB1P25582 FMP45YDL222C 930 nt11.23□□□□□ -0.61
SPB1P25582 GBP2YCL011C 1284 nt11.18□□□□□ -0.62
SPB1P25582 LCB1YMR296C 1677 nt11.14□□□□□ -0.63
SPB1P25582 YDR433WYDR433W 441 nt11.14□□□□□ -0.63
SPB1P25582 YFL054CYFL054C 1941 nt11.13□□□□□ -0.63
SPB1P25582 LPX1YOR084W 1164 nt11.12□□□□□ -0.63
SPB1P25582 ERV46YAL042W 1248 nt11.07□□□□□ -0.64
SPB1P25582 SPT8YLR055C 1809 nt11.06□□□□□ -0.64
SPB1P25582 RRD1YIL153W 1182 nt11.05□□□□□ -0.64
SPB1P25582 MXR2YCL033C 507 nt11.05□□□□□ -0.64
SPB1P25582 TCD2YKL027W 1344 nt11.05□□□□□ -0.64
SPB1P25582 UME6YDR207C 2511 nt11.03□□□□□ -0.64
SPB1P25582 YKR040CYKR040C 504 nt11□□□□□ -0.65
SPB1P25582 FMP52YER004W 696 nt10.97□□□□□ -0.65
SPB1P25582 DED1YOR204W 1815 nt10.96□□□□□ -0.65
SPB1P25582 SIM1YIL123W 1431 nt10.95□□□□□ -0.66
SPB1P25582 PCM1YEL058W 1674 nt10.94□□□□□ -0.66
SPB1P25582 LYS4YDR234W 2082 nt10.91□□□□□ -0.66
SPB1P25582 SPP1YPL138C 1062 nt10.91□□□□□ -0.66
SPB1P25582 BOR1YNL275W 1731 nt10.9□□□□□ -0.66
SPB1P25582 FMT1YBL013W 1206 nt10.88□□□□□ -0.67
SPB1P25582 SWE1YJL187C 2460 nt10.86□□□□□ -0.67
SPB1P25582 BIO4YNR057C 714 nt10.84□□□□□ -0.67
SPB1P25582 ADH2YMR303C 1047 nt10.83□□□□□ -0.68
SPB1P25582 YCL042WYCL042W 360 nt10.83□□□□□ -0.68
SPB1P25582 CWP1YKL096W 720 nt10.82□□□□□ -0.68
SPB1P25582 FRD1YEL047C 1413 nt10.82□□□□□ -0.68
SPB1P25582 SNF6YHL025W 999 nt10.81□□□□□ -0.68
SPB1P25582 SOR2YDL246C 1074 nt10.78□□□□□ -0.68
SPB1P25582 SOR1YJR159W 1074 nt10.78□□□□□ -0.68
SPB1P25582 HSP60YLR259C 1719 nt10.72□□□□□ -0.69
SPB1P25582 CRR1YLR213C 1269 nt10.7□□□□□ -0.7
SPB1P25582 ERF2YLR246W 1080 nt10.7□□□□□ -0.7
SPB1P25582 PTH1YHR189W 573 nt10.69□□□□□ -0.7
SPB1P25582 YIH1YCR059C 777 nt10.66□□□□□ -0.7
SPB1P25582 RTG1YOL067C 534 nt10.65□□□□□ -0.7
SPB1P25582 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.64□□□□□ -0.71
SPB1P25582 MRPL8YJL063C 717 nt10.62□□□□□ -0.71
SPB1P25582 YLL053CYLL053C 459 nt10.62□□□□□ -0.71
SPB1P25582 RPM1RPM1 483 nt10.62□□□□□ -0.71
SPB1P25582 YLR235CYLR235C 399 nt10.61□□□□□ -0.71
SPB1P25582 GLK1YCL040W 1503 nt10.6□□□□□ -0.71
SPB1P25582 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.6□□□□□ -0.71
SPB1P25582 YEL076CYEL076C 651 nt10.6□□□□□ -0.71
SPB1P25582 YLR464WYLR464W 651 nt10.6□□□□□ -0.71
SPB1P25582 RNQ1YCL028W 1218 nt10.6□□□□□ -0.71
SPB1P25582 HEM12YDR047W 1089 nt10.59□□□□□ -0.71
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