Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PABPN1LA6NDY0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PABPN1LA6NDY0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PABPN1LA6NDY0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PABPN1LA6NDY0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PABPN1LA6NDY0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PABPN1LA6NDY0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PABPN1LA6NDY0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPN1LA6NDY0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPN1LA6NDY0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PABPN1LA6NDY0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PABPN1LA6NDY0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PABPN1LA6NDY0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PABPN1LA6NDY0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PABPN1LA6NDY0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PABPN1LA6NDY0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PABPN1LA6NDY0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PABPN1LA6NDY0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PABPN1LA6NDY0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PABPN1LA6NDY0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PABPN1LA6NDY0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PABPN1LA6NDY0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PABPN1LA6NDY0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PABPN1LA6NDY0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PABPN1LA6NDY0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PABPN1LA6NDY0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PABPN1LA6NDY0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PABPN1LA6NDY0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PABPN1LA6NDY0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PABPN1LA6NDY0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PABPN1LA6NDY0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PABPN1LA6NDY0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PABPN1LA6NDY0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PABPN1LA6NDY0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PABPN1LA6NDY0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PABPN1LA6NDY0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PABPN1LA6NDY0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PABPN1LA6NDY0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PABPN1LA6NDY0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PABPN1LA6NDY0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PABPN1LA6NDY0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PABPN1LA6NDY0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PABPN1LA6NDY0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PABPN1LA6NDY0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PABPN1LA6NDY0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PABPN1LA6NDY0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PABPN1LA6NDY0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PABPN1LA6NDY0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PABPN1LA6NDY0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PABPN1LA6NDY0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PABPN1LA6NDY0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PABPN1LA6NDY0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PABPN1LA6NDY0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PABPN1LA6NDY0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PABPN1LA6NDY0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PABPN1LA6NDY0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PABPN1LA6NDY0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PABPN1LA6NDY0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPN1LA6NDY0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PABPN1LA6NDY0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PABPN1LA6NDY0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PABPN1LA6NDY0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PABPN1LA6NDY0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PABPN1LA6NDY0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PABPN1LA6NDY0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PABPN1LA6NDY0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PABPN1LA6NDY0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PABPN1LA6NDY0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PABPN1LA6NDY0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PABPN1LA6NDY0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PABPN1LA6NDY0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PABPN1LA6NDY0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PABPN1LA6NDY0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PABPN1LA6NDY0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PABPN1LA6NDY0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PABPN1LA6NDY0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PABPN1LA6NDY0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PABPN1LA6NDY0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PABPN1LA6NDY0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PABPN1LA6NDY0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PABPN1LA6NDY0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPN1LA6NDY0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPN1LA6NDY0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPN1LA6NDY0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPN1LA6NDY0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPN1LA6NDY0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPN1LA6NDY0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PABPN1LA6NDY0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PABPN1LA6NDY0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PABPN1LA6NDY0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PABPN1LA6NDY0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PABPN1LA6NDY0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PABPN1LA6NDY0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PABPN1LA6NDY0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PABPN1LA6NDY0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PABPN1LA6NDY0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPN1LA6NDY0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PABPN1LA6NDY0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PABPN1LA6NDY0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PABPN1LA6NDY0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms