Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFS5O43920 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFS5O43920 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFS5O43920 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFS5O43920 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFS5O43920 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFS5O43920 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFS5O43920 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFS5O43920 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFS5O43920 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFS5O43920 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFS5O43920 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFS5O43920 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFS5O43920 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFS5O43920 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFS5O43920 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFS5O43920 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFS5O43920 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS5O43920 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS5O43920 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS5O43920 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS5O43920 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS5O43920 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS5O43920 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS5O43920 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDUFS5O43920 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFS5O43920 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFS5O43920 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFS5O43920 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFS5O43920 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFS5O43920 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFS5O43920 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFS5O43920 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFS5O43920 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS5O43920 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS5O43920 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS5O43920 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS5O43920 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS5O43920 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFS5O43920 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFS5O43920 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFS5O43920 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFS5O43920 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFS5O43920 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFS5O43920 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFS5O43920 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFS5O43920 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFS5O43920 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS5O43920 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS5O43920 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS5O43920 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS5O43920 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS5O43920 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFS5O43920 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS5O43920 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS5O43920 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS5O43920 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFS5O43920 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFS5O43920 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFS5O43920 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFS5O43920 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFS5O43920 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS5O43920 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS5O43920 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NDUFS5O43920 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFS5O43920 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDUFS5O43920 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDUFS5O43920 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS5O43920 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS5O43920 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS5O43920 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS5O43920 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS5O43920 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS5O43920 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS5O43920 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS5O43920 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS5O43920 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDUFS5O43920 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFS5O43920 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFS5O43920 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFS5O43920 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFS5O43920 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFS5O43920 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFS5O43920 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFS5O43920 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFS5O43920 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFS5O43920 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFS5O43920 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFS5O43920 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFS5O43920 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFS5O43920 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFS5O43920 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS5O43920 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS5O43920 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS5O43920 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS5O43920 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS5O43920 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS5O43920 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS5O43920 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS5O43920 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms