Protein–RNA interactions for Protein: P08458

SPS1, Sporulation-specific protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPS1P08458 PAC11YDR488C 1602 nt12.22□□□□□ -0.45
SPS1P08458 NVJ2YPR091C 2313 nt12.2□□□□□ -0.46
SPS1P08458 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.18□□□□□ -0.46
SPS1P08458 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.18□□□□□ -0.46
SPS1P08458 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.18□□□□□ -0.46
SPS1P08458 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.18□□□□□ -0.46
SPS1P08458 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.18□□□□□ -0.46
SPS1P08458 WHI5YOR083W 888 nt12.18□□□□□ -0.46
SPS1P08458 CAC2YML102W 1407 nt12.18□□□□□ -0.46
SPS1P08458 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.16□□□□□ -0.46
SPS1P08458 TIR4YOR009W 1464 nt12.14□□□□□ -0.47
SPS1P08458 ART5YGR068C 1761 nt12.12□□□□□ -0.47
SPS1P08458 EMI2YDR516C 1503 nt12.11□□□□□ -0.47
SPS1P08458 GFD2YCL036W 1701 nt12.1□□□□□ -0.47
SPS1P08458 YCH1YGR203W 447 nt12.09□□□□□ -0.47
SPS1P08458 PUS2YGL063W 1113 nt12.07□□□□□ -0.48
SPS1P08458 FPS1YLL043W 2010 nt12.04□□□□□ -0.48
SPS1P08458 YDL221WYDL221W 552 nt12.03□□□□□ -0.48
SPS1P08458 PET9YBL030C 957 nt12.02□□□□□ -0.49
SPS1P08458 IRC15YPL017C 1500 nt12.01□□□□□ -0.49
SPS1P08458 YJL152WYJL152W 360 nt12□□□□□ -0.49
SPS1P08458 YLR236CYLR236C 324 nt11.98□□□□□ -0.49
SPS1P08458 YPR011CYPR011C 981 nt11.98□□□□□ -0.49
SPS1P08458 YMR057CYMR057C 372 nt11.95□□□□□ -0.5
SPS1P08458 RTS2YOR077W 699 nt11.93□□□□□ -0.5
SPS1P08458 BDF1YLR399C 2061 nt11.92□□□□□ -0.5
SPS1P08458 DSK2YMR276W 1122 nt11.92□□□□□ -0.5
SPS1P08458 YBR220CYBR220C 1683 nt11.91□□□□□ -0.5
SPS1P08458 YMR090WYMR090W 684 nt11.9□□□□□ -0.5
SPS1P08458 GIS3YLR094C 1509 nt11.89□□□□□ -0.51
SPS1P08458 SDH1YKL148C 1923 nt11.88□□□□□ -0.51
SPS1P08458 IMP2'YIL154C 1041 nt11.86□□□□□ -0.51
SPS1P08458 CUE1YMR264W 612 nt11.81□□□□□ -0.52
SPS1P08458 IDH1YNL037C 1083 nt11.81□□□□□ -0.52
SPS1P08458 SCC4YER147C 1875 nt11.8□□□□□ -0.52
SPS1P08458 FMP45YDL222C 930 nt11.78□□□□□ -0.52
SPS1P08458 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.77□□□□□ -0.53
SPS1P08458 TAT1YBR069C 1860 nt11.74□□□□□ -0.53
SPS1P08458 LPX1YOR084W 1164 nt11.73□□□□□ -0.53
SPS1P08458 GBP2YCL011C 1284 nt11.73□□□□□ -0.53
SPS1P08458 ERV46YAL042W 1248 nt11.72□□□□□ -0.53
SPS1P08458 RRD1YIL153W 1182 nt11.68□□□□□ -0.54
SPS1P08458 DED1YOR204W 1815 nt11.67□□□□□ -0.54
SPS1P08458 YDR433WYDR433W 441 nt11.66□□□□□ -0.54
SPS1P08458 MXR2YCL033C 507 nt11.66□□□□□ -0.54
SPS1P08458 YIL100WYIL100W 354 nt11.59□□□□□ -0.55
SPS1P08458 TCD2YKL027W 1344 nt11.59□□□□□ -0.55
SPS1P08458 YKR040CYKR040C 504 nt11.58□□□□□ -0.56
SPS1P08458 FMT1YBL013W 1206 nt11.56□□□□□ -0.56
SPS1P08458 RPM1RPM1 483 nt11.56□□□□□ -0.56
SPS1P08458 SPP1YPL138C 1062 nt11.53□□□□□ -0.56
SPS1P08458 YHL050CYHL050C 2094 nt11.52□□□□□ -0.57
SPS1P08458 YSC84YHR016C 1407 nt11.52□□□□□ -0.57
SPS1P08458 RRT12YCR045C 1476 nt11.5□□□□□ -0.57
SPS1P08458 FRD1YEL047C 1413 nt11.48□□□□□ -0.57
SPS1P08458 SOR2YDL246C 1074 nt11.46□□□□□ -0.57
SPS1P08458 SOR1YJR159W 1074 nt11.46□□□□□ -0.57
SPS1P08458 FMP52YER004W 696 nt11.45□□□□□ -0.58
SPS1P08458 SEC11YIR022W 504 nt11.39□□□□□ -0.59
SPS1P08458 YNL195CYNL195C 786 nt11.39□□□□□ -0.59
SPS1P08458 ADH2YMR303C 1047 nt11.38□□□□□ -0.59
SPS1P08458 PCH2YBR186W 1695 nt11.38□□□□□ -0.59
SPS1P08458 CWP1YKL096W 720 nt11.35□□□□□ -0.59
SPS1P08458 GUT2YIL155C 1950 nt11.34□□□□□ -0.59
SPS1P08458 PCM1YEL058W 1674 nt11.34□□□□□ -0.59
SPS1P08458 YCL042WYCL042W 360 nt11.33□□□□□ -0.6
SPS1P08458 RTG1YOL067C 534 nt11.3□□□□□ -0.6
SPS1P08458 PIB2YGL023C 1908 nt11.27□□□□□ -0.6
SPS1P08458 UME6YDR207C 2511 nt11.27□□□□□ -0.61
SPS1P08458 SNF6YHL025W 999 nt11.24□□□□□ -0.61
SPS1P08458 LCB1YMR296C 1677 nt11.24□□□□□ -0.61
SPS1P08458 PTH1YHR189W 573 nt11.23□□□□□ -0.61
SPS1P08458 NCP1YHR042W 2076 nt11.23□□□□□ -0.61
SPS1P08458 YJL225CYJL225C 5277 nt11.2□□□□□ -0.62
SPS1P08458 MRPL8YJL063C 717 nt11.19□□□□□ -0.62
SPS1P08458 YIH1YCR059C 777 nt11.18□□□□□ -0.62
SPS1P08458 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.17□□□□□ -0.62
SPS1P08458 YEL076CYEL076C 651 nt11.17□□□□□ -0.62
SPS1P08458 YLR464WYLR464W 651 nt11.17□□□□□ -0.62
SPS1P08458 BIO4YNR057C 714 nt11.17□□□□□ -0.62
SPS1P08458 DIC1YLR348C 897 nt11.15□□□□□ -0.62
SPS1P08458 YLR235CYLR235C 399 nt11.14□□□□□ -0.63
SPS1P08458 RNQ1YCL028W 1218 nt11.14□□□□□ -0.63
SPS1P08458 SIM1YIL123W 1431 nt11.14□□□□□ -0.63
SPS1P08458 RTF1YGL244W 1677 nt11.14□□□□□ -0.63
SPS1P08458 BOP3YNL042W 1191 nt11.09□□□□□ -0.63
SPS1P08458 YKL030WYKL030W 606 nt11.08□□□□□ -0.64
SPS1P08458 YLL053CYLL053C 459 nt11.07□□□□□ -0.64
SPS1P08458 ADO1YJR105W 1023 nt11.04□□□□□ -0.64
SPS1P08458 TIM23YNR017W 669 nt11.04□□□□□ -0.64
SPS1P08458 PTK1YKL198C 1989 nt11.03□□□□□ -0.64
SPS1P08458 LYS4YDR234W 2082 nt11.02□□□□□ -0.64
SPS1P08458 FTR1YER145C 1215 nt11□□□□□ -0.65
SPS1P08458 FRE6YLL051C 2139 nt10.98□□□□□ -0.65
SPS1P08458 HUA1YGR268C 597 nt10.97□□□□□ -0.65
SPS1P08458 YLR179CYLR179C 606 nt10.97□□□□□ -0.65
SPS1P08458 WSC2YNL283C 1512 nt10.97□□□□□ -0.65
SPS1P08458 GAL1YBR020W 1587 nt10.97□□□□□ -0.65
SPS1P08458 ATF2YGR177C 1608 nt10.96□□□□□ -0.65
SPS1P08458 CRR1YLR213C 1269 nt10.96□□□□□ -0.65
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