Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HPGDP15428 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HPGDP15428 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPGDP15428 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HPGDP15428 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPGDP15428 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HPGDP15428 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPGDP15428 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HPGDP15428 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HPGDP15428 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPGDP15428 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPGDP15428 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPGDP15428 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPGDP15428 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPGDP15428 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPGDP15428 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPGDP15428 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPGDP15428 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPGDP15428 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPGDP15428 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPGDP15428 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPGDP15428 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HPGDP15428 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPGDP15428 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPGDP15428 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPGDP15428 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPGDP15428 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPGDP15428 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPGDP15428 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPGDP15428 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPGDP15428 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPGDP15428 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPGDP15428 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPGDP15428 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPGDP15428 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPGDP15428 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPGDP15428 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPGDP15428 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPGDP15428 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPGDP15428 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPGDP15428 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPGDP15428 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPGDP15428 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPGDP15428 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPGDP15428 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPGDP15428 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPGDP15428 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HPGDP15428 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPGDP15428 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPGDP15428 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPGDP15428 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPGDP15428 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HPGDP15428 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPGDP15428 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPGDP15428 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPGDP15428 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPGDP15428 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPGDP15428 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPGDP15428 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPGDP15428 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPGDP15428 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPGDP15428 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPGDP15428 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPGDP15428 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPGDP15428 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPGDP15428 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPGDP15428 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPGDP15428 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPGDP15428 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPGDP15428 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPGDP15428 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPGDP15428 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPGDP15428 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPGDP15428 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPGDP15428 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPGDP15428 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPGDP15428 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPGDP15428 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPGDP15428 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPGDP15428 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPGDP15428 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPGDP15428 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HPGDP15428 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPGDP15428 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPGDP15428 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPGDP15428 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPGDP15428 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPGDP15428 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPGDP15428 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPGDP15428 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPGDP15428 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPGDP15428 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPGDP15428 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPGDP15428 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPGDP15428 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPGDP15428 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPGDP15428 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPGDP15428 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPGDP15428 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPGDP15428 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 312.7 ms