Protein–RNA interactions for Protein: P20434

RPB5, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, yeastyeast

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPB5P20434 WHI5YOR083W 888 nt11.41□□□□□ -0.58
RPB5P20434 CAC2YML102W 1407 nt11.41□□□□□ -0.58
RPB5P20434 YMR090WYMR090W 684 nt11.39□□□□□ -0.59
RPB5P20434 ART5YGR068C 1761 nt11.39□□□□□ -0.59
RPB5P20434 YJL152WYJL152W 360 nt11.36□□□□□ -0.59
RPB5P20434 YCH1YGR203W 447 nt11.35□□□□□ -0.59
RPB5P20434 TIR4YOR009W 1464 nt11.35□□□□□ -0.59
RPB5P20434 YDL221WYDL221W 552 nt11.34□□□□□ -0.59
RPB5P20434 PET9YBL030C 957 nt11.34□□□□□ -0.59
RPB5P20434 GFD2YCL036W 1701 nt11.34□□□□□ -0.59
RPB5P20434 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.32□□□□□ -0.6
RPB5P20434 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.32□□□□□ -0.6
RPB5P20434 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.32□□□□□ -0.6
RPB5P20434 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.32□□□□□ -0.6
RPB5P20434 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.32□□□□□ -0.6
RPB5P20434 PUS2YGL063W 1113 nt11.31□□□□□ -0.6
RPB5P20434 YMR057CYMR057C 372 nt11.24□□□□□ -0.61
RPB5P20434 IRC15YPL017C 1500 nt11.24□□□□□ -0.61
RPB5P20434 RTS2YOR077W 699 nt11.21□□□□□ -0.61
RPB5P20434 IMP2'YIL154C 1041 nt11.2□□□□□ -0.62
RPB5P20434 SDH1YKL148C 1923 nt11.19□□□□□ -0.62
RPB5P20434 YBR220CYBR220C 1683 nt11.19□□□□□ -0.62
RPB5P20434 DSK2YMR276W 1122 nt11.18□□□□□ -0.62
RPB5P20434 GIS3YLR094C 1509 nt11.16□□□□□ -0.62
RPB5P20434 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.16□□□□□ -0.62
RPB5P20434 IDH1YNL037C 1083 nt11.15□□□□□ -0.62
RPB5P20434 SCC4YER147C 1875 nt11.14□□□□□ -0.63
RPB5P20434 CUE1YMR264W 612 nt11.12□□□□□ -0.63
RPB5P20434 YLR236CYLR236C 324 nt11.1□□□□□ -0.63
RPB5P20434 FPS1YLL043W 2010 nt11.08□□□□□ -0.64
RPB5P20434 YPR011CYPR011C 981 nt11.06□□□□□ -0.64
RPB5P20434 GBP2YCL011C 1284 nt11.05□□□□□ -0.64
RPB5P20434 BDF1YLR399C 2061 nt11.04□□□□□ -0.64
RPB5P20434 FMP45YDL222C 930 nt11.02□□□□□ -0.65
RPB5P20434 YIL100WYIL100W 354 nt11.02□□□□□ -0.65
RPB5P20434 YDR433WYDR433W 441 nt10.98□□□□□ -0.65
RPB5P20434 TCD2YKL027W 1344 nt10.94□□□□□ -0.66
RPB5P20434 ERV46YAL042W 1248 nt10.94□□□□□ -0.66
RPB5P20434 LPX1YOR084W 1164 nt10.92□□□□□ -0.66
RPB5P20434 TAT1YBR069C 1860 nt10.91□□□□□ -0.66
RPB5P20434 RRD1YIL153W 1182 nt10.89□□□□□ -0.67
RPB5P20434 YNL195CYNL195C 786 nt10.89□□□□□ -0.67
RPB5P20434 YKR040CYKR040C 504 nt10.87□□□□□ -0.67
RPB5P20434 MXR2YCL033C 507 nt10.87□□□□□ -0.67
RPB5P20434 MOT3YMR070W 1473 nt10.86□□□□□ -0.67
RPB5P20434 YSC84YHR016C 1407 nt10.85□□□□□ -0.67
RPB5P20434 DED1YOR204W 1815 nt10.85□□□□□ -0.67
RPB5P20434 SEC11YIR022W 504 nt10.84□□□□□ -0.67
RPB5P20434 RRT12YCR045C 1476 nt10.81□□□□□ -0.68
RPB5P20434 FMP52YER004W 696 nt10.8□□□□□ -0.68
RPB5P20434 YHL050CYHL050C 2094 nt10.78□□□□□ -0.68
RPB5P20434 FMT1YBL013W 1206 nt10.75□□□□□ -0.69
RPB5P20434 PCH2YBR186W 1695 nt10.74□□□□□ -0.69
RPB5P20434 YCL042WYCL042W 360 nt10.74□□□□□ -0.69
RPB5P20434 PAC11YDR488C 1602 nt10.73□□□□□ -0.69
RPB5P20434 SOR2YDL246C 1074 nt10.71□□□□□ -0.69
RPB5P20434 SOR1YJR159W 1074 nt10.71□□□□□ -0.69
RPB5P20434 FRD1YEL047C 1413 nt10.69□□□□□ -0.7
RPB5P20434 CWP1YKL096W 720 nt10.69□□□□□ -0.7
RPB5P20434 GUT2YIL155C 1950 nt10.66□□□□□ -0.7
RPB5P20434 SPP1YPL138C 1062 nt10.66□□□□□ -0.7
RPB5P20434 PCM1YEL058W 1674 nt10.66□□□□□ -0.7
RPB5P20434 ADH2YMR303C 1047 nt10.65□□□□□ -0.7
RPB5P20434 SNF6YHL025W 999 nt10.62□□□□□ -0.71
RPB5P20434 NVJ2YPR091C 2313 nt10.57□□□□□ -0.72
RPB5P20434 SIM1YIL123W 1431 nt10.53□□□□□ -0.72
RPB5P20434 RTF1YGL244W 1677 nt10.53□□□□□ -0.72
RPB5P20434 BOP3YNL042W 1191 nt10.52□□□□□ -0.73
RPB5P20434 PTH1YHR189W 573 nt10.51□□□□□ -0.73
RPB5P20434 LCB1YMR296C 1677 nt10.5□□□□□ -0.73
RPB5P20434 YLR235CYLR235C 399 nt10.5□□□□□ -0.73
RPB5P20434 YIH1YCR059C 777 nt10.48□□□□□ -0.73
RPB5P20434 RNQ1YCL028W 1218 nt10.48□□□□□ -0.73
RPB5P20434 PIB2YGL023C 1908 nt10.48□□□□□ -0.73
RPB5P20434 BIO4YNR057C 714 nt10.47□□□□□ -0.73
RPB5P20434 DIC1YLR348C 897 nt10.46□□□□□ -0.73
RPB5P20434 NCP1YHR042W 2076 nt10.46□□□□□ -0.74
RPB5P20434 RTG1YOL067C 534 nt10.45□□□□□ -0.74
RPB5P20434 MRPL8YJL063C 717 nt10.43□□□□□ -0.74
RPB5P20434 YKL030WYKL030W 606 nt10.41□□□□□ -0.74
RPB5P20434 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.4□□□□□ -0.74
RPB5P20434 YEL076CYEL076C 651 nt10.4□□□□□ -0.74
RPB5P20434 YLL053CYLL053C 459 nt10.4□□□□□ -0.74
RPB5P20434 YLR464WYLR464W 651 nt10.4□□□□□ -0.74
RPB5P20434 TIM23YNR017W 669 nt10.38□□□□□ -0.75
RPB5P20434 ADO1YJR105W 1023 nt10.36□□□□□ -0.75
RPB5P20434 ERF2YLR246W 1080 nt10.34□□□□□ -0.75
RPB5P20434 FTR1YER145C 1215 nt10.33□□□□□ -0.76
RPB5P20434 YLR179CYLR179C 606 nt10.33□□□□□ -0.76
RPB5P20434 PTK1YKL198C 1989 nt10.33□□□□□ -0.76
RPB5P20434 HUA1YGR268C 597 nt10.31□□□□□ -0.76
RPB5P20434 CRR1YLR213C 1269 nt10.29□□□□□ -0.76
RPB5P20434 AQY1YPR192W 918 nt10.29□□□□□ -0.76
RPB5P20434 GAL1YBR020W 1587 nt10.29□□□□□ -0.76
RPB5P20434 LYS4YDR234W 2082 nt10.27□□□□□ -0.76
RPB5P20434 YFL067WYFL067W 528 nt10.27□□□□□ -0.77
RPB5P20434 TRM5YHR070W 1500 nt10.27□□□□□ -0.77
RPB5P20434 ATF2YGR177C 1608 nt10.26□□□□□ -0.77
RPB5P20434 DDR2YOL052C-A 186 nt10.25□□□□□ -0.77
RPB5P20434 YJL225CYJL225C 5277 nt10.25□□□□□ -0.77
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